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J-GLOBAL ID：201602204580902237   整理番号：16A0302909

日本の公的機関でのトウモロコシ(Zea mays L.)近交系の育種のためのゲノムワイドセレクションの予備研究として行われた制限関連DNAタグ配列(RAD-Seq)分析により発見されたゲノム全体にわたる分子多型

Genomewide Molecular Polymorphisms among Maize (Zea mays L.) Inbred Lines Found from Restriction-Associated DNA Tag Sequencing (RAD-Seq) Analysis as a Preliminary Study on ‘Genomewide Selection’ for Breeding by Japanese Public Sectors

著者 (6件)： TAMAKI Hiroyuki (NARO Inst. Livestock and Grassland Sci., Nasushiobara, JPN) ,  MITSUHASHI Shohei (NARO Inst. Livestock and Grassland Sci., Nasushiobara, JPN) ,  KUDOH Hiroshi (Kyoto Univ., Otsu, JPN) ,  NAGANO Atsushi J. (Kyoto Univ., Otsu, JPN) ,  NAGANO Atsushi J. (JST-PRESTO, Kawaguchi, JPN) ,  YASUGI Masaki (Kyoto Univ., Otsu, JPN)
資料名： 農業・食品産業技術総合研究機構畜産草地研究所研究報告  (Bulletin of NARO Institute of Livestock and Grassland Science)
号： 16  ページ： 1-9  発行年： 2016年03月 
JST資料番号： G0830B  ISSN： 1347-0825  CODEN： CSKKCS  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： トウモロコシ育種のためのゲノムワイドセレクションの導入を図る...

シソーラス用語： *トウモロコシ ,...
準シソーラス用語： RDA-Seq法 ,...

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分類 (3件)： トウモロコシ  (FC03034D) ,  作物育種一般  (FC02010K) ,  遺伝学研究法  (EC01020N)

引用文献 (15件)：

• Baird, N.A., Etter, P.D., Atwood, T.S., Currey, M.C., Shiver, A.L., Lewis, Z.A., Selker, E.U., Cresko, W.A. and Johnson, E.A. (2008). Rapid SNP discovery and genetic mapping using sequenced RAD markers, PLoS ONE, 3(10), e3376.
• Beissinger, T.M., Hirsch, C.N., Sekhon, R.S., Foerster, J.M., Johnson, J.M., Muttoni, G., Vaillancourt, B, Buell, C.R., Kaeppler, S.M. and de Leon, N. (2013). Marker density and read-depth for genotyping populations using genotyping-by- sequencing, Genetics, 193, 1073-1081.
• Bernardo, R. and Yu, J. (2007). Prospects for genomewide selection for quantitative traits in maize, Crop Sci., 47, 1082-1090.
• Chattopadhyay, B., Garg, K.M. and Ramakrishnan, U. (2014). Effect of diversity and missing data on genetic assignment with RAD-Seq markers, BMC Res. Notes, 7, 841.
• Bolger, A.M., Lohse, M. and Usadel, B. (2014). Trimmomatic: A flexible trimmer for Illumina Sequence Data, Bioinformatics, btu170.

タイトルに関連する用語 (14件)： 日本 ,  トウモロコシ ,  近交系 ,  育種 ,  研究 ,  制限 ,  DNA ,  タグ ,  RAD-seq ,  分析 ,  発見 ,  ゲノム ,  分子 ,  多型