高スループットゲノムとプロテオーム解析を使用したTrichoderma reeseiでのセルロース,ソホロースおよびグルコースの比較代謝

CASTRO Lilian dos Santos; PEDERSOLI Wellington Ramos; ANTONIETO Amanda Cristina C.; STEINDORFF Andrei Stecca; SILVA-ROCHA Rafael; MARTINEZ-ROSSI Nilce M; ROSSI Antonio; BROWN Neil Andrew; GOLDMAN Gustavo H; FACA Vitor M; PERSINOTI Gabriela F; SILVA Roberto Nascimento

文献

J-GLOBAL ID：201402255411315894 整理番号：14A1021481

高スループットゲノムとプロテオーム解析を使用したTrichoderma reeseiでのセルロース,ソホロースおよびグルコースの比較代謝

Comparative metabolism of cellulose, sophorose and glucose in Trichoderma reesei using high-throughput genomic and proteomic analyses

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資料名：
巻： 7 号： Mar ページ： 7:41 (WEB ONLY) 発行年： 2014年03月
JST資料番号： U7022A ISSN： 1754-6834 資料種別：逐次刊行物 (A)
記事区分：原著論文発行国：イギリス (GBR) 言語：英語 (EN)

糸状菌Trichoderma reeseiはバイオエタノール産業が利用するリグノセルロース分解酵素の主な産生菌である。しかし,工業的規模で低コストの第二世代バイオエタノール生産を達成するためには,加水分解酵素の効率的な混合物が植物バイオマスの分解に必要とされる。本研究では,セルロース,ソホロースおよびグルコースにおける増殖時のリグノセルロース分解酵素産生菌T.reeseiの分子的基礎を研究した。唯一の炭素源としてセルロース,ソホロースまたはグルコースで増殖したT.reesei のトランスクリプトームと差次的セクレトーム(2D-DIGE)を調べ比較した。厳しいカットオフ閾値を適用することによって2060の遺伝子が各炭素源の少なくともひとつで差次的に発現されるものとして同定された。差次的に発現された遺伝子の階層的クラスタリングは,セルロースによって制御される123の遺伝子,ソホロースによって制御される154の遺伝子およびグルコースによって制御される402の遺伝子を表す3つの可能なレギュロンを同定した。セルロースとソホロース間で差次的に発現される692の遺伝子の遺伝子調節ネットワーク解析はソホロースとセルロース中での増殖に特異的であるものとしてそれぞれ75と107のみの遺伝子を同定した。2D-DIGE解析はソホロースに限定される30の蛋白質およびセルロースに限定される37の蛋白質を同定した。転写と分泌蛋白質プロファイル間で70.17%の相関を得た。著者らのデータは,セルロースまたはソホロースのいずれかに特異的に応答する異なる炭素源,輸送体,転写因子およびCAZymesで分泌される非触媒的機能を有するアクセサリー蛋白質などのセルロース分解の新しいプレーヤを明らかにした。(翻訳著者抄録)

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微生物酵素の生産 , 生物燃料及び廃棄物燃料

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