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J-GLOBAL ID：201202229482544210   整理番号：12A0396180

ピロシークエンシングcDNA配列のde novoアセンブリによるBotryococcus brauniiの油に富む品種A株(BOT-88-2)のトランスクリプトーム解析

Transcriptome analysis of an oil-rich race A strain of Botryococcus braunii (BOT-88-2) by de novo assembly of pyrosequencing cDNA reads

著者 (5件)： BABA Masato (Graduate School of Life and Environment Sciences, Univ. of Tsukuba, Tennoudai 1-1-1, Tsukuba, Ibaraki 305-8572, JPN) ,  IOKI Motohide (Center for Environmental Biology and Ecosystem Studies, National Inst. for Environmental Studies, Onogawa 16-2 ...) ,  NAKAJIMA Nobuyoshi (Center for Environmental Biology and Ecosystem Studies, National Inst. for Environmental Studies, Onogawa 16-2 ...) ,  SHIRAIWA Yoshihiro (Graduate School of Life and Environment Sciences, Univ. of Tsukuba, Tennoudai 1-1-1, Tsukuba, Ibaraki 305-8572, JPN) ,  WATANABE Makoto M. (Graduate School of Life and Environment Sciences, Univ. of Tsukuba, Tennoudai 1-1-1, Tsukuba, Ibaraki 305-8572, JPN)
資料名： Bioresource Technology  (Bioresource Technology)
巻： 109  ページ： 282-286  発行年： 2012年04月 
JST資料番号： A0390B  ISSN： 0960-8524  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 油生産藻類Botryococcus brauniiの遺伝情報を得るために,高油生産性を示す代表品種A株(株BOT-88-2)に対するピロシークエンシングにより185936相補的DNA(cDNA)配列の新規なデータセットを得た。29038非冗長配列を読み出すためにcDNA配列を組み立て,それらの964にデータベース配列の類似性に基づいて首尾良く注釈を付けた。トランスクリプトームデータは,不飽和極長鎖脂肪酸の生合成に関与する酵素の大部分に対する候補遺伝子を受け入れた。トランスクリプトームデータセットはGenBank/EMBL/DDBJデータセットに預けられた。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

シソーラス用語： *遺伝学実験技術 ,  *トランスクリプトーム ,  *Botryococcus ,  緑藻類 ,  遺伝情報 ,  *cDNA ,  生合成 ,  ヌクレオチド配列 ,  炭化水素 ,  脂肪酸
準シソーラス用語： *Botryococcus braunii ,  EST配列 ,  *ピロシークエンシング ,  極長鎖脂肪酸 ,  *相補的DNA

分類 (2件)： 生物燃料及び廃棄物燃料  (LB02020Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

タイトルに関連する用語 (9件)： ピロシークエンシング ,  cDNA配列 ,  アセンブリ ,  Botryococcus ,  油 ,  品種 ,  株 ,  BOT ,  トランスクリプトーム解析