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J-GLOBAL ID：201002254271714801   整理番号：10A0943991

CUDAを用いたGROMACSの高速化

Evaluation of Loop Transformation methods with CUDA

著者 (3件)： 畑典子 (奈良女大 大学院人間文化研究科) ,  高田雅美 (奈良女大 大学院人間文化研究科) ,  城和貴 (奈良女大 大学院人間文化研究科)
資料名： 情報処理学会研究報告(CD-ROM)
巻： 2010  号： 2  ページ： ROMBUNNO.MPS-79,10  発行年： 2010年08月15日 
JST資料番号： Z0031C  ISSN： 2186-2583  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 本稿では,GPUのための最適化を施すことによるGROMACSの性能改良について述べる。その最適化にはCUDAを用いる。GPUを用いたGROMACSの実行については,GROMACS-OpenMMが既に開発されている。しかしながら,ベンチマークの結果,GROMACS-OpenMMによる実行した際,CPUのみでGROMACSを実行した時と比べ,ほとんど実行時間が変わらないシミュレーションや,むしろ遅くなるシミュレーションも存在する。そこで,GROMACS-OpenMMの改良を行う。GROMACSは大規模なプログラムである。そこで,本稿では,関数やメモリアクセスの最適化に焦点を当てる。(著者抄録)

シソーラス用語： マイクロプロセッサ ,  *専用プロセッサ ,  *プログラミング環境 ,  最適化 ,  ベンチマーク ,  性能評価 ,  プログラム実行 ,  計算機シミュレーション ,  大規模系 ,  計算機プログラム
準シソーラス用語： *CUDA ,  *GPU【専用プロセッサ】 ,  GROMACS

分類 (2件)： 専用演算制御装置  (JC04030Y) ,  計算機システム開発  (JD02010R)

タイトルに関連する用語 (3件)： CUDA ,  GROMACS ,  高速化