ピロシークエンシングcDNA配列のde novoアセンブリによるBotryococcus brauniiの油に富む品種B株(BOT-22)のトランスクリプトーム解析

IOKI Motohide; BABA Masato; NAKAJIMA Nobuyoshi; NAKAJIMA Nobuyoshi; SHIRAIWA Yoshihiro; WATANABE Makoto M.

文献

J-GLOBAL ID：201202263316795275 整理番号：12A0396182

ピロシークエンシングcDNA配列のde novoアセンブリによるBotryococcus brauniiの油に富む品種B株(BOT-22)のトランスクリプトーム解析

Transcriptome analysis of an oil-rich race B strain of Botryococcus braunii (BOT-22) by de novo assembly of pyrosequencing cDNA reads

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資料名：
巻： 109 ページ： 292-296 発行年： 2012年04月
JST資料番号： A0390B ISSN： 0960-8524 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：短報発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

Botryococcus braunii品種Bにおけるbotryococcene油の生合成に対する遺伝学的洞察を得るために,209429相補的DNA配列から組み立てた27427非冗長配列を含むBOT-22株のトランスクリプトームデータセットをハイスループット454シークエンシングを経て得た。遺伝子産物の比較的信頼のおける予測が以前に特性付けられているデータベース配列への相同性に基づいた725非冗長配列に対して実行可能である。botryococcene油生合成に関して,非メバロン酸イソプレノイド生合成経路と関連していると推定される遺伝子を読み出す一方メバロン酸経路に関する遺伝子は見出されなかったが,これはbotryococceneがB.brauniiにおける非メバロン酸経路を通して生合成されることを示唆している。全てのトランスクリプトーム配列はGenBank/EMBL/DDBJデータセットに預けられた。Copyright 2012 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.

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生物燃料及び廃棄物燃料 , 遺伝子の構造と化学

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