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J-GLOBAL ID：201002292795907932   整理番号：10A1248234

ホスホケトラーゼの結晶構造: チアミン二リン酸依存的脱水機構

Crystal Structures of Phosphoketolase THIAMINE DIPHOSPHATE-DEPENDENT DEHYDRATION MECHANISM

著者 (8件)： SUZUKI Ryuichiro (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  KATAYAMA Takane (Ishikawa Prefectural Univ., Ishikawa, JPN) ,  KIM Byung-Jun (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  WAKAGI Takayoshi (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  SHOUN Hirofumi (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  ASHIDA Hisashi (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  YAMAMOTO Kenji (Kyoto Univ., Kyoto, JPN) ,  FUSHINOBU Shinya (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN)
資料名： Journal of Biological Chemistry  (Journal of Biological Chemistry)
巻： 285  号： 44  ページ： 34279-34287  発行年： 2010年10月29日 
JST資料番号： E0038A  ISSN： 0021-9258  CODEN： JBCHA3  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 他のチアミン二リン酸(ThDP)依存的酵素とは違って反応に脱水段階を有し,二重基質特異性を有するBifidobacterium breve(Bb)のThDP依存的ホスホケトラーゼ(XFPK)の結晶構造解析を行った。結晶化は基質キシロース5-リン酸あるいはフルクトース6-リン酸存在下で行った。それぞれの基質に対する脱水前および脱水後の中間体の立体構造を決定し,安定した中間体としてリン酸非存在下で2-アセチル-ThDPが蓄積することを示した。変異体に対する結晶構造解析から,二段階に起こる脱水機構およびリン酸による求核攻撃の機構およびそれらの反応に寄与するアミノ酸残基を推定することができた。また,BbXFPKの活性部位におけるThDPは,他のThDP依存的酵素では見られない三環系リングを形成していることが分かった。

シソーラス用語： *アルデヒドリアーゼ ,  結晶構造 ,  *脱水反応 ,  酵素反応機構 ,  求核反応 ,  活性部位 ,  アミノ酸残基 ,  *ビフィズス菌 ,  *Bifidobacterium breve ,  *微生物 ,  *放線菌目 ,  *放線菌科
準シソーラス用語： *Bifidobacterium ,  *ホスホケトラーゼ

分類 (1件)： 酵素一般  (EB09010D)

物質索引 (1件)： チアミン二りん酸

タイトルに関連する用語 (3件)： 結晶構造 ,  チアミン二リン酸 ,  脱水