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J-GLOBAL ID：201702257673859124   整理番号：17A0658903

Clostridium cellulolyticum由来のエキソセルラーゼCelFによる基質認識のシミュレーション研究【Powered by NICT】

Simulation studies of substrate recognition by the exocellulase CelF from Clostridium cellulolyticum

著者 (4件)： Chen Mo (Department of Food Science, Cornell University, Ithaca, New York, 14853) ,  Himmel Michael E. (Biosciences Center, National Renewable Energy Laboratory, Golden, Colorado) ,  Wilson David B. (Department of Molecular Biology and Genetics, Cornell University, Ithaca, New York) ,  Brady John W. (Department of Food Science, Cornell University, Ithaca, New York, 14853. [e-mail])
資料名： Biotechnology and Bioengineering  (Biotechnology and Bioengineering)
巻： 113  号： 7  ページ： 1433-1440  発行年： 2016年 
JST資料番号： D0019A  ISSN： 0006-3592  CODEN： BIBIAU  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 分子動力学(MD)シミュレーションは,Clostridium cellulolyticum由来のファミリー48エキソセルラーゼCelFによる基質認識を研究するために用いた。はこの酵素の活性部位トンネルの入口周辺の残基はセルロース単量体繰り返し単位,β-D-グルコピラノースの親和性を介して基質を認識し,結合するのに役立つかもしれないと仮定した。シミュレーションは,β-D-グルコピラノースの濃厚溶液に囲まれたこの酵素の触媒ドメインを行った,酵素に隣接した糖分子を発見するための完全な三次元確率分布は,軌道から計算した。活性部位トンネルの入口でTrp310とTrp312の平面面に対する積層糖を発見大きな可能性が観察された。Copyright 2017 Wiley Publishing Japan K.K. All Rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【Powered by NICT】

シソーラス用語： 三次元 ,  *基質 ,  分子動力学 ,  確率分布 ,  単量体 ,  酵素 ,  活性部位 ,  親和性 ,  *シミュレーション
準シソーラス用語： 触媒ドメイン ,  濃厚溶液 ,  *基質認識 ,  *Clostridium cellulolyticum ,  残基 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 酵素機構 ,  酵素加水分解 ,  MDシミュレーション ,  基質認識 ,  基質結合 ,  セルラーゼ

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  酵素の応用関連  (EB09100B)

物質索引 (1件)： β-D-グルコピラノース

タイトルに関連する用語 (4件)： Clostridium ,  基質認識 ,  シミュレーション ,  研究