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J-GLOBAL ID：200902244400730685   整理番号：09A0056713

Corynebacterium glutamicum由来LldDの構造および機能特性:L-乳酸と糖利用に関与する転写抑制因子

Structural and functional characterization of the LldR from Corynebacterium glutamicum: a transcriptional repressor involved in L-lactate and sugar utilization

著者 (9件)： GAO Yong-Gui (Hokkaido Univ., Sapporo) ,  SUZUKI Hiroaki (Tokyo Inst. of Technol., Yokohama) ,  ITOU Hiroshi (National Inst. of Genetics, Shizuoka, JPN) ,  ZHOU Yong (Hokkaido Univ., Sapporo) ,  TANAKA Yoshikazu (Hokkaido Univ., Sapporo) ,  WACHI Masaaki (Tokyo Inst. of Technol., Yokohama) ,  WATANABE Nobuhisa (Hokkaido Univ., Sapporo) ,  TANAKA Isao (Hokkaido Univ., Sapporo) ,  YAO Min (Hokkaido Univ., Sapporo)
資料名： Nucleic Acids Research  (Nucleic Acids Research)
巻： 36  号： 22  ページ： 7110-7123  発行年： 2008年 
JST資料番号： D0242C  ISSN： 0305-1048  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Corynebacterium glutamicum由来LldD(CGL2951)は,アミノ酸代謝に関連する酸化物質の調節に典型的に関与する,GntRファミリーに属する転写因子である。この研究で,LldRの結晶構造を2.05Å分解能で決定した。その構造は,FadR(脂肪酸応答性転写因子)のそれに似ているN-とC-ドメインから成るが,別個のドメイン配向を取る。LldRとFadR二量体は,転写因子の二量体構築において最初に観察された,ドメイン交換によって類似構造を獲得する。調節ドメインにおけるZn²⁺結合の構造特性も,またFabRサブファミリーとの違いとして観察された。DNAマイクロアレイとDNアーゼIフットプリント分析は,L-乳酸と果糖/ショ糖利用に不可欠である,cgl2917-lldDとcgl1934-fruK-ptsFオペロンを調節する抑制因子として,LldRが作用する,ことを示唆した。さらに,LldRとDNAの化学量論および親和性を,等温滴定熱量測定によって決定した。cgl2917-lldDオペロン上のLldRの転写開始部位と抑制を,プライマー伸長法によって解析した。変異実験は,残基Lys4,Arg32,Arg42,Gly63が,DNA結合に重要である,ことを示した。

シソーラス用語： *転写因子 ,  X線構造解析 ,  アミノ酸代謝 ,  *結晶構造 ,  二量体 ,  アミノ酸配列 ,  DNA結合タンパク質 ,  プロモーター領域 ,  オペロン ,  乳酸デヒドロゲナーゼ ,  化学量論 ,  フットプリント法 ,  親和性 ,  オリゴヌクレオチド ,  ヌクレオチド配列 ,  温度滴定 ,  結合部位 ,  脂肪酸 ,  DNAマイクロアレイ ,  パーミアーゼ ,  タンパク質 ,  二糖類 ,  ピラノシド ,  フラノシド ,  グルコシド ,  フルクトオリゴ糖 ,  ヘキソース ,  ケトース ,  Corynebacterium glutamicum ,  L-乳酸デヒドロゲナーゼ ,  亜鉛イオン ,  突然変異タンパク質 ,  配列アライメント ,  コリネバクテリウム属 ,  デオキシリボヌクレアーゼI ,  オリゴデオキシヌクレオチド ,  *リプレッサー ,  微生物
準シソーラス用語： Corynebacterium ,  DNアーゼ1 ,  FadR蛋白質 ,  *LldR蛋白質 ,  オリゴDNA ,  *転写抑制因子

分類 (1件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N)

物質索引 (2件)： シュクロース ,  フルクトース

タイトルに関連する用語 (5件)： Corynebacterium ,  機能特性 ,  L-乳酸 ,  糖 ,  転写抑制因子