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J-GLOBAL ID：202202262873733678   整理番号：22A0191672

柔軟性蛋白質ドッキングを用いた結合自由エネルギーと運動速度の計算

Calculation of Binding Free Energy and Kinetic Rates with Flexible Protein Docking

著者 (2件)： TRAN Duy Phuoc (School of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology) ,  KITAO Akio (School of Life Science and Technology, Tokyo Institute of Technology)
資料名： 生物物理(Web)
巻： 61  号： 6  ページ： 398-399(J-STAGE)  発行年： 2021年 
JST資料番号： U0689A  ISSN： 1347-4219  CODEN： SEBUAL  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ・天然変性ペプチド/タンパク質複合体のような高柔軟性分子の結...

シソーラス用語： 自由エネルギー ,...
準シソーラス用語： Markov連鎖モデル ,...

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分類 (2件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  計算機シミュレーション  (JE11000H)

引用文献 (7件)：

• 1) Lelievre, T. et al. (2010) Free Energy Computations. Imperial College Press. DOI: 10.1142/p579.
• 2) Zhou, G. et al. (2017) Biophys. J. 113, 785-793. DOI: 10.1016/j.bpj.2017.07.009.
• 3) Harada, R., Kitao, A. (2013) J. Chem. Phys. 139, 035103. DOI: 10.1063/1.4813023.
• 4) Tran, P. D. et al. (2018) J. Chem. Theory Comput. 13, 404-407. DOI: 10.1021/acs.jctc.7b00504.
• 5) Tran, P. D., Kitao, A. (2018) J. Phys. Chem. B 123, 2469-2478. DOI: 10.1021/acs.jpcb.8b10309.

タイトルに関連する用語 (4件)： 蛋白質ドッキング ,  結合自由エネルギー ,  運動速度 ,  計算