小田真由美

オダマユミ | Oda Mayumi

所属機関・部署：
職名：専任講師

研究分野 (4件)：消化器内科学 , 獣医学 , ゲノム生物学 , システムゲノム科学

研究キーワード (14件)： ATAC-seq , クロマチン・アクセシビリティ , DNAメチル化 , エピゲノム , 細胞分化 , エピジェネティクス , 発生再生 , 細胞種特異的発現調節 , ゲノム , バイオインフォマティクス , 幹細胞生物学 , 転写因子 , 初期発生 , リプログラミング

競争的資金等の研究課題 (11件)：

2023 - 2027 成体細胞の柔軟な機能維持に関わる包括的メカニズムの解明
2018 - 2022 DNA脱メチル化動的制御による心筋細胞特異的核内構造の構築と病態発生機構の解明
2017 - 2020 組織幹細胞の維持・若返りを可能にする新規分子メカニズム
2015 - 2017 Gene body領域エピゲノムのモニタリングによる細胞成熟誘導法の最適化
2014 - 2017 mTOR signaling・紫外線・抗酸化剤に着目した近視進行抑制効果の比較

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論文 (39件)：

Toshiki Ebisudani, Junko Hamamoto, Kazuhiro Togasaki, Akifumi Mitsuishi, Kai Sugihara, Taro Shinozaki, Takahiro Fukushima, Kenta Kawasaki, Takashi Seino, Mayumi Oda, et al. Genotype-phenotype mapping of a patient-derived lung cancer organoid biobank identifies NKX2-1-defined Wnt dependency in lung adenocarcinoma. Cell reports. 2023. 42. 3. 112212-112212
Keiko Ishikawa, Shinya Sugimoto, Mayumi Oda, Masayuki Fujii, Sirirat Takahashi, Yuki Ohta, Ai Takano, Kazuhiro Ishimaru, Mami Matano, Kosuke Yoshida, et al. Identification of Quiescent LGR5⁺ Stem Cells in the Human Colon. Gastroenterology. 2022. 163. 5. 1391-1406.e24
Koichi Murakami, Daisuke Kurotaki, Wataru Kawase, Shunsuke Soma, Yumi Fukuchi, Hiroyoshi Kunimoto, Ryusuke Yoshimi, Shuhei Koide, Motohiko Oshima, Takako Hishiki, et al. OGT Regulates Hematopoietic Stem Cell Maintenance via PINK1-Dependent Mitophagy. Cell reports. 2021. 34. 1. 108579-108579
Yuhki Nakatake, Shigeru B H Ko, Alexei A Sharov, Shunichi Wakabayashi, Miyako Murakami, Miki Sakota, Nana Chikazawa, Chiaki Ookura, Saeko Sato, Noriko Ito, et al. Generation and Profiling of 2,135 Human ESC Lines for the Systematic Analyses of Cell States Perturbed by Inducing Single Transcription Factors. Cell reports. 2020. 31. 7. 107655-107655
Nanae Tsuchida, Junya Kojima, Atsushi Fukuda, Mayumi Oda, Tomoyuki Kawasaki, Hiroe Ito, Naoaki Kuji, Keiichi Isaka, Hirotaka Nishi, Akihiro Umezawa, et al. Transcriptomic features of trophoblast lineage cells derived from human induced pluripotent stem cells treated with BMP 4. Placenta. 2020. 89. 20-32

MISC (50件)：

Mayumi Oda, Yoshiko Hatano, Toshiro Sato. Intestinal epithelial organoids: regeneration and maintenance of the intestinal epithelium. Current opinion in genetics & development. 2022. 76. 101977-101977
小田真由美. ゲノムの非コード重要領域を探る : ATAC-seqが拡げるクロマチンアクセシビリティ解析の可能性. 遺伝子医学 = Gene & medicine. 2022. 12. 3. 122-127
小田真由美. 細胞成熟に関与する細胞特異的なゲノム配列的特徴とエピジェネティック状態. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
小田真由美. エピジェネティクス今昔:新しい解像度へ. JSBi Bioinformatics Review. 2021. 2. 1. 7-14
小田真由美, 小田真由美. 心筋細胞成熟のGene body領域エピジェネティクスとスプライシング制御. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2019. 42nd

特許 (2件)：

軽度認知障害の検出方法
体細胞から肺胞上皮細胞への分化用試薬及びその使用

講演・口頭発表等 (1件)：

「クローン動物由来の胎盤栄養膜幹細胞」
(日本畜産学会第104回大会シンポジウム 2005)

学位 (1件)：

博士(獣医学) (東京大学)

経歴 (5件)：

2023/04 - 現在慶應義塾大学医学部医化学教室専任講師
2021/04 - 2023/03 慶應義塾大学医学部坂口光洋記念講座(オルガノイド医学) 特任講師
2018/07 - 2020/03 慶應義塾大学医学部特任講師
2012/07 - 2018/06 慶應義塾大学医学部坂口光洋記念講座(システム医学) 助教
2010/04 - 2012/06 慶應義塾大学医学部総合医科学研究センター特任助教

受賞 (2件)：

2004/08 - Society for Study of Reproduction Trainee Research Poster Competition The first place
2004/08 - Society for Study of Reproduction Lalor Foundation Travel Fellow

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