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J-GLOBAL ID：202202283112243927   整理番号：22A2045179

タンパク質構造解析システムAlphaFoldの実行時ファイルステージングを用いた高速化

著者 (4件)： 大沢泰生 (東京工大) ,  遠藤敏夫 (東京工大 学術国際情報セ) ,  遠藤敏夫 (東京工大) ,  野村哲弘 (東京工大 学術国際情報セ)
資料名： 情報処理学会研究報告(Web)  (IPSJ Technical Report (Web))
巻： 2022  号： HPC-185  ページ： Vol.2022-HPC-185,No.22,1-6 (WEB ONLY)  発行年： 2022年07月20日 
JST資料番号： U0451A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： スーパーコンピュータ上でビッグデータアプリケーションの実行時...

シソーラス用語： *高速化 ,...
準シソーラス用語： 大規模データベース

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分類 (1件)： 分子構造  (EB03020Y)

引用文献 (9件)：

• Jumper, J., Evans, R., Pritzel, A., Green, T., Figurnov, M., Ronneberger, O., Tunyasuvunakool, K., Bates, R., Žídek, A., Potapenko, A. et al.: Highly accurate protein structure prediction with AlphaFold, Nature, Vol. 596, No. 7873, pp. 583-589 (2021).
• Finn, R. D., Clements, J. and Eddy, S. R.: HMMER web server: interactive sequence similarity searching, Nucleic acids research, Vol. 39, No. suppl 2, pp. W29-W37 (2011).
• Steinegger, M., Meier, M., Mirdita, M., Vöhringer, H., Haunsberger, S. J. and Söding, J.: HH-suite3 for fast remote homology detection and deep protein annotation, BMC bioinformatics, Vol. 20, No. 1, pp. 1-15 (2019).
• OpenSFS and EOFS: Lustre, https://www.lustre.org/.
• 藤田隼斗,野村哲弘,遠藤敏夫,関嶋政和: タンパク質立体構造予測システムAlphaFoldのTSUBAME3.0上での高速化, 情報処理学会研究報告, 2022-HPC-183, No. 3, pp.1-7 (2022).

タイトルに関連する用語 (4件)： タンパク質構造 ,  解析システム ,  ファイル ,  高速化