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J-GLOBAL ID：200902232221986210   整理番号：09A0345527

ガラクト-N-ビオース/ラクト-N-ビオースIホスホリラーゼの結晶構造 TIMバレルスカホールドの大きな変形

The Crystal Structure of Galacto-N-biose/Lacto-N-biose I Phosphorylase A LARGE DEFORMATION OF A TIM BARREL SCAFFOLD

著者 (7件)： HIDAKA Masafumi (Univ. Tokyo, Tokyo) ,  HIDAKA Masafumi (National Agriculture and Food Res. Organization, Ibaraki, JPN) ,  NISHIMOTO Mamoru (National Agriculture and Food Res. Organization, Ibaraki, JPN) ,  KITAOKA Motomitsu (National Agriculture and Food Res. Organization, Ibaraki, JPN) ,  WAKAGI Takayoshi (Univ. Tokyo, Tokyo) ,  SHOUN Hirofumi (Univ. Tokyo, Tokyo) ,  FUSHINOBU Shinya (Univ. Tokyo, Tokyo)
資料名： Journal of Biological Chemistry  (Journal of Biological Chemistry)
巻： 284  号： 11  ページ： 7273-7283  発行年： 2009年03月13日 
JST資料番号： E0038A  ISSN： 0021-9258  CODEN： JBCHA3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 腸内細菌Bifidobacterium longumの腸内生育を可能としているガラクトビオース/ラクトビオースホスホリラーゼ(GLNBP)の部位特異変異体を大腸菌で発現し,異なる基質結合状態で結晶構造をX線解析した。分子モデルではその三次構造はグリコシドヒドロラーゼ112ファミリーに属し,基質複合体の構造より病原性腸内細菌との類似性,ガラクトビオース及びラクトビオースに対する特異性などを明らかにした。触媒ドメインのTIMバレル折畳みは変形しており,高温菌由来β-ガラクトシダーゼとの類似性を認めた。SO₄^2-,NO₃^-などのアニオン結合によりバレルの立体配座は大きく変化し,GLNBPの基質適応的構造柔軟性を示唆した。

シソーラス用語： *グルコシルトランスフェラーゼ ,  腸内微生物 ,  *β-ガラクトシダーゼ ,  立体配座 ,  活性部位 ,  酵素基質複合体 ,  結晶構造 ,  アミノ酸配列 ,  相同性 ,  部位特異的変異誘発 ,  分子モデル ,  *ビフィズス菌
準シソーラス用語： *Bifidobacterium ,  *Bifidobacterium longum ,  *ガラクトビオースホスホリラーゼ ,  バレル構造 ,  *ラクトビオースホスホリラーゼ

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

タイトルに関連する用語 (6件)： ラクト-N-ビオース ,  ラクト-N-ビオースI ,  ホスホリラーゼ ,  結晶構造 ,  バレル ,  スカホールド