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J-GLOBAL ID：202002276262448711   整理番号：20A0760130

マルチノード・マルチGPU上での網羅的なタンパク質間相互作用予測の高速化

Acceleration of protein-protein interaction prediction on HPC environments with multiple computation nodes and multiple GPUs

著者 (4件)： 渡辺紘生 (東京工大) ,  渡辺紘生 (産業技術総合研 産総研・東工大実社会ビッグデータ活用オープンイノベーションラボラトリ) ,  大上雅史 (東京工大) ,  秋山泰 (東京工大)
資料名： 情報処理学会研究報告(Web)  (IPSJ Technical Report (Web))
巻： 2020  号： BIO-61  ページ： Vol.2020-BIO-61,No.3,1-8 (WEB ONLY)  発行年： 2020年03月05日 
JST資料番号： U0451A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 生命現象の解明や医薬品設計の高速化へ貢献するため,我々は網羅...

シソーラス用語： *分子間相互作用 ,...
準シソーラス用語： チャンク ,...

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分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

引用文献 (12件)：

• U. Stelzl et al. A human protein-protein interaction network: A resource for annotating the proteome. Cell, Vol. 122, No. 6, pp. 957-968, 2005.
• T. Oltersdorf et al. An inhibitor of bcl-2 family proteins induces regression of solid tumours. Nature, Vol. 435, No. 7042, pp. 677-681, 2005.
• G. M. Popowicz et al. Structures of low molecular weight inhibitors bound to mdmx and mdm2 reveal new approaches for p53-mdmx/mdm2 antagonist drug discovery. Cell Cycle, Vol. 9, No. 6, pp. 1104-1111, 2010.
• A. Bateman et al. UniProt: The universal protein knowledgebase. Nucleic Acids Research, Vol. 45, No. D1, pp. D158-D169, 2017.
• R. Chen, L. Li, Z. Weng. ZDOCK: An initial-stage protein-docking algorithm. Proteins, Vol. 52, No. 1, pp. 80-87, 2003.

タイトルに関連する用語 (6件)： マルチ ,  ノード ,  GPU ,  タンパク質間相互作用 ,  予測 ,  高速化