特許
J-GLOBAL ID:200903098685140301
微生物識別方法、微生物識別装置、微生物識別用データベースの作成方法および微生物識別プログラムを記録した記録媒体
発明者:
出願人/特許権者:
,
代理人 (1件):
福島 祥人
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2000-099482
公開番号(公開出願番号):特開2001-275700
出願日: 2000年03月31日
公開日(公表日): 2001年10月09日
要約:
【要約】【課題】 微生物群を構成する複数の微生物を同時にかつ容易に識別することが可能な微生物識別方法、微生物識別装置および微生物識別用データベースの作成方法および微生物識別プログラムを記録した記録媒体を提供することである。【解決手段】 微生物識別方法は、SSC-PCR法により微生物の解析実験を行うステップS1と、解析実験により得られた電気泳動像を取り込むステップS2と、画像データからバンドを検出するステップS3と、画像補正を行うステップS4と、バンドの位置および強度を測定するステップS5と、測定結果をまとめてバンドデータの一欄を作成するステップS6と、これを用いてデータベース検索を行うステップS7と、結果を表示するステップS8とから構成される。
請求項(抜粋):
識別対象となる微生物を識別する微生物識別方法であって、増幅確率の異なる複数のプライマーを準備し、前記複数のプライマーの各々を用いて、識別対象となる微生物のDNAに対し、熱変成工程、プライマーのアニーリング工程およびポリメラーゼによる伸長反応工程をこの順序で繰り返し行うポリメラーゼ連鎖反応法を一度に適用することにより、前記識別対象となる微生物のDNAのDNA断片を増幅するステップと、前記複数のプライマーの各々を用いて増幅されたDNA断片に対して電気泳動法を適用し、各プライマーに対応する電気泳動像を得るステップと、各プライマーに対応する前記電気泳動像を画像データに変換するステップと、前記画像データに基づいて各プライマーに対応する前記電気泳動像のバンドを検出するステップと、前記画像データに基づいて各プライマーに対応する前記電気泳動像における前記検出されたバンドの位置および強度に関する情報を求めるステップと、前記複数のプライマーと前記バンドの位置および強度に関する情報との対応関係を求めるステップと、照合対象となる微生物についての前記対応関係が予め記憶されたデータベースを検索し、前記識別対象となる微生物について求められた前記対応関係と前記照合対象となる微生物についての前記対応関係との相関関係を求めるステップと、前記相関関係に基づいて前記識別対象となる微生物を識別するステップとを備えたことを特徴とする微生物識別方法。
IPC (5件):
C12Q 1/68
, C12M 1/00
, C12M 1/34
, C12N 15/09 ZNA
, G06F 17/30 170
FI (5件):
C12Q 1/68 A
, C12M 1/00 A
, C12M 1/34 B
, G06F 17/30 170 F
, C12N 15/00 ZNA A
Fターム (21件):
4B024AA11
, 4B024AA17
, 4B024CA01
, 4B024CA09
, 4B024HA12
, 4B029AA07
, 4B029AA23
, 4B029FA03
, 4B063QA01
, 4B063QA18
, 4B063QQ05
, 4B063QQ42
, 4B063QR32
, 4B063QR62
, 4B063QS16
, 4B063QS25
, 4B063QS36
, 4B063QX02
, 5B075PQ02
, 5B075PQ46
, 5B075UU19
引用特許:
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