菊池誠

キクチマコト | Kikuchi Macoto

所属機関・部署：
職名：教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：

大阪大学大学院理学研究科教授

ホームページURL (1件)： http://www.cp.cmc.osaka-u.ac.jp/~kikuchi

研究分野 (2件)：生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 , 数理物理、物性基礎

研究キーワード (15件)：遺伝子制御ネットワーク , レアイベントサンプリング , 分子モーター , 臨界現象 , タンパク質フォールディング , 自由エネルギー景観 , 拡張アンサンブル , 高分子 , 生物物理 , 自由エネルギー構造 , 計算物理 , 分子機械 , 交通流 , タンパク質 , 計算機シミュレーション

競争的資金等の研究課題 (16件)：

2015 - 2019 ファネル気体モデルによる細胞内混み合い環境下でのタンパク質複合体形成
2009 - 2014 計算科学による核内タンパク質天然変性状態の構造多型解析
2008 - 2010 交通流および自己駆動粒子系の流動機構の解明
2005 - 2006 進化的に獲得された相空間ランドスケープについての理論的研究
2003 - 2005 交通流の動的性質-実測データ解析とシミュレーション-

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論文 (127件)：

菊池誠. 遺伝子制御ネットワークの変異に対する頑健性と双安定性の進化の定量評価:レアイベントサンプリングの手法. 生物物理. 2022. 62. 6. 360-364
Tadamune Kaneko, Macoto Kikuchi. Evolution enhances mutational robustness and suppresses the emergence of a new phenotype: A new computational approach for studying evolution. PLOS Computational Biology. 2022. 18. 1. e1009796-e1009796
Shintaro Nagata, Macoto Kikuchi. Emergence of cooperative bistability and robustness of gene regulatory networks. PLOS Computational Biology. 2020. 16. 6. e1007969-e1007969
A.Nakayama, M.Kikuchi, A.Shibata, Y.Sugiyama, S.Tadaki, S.Yukawa. Scaling from Circuit Experiment to Real Traffic Based on Optimal Velocity Model. Traffic and Granular Flow '15. 2016. 523-530
Shin-ichi Tadaki, Macoto Kikuchi, Akihiro Nakayama, Akihiro Shibata, Yuki Sugiyama, Satoshi Yukawa. Characterizing and distinguishing free and jammed traffic flows from the distribution and correlation of experimental speed data. NEW JOURNAL OF PHYSICS. 2016. 18. 83022

MISC (157件)：

菊池誠. スーパーコンピューティングコンテスト2021. 数学セミナー. 2022. 61. 1. 43-47
Macoto Kikuchi, Yoshikatsu Tada, Nobu C. Shirai. Funnel GAS Model for Protein Many-Body Systems under the Crowded Environment. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2018. 114. 3. 200A-200A
Nobu C. Shirai, Macoto Kikuchi. The Interplay of Intrinsic Disorder and Macromolecular Crowding on alpha-Synuclein Fibril Formation. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2016. 110. 3. 552A-552A
Macoto Kikuchi, Ryo Kanada, Fumiko Takagi. Allosterically Regulated Structural Fluctuation and Microtubule-Binding Affinity of KiF1A-A Simulation Study of Coarse-Grained Model -. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2016. 110. 3. 459A-459A
松下勝義, 杉原秀理, 菊池誠, 能川知昭, 佐々木志剛. 30aPS-107 結合と折りたたみの共起におけるエネルギー地形のファネル化の検証(30aPS 領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理・化学物理・生物物理)). 日本物理学会講演概要集. 2014. 69. 1. 425-425

書籍 (12件)：

福島の甲状腺検査と過剰診断 : 子どもたちのために何ができるか
あけび書房 2021 ISBN:9784871541909
子どもを守るために知っておきたいこと : 各分野の専門家が伝える
星海社,講談社 (発売) 2019 ISBN:9784065151617
信じちゃいけない身のまわりのカガク : あなたはそれで、本当に健康になれますか?
立東舎,リットーミュージック (発売) 2017 ISBN:9784845629978
いちから聞きたい放射線のほんとう : いま知っておきたい22の話
筑摩書房 2014 ISBN:9784480860798
もうダマされないための「科学」講義
光文社 2011 ISBN:9784334036447

講演・口頭発表等 (5件)：

Phenotype Selection due to Mutational Robustness in a Model of Gene Regulatory Networks
(2023)
Non-equilibrity of evolution revealed by multicanonical ensemble method: Phenotype selection due to mutational robustness in gene regulatory networks
(2023)
Genotypic entropy and bias in evolution of gene regulatory networks
(2023)
Phenotype Selection Due To Mutational Robustness: A Computational Study
(2023)
Use of Multicanonical Monte Carlo Method for Exploring Mutational Robustness of Gene Regulatory Network
(2022)

学位 (1件)：

理学博士

経歴 (6件)：

2000/04 - 2024/03 大阪大学サイバーメディアセンター教授
2000/01 - 2000/03 大阪大学大学院理学研究科教授
1996/04 - 1999/12 大阪大学大学院理学研究科助教授
1993/08 - 1996/03 大阪大学理学部助教授
1987/02 - 1993/07 大阪大学理学部助手

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受賞 (2件)：

2023/03 - 日本経済新聞社第10回星新一賞優秀賞
2008/04 - 文部科学省文部科学大臣表彰・科学技術賞(理解増進部門)

所属学会 (2件)：

日本SF作家クラブ , 日本物理学会

※　J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。登録・更新については、こちらをご覧ください。

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