- 2018/04 - 現在 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJセンター長
- 2013/11 - 現在 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 教授
- 2013/04 - 現在 特定国立研究開発法人理化学研究所 環境資源科学研究センター チームリーダー
- 2010/04 - 2013/10 東京大学 理学系研究科 生物化学専攻 准教授
- 2006/11 - 2013/03 理化学研究所 植物科学研究センター 副グループディレクター
- 2003/04 - 2010/03 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 助/准教授
- 2001/04 - 2003/03 産業技術総合研究所 生命情報科学研究センター 任期付研究員
- 1999/04 - 2001/03 工業技術院 電子技術総合研究所 任期付研究員
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