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J-GLOBAL ID：201502210245022187   整理番号：15A0937331

フラグメント伸長型タンパク質-化合物ドッキングのビームサーチによる高速化

Fast protein-ligand docking based on fragment extension using beam search

著者 (6件)： 小峰駿汰 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  石田貴士 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  秋山泰 (東京工大 大学院情報理工学研究科) ,  小峰駿汰 (東京工大) ,  石田貴士 (東京工大) ,  秋山泰 (東京工大)
資料名： 電子情報通信学会技術研究報告  (IEICE Technical Report (Institute of Electronics, Information and Communication Engineers))
巻： 115  号： 112(IBISML2015 1-26)  ページ： 293-300  発行年： 2015年06月16日 
JST資料番号： S0532B  ISSN： 0913-5685  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： タンパク質-化合物ドッキングシミュレーションは,標的となるタ...

シソーラス用語： タンパク質 ,...
準シソーラス用語： *リガンド【配位子】

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分類 (2件)： 分子構造  (EB03020Y) ,  医用情報処理  (JE15030Q)

引用文献 (15件)：

• Kuntz I.D., Blaney J.M. Oatley S.J., Langridge R., Ferrin] T.E.: "A geometric approach to macromoleculeligand interactions", Journal of Molecular Biology 161(2) pp.269-288, 1982.
• Sousa S.F., Fernandes P.A., Ramos M.J.: "Proteinligand docking: current status and future challenges" , Proteins Struct Funct Genet 65(1), pp.15-26, 2006.
• Zsoldos Z., Reid D., Simon A., Sadjad S.B., Johnson A.P.: "eHiTS: a new fast, exhaustive flexible ligand docking system", Journal of Molecular Graphics & Modelling 26(1), pp.198-212, 2007.
• Friesner R.A., Banks J.L., Murphy R.B., Halgren T.A., Klicic J.J., Mainz D.T., Repasky M.P., Knoll E.H., Shelley M., Perry J.K., Shaw D.E., Francis P., Shenkin P.S.: "Glide: a new approach for rapid, accurate docking and scoring. 1. Method and assessment of docking accuracy" , Journal of Medicinal Chemistry 47(7), pp.1739-1749, 2004.
• Jones G., Willett P., Glen R.C. Leach A.R., Taylor R.: "Development and Validation of a Genetic Algorithm for Flexible Docking", Journal of Molecular Biology 267(3), pp.727-748, 1997.

タイトルに関連する用語 (5件)： フラグメント ,  タンパク質 ,  ドッキング ,  ビームサーチ ,  高速化