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J-GLOBAL ID：201802232129662372   整理番号：18A0590437

クラウド上の分散GPU環境におけるタンパク質間相互作用予測計算フレームワークの開発

著者 (3件)： 山本悠生 (東京工大 情報理工学院) ,  大上雅史 (東京工大 情報理工学院) ,  秋山泰 (東京工大 情報理工学院)
資料名： 情報処理学会研究報告(Web)  (IPSJ Technical Report (Web))
巻： 2018  号： BIO-53  ページ： Vol.2018-BIO-53,No.8,1-8 (WEB ONLY)  発行年： 2018年03月02日 
JST資料番号： U0451A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： パブリッククラウドは必要な時に必要な分だけ計算資源を借りるこ...

シソーラス用語： *分子間相互作用 ,...
準シソーラス用語： GPUプログラミング ,...

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分類 (4件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  ディジタル計算機方式一般  (JC02010O) ,  専用演算制御装置  (JC04030Y) ,  計算機網  (JC03000K)

引用文献 (15件)：

• Lu, W., Jackson, J. and Barga, R.: AzureBlast: A Case Study of Developing Science Applications on the Cloud, Design, pp. 413-420 (online), DOI: 10.1145/1851476.1851537 (2010).
• Gunarathne, T., Wu, T. L., Choi, J. Y., Bae, S. H. and Qiu, J.: Cloud computing paradigms for pleasingly parallel biomedical applications, Concurrency Computation Practice and Experience, Vol. 23, No. 17, pp. 2338-2354 (online), DOI: 10.1002/cpe.1780 (2011).
• Ekanayake, J., Gunarathne, T. and Qiu, J.: Cloud technologies for bioinformatics applications, IEEE Transactions on Parallel and Distributed Systems, Vol. 22, No. 6, pp. 998-1011 (online), DOI: 10.1109/TPDS.2010.178 (2011).
• Mrozek, D., Malysiak-Mrozek, B. and K??ski, A. K.: Cloud4Psi: Cloud computing for 3D protein structure similarity searching, Bioinformatics, Vol. 30, No. 19, pp. 2822-2825 (online), DOI: 10.1093/bioinformatics/btu389 (2014).
• Mrozek, D., Gosk, P. and Ma lysiak-Mrozek, B.: Scaling Ab Initio Predictions of 3D Protein Structures in Microsoft Azure Cloud, Journal of Grid Computing, Vol. 13, No. 4, pp. 561-585 (online), DOI: 10.1007/s10723-015-9353-8 (2015).

タイトルに関連する用語 (8件)： クラウド ,  GPU ,  環境 ,  タンパク質間相互作用 ,  予測 ,  計算 ,  フレームワーク ,  開発