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J-GLOBAL ID：201502215500105905   整理番号：15A0871760

WIPPER 大規模応用のための正確で効率的な圃場表現型検査プラットホーム

WIPPER: an accurate and efficient field phenotyping platform for large-scale applications

著者 (9件)： UTSUSHI Hiroe (Iwate Biotechnology Res. Center) ,  ABE Akira (Iwate Biotechnology Res. Center) ,  TAMIRU Muluneh (Iwate Biotechnology Res. Center) ,  OGASAWARA Yumiko (Iwate Biotechnology Res. Center) ,  OBARA Tsutomu (Iwate Biotechnology Res. Center) ,  SATO Emiko (Iwate Biotechnology Res. Center) ,  OCHIAI Yusuke (Iwate Biotechnology Res. Center) ,  TERAUCHI Ryohei (Iwate Biotechnology Res. Center) ,  TAKAGI Hiroki (Iwate Biotechnology Res. Center)
資料名： Breeding Science  (Breeding Science)
巻： 65  号： 3  ページ： 285-289 (J-STAGE)  発行年： 2015年 
JST資料番号： Y0311B  ISSN： 1344-7610  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 育種と遺伝的解析の促進のために,ハイスループット遺伝子型解析の最近の進歩に適合した正確,迅速で簡便な表現型検査ツールが求められている。野帳への従来のデータ記録と解析のためのコンピュータへのデータ入力は,非能率的で時間を要し,ヒューマンエラーが起こりやすい。ここでは,ブルートゥースコミュニケーションを用いた圃場表現型検査とデータ記録を組み合わせた新しい表現型検査プラットホームのWIPPER(Wireless Plant Phenotyper)について報告する。これにより,圃場データの記録だけでなく,コンピュータへのデータ入力の時間と労力を節減できる。加えて,表現型検査とデータ入力に関わるヒューマンエラーのリスクを排除できる。イネ組換え近交系(RIL)100個体の葉幅と相対クロロフィル含量(SPAD値)の測定に,WIPPERを適用した。そして,従来のデータ収集法に比べて短時間で正確なデータを記録できた。現在,作物育種における表現型データ,種子とDNAに関する情報の記録作成などのイネ生殖質の日常的な管理にWIPPERを利用している。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： *イネ ,  *表現型 ,  *葉 ,  形態 ,  濃度 ,  クロロフィル ,  データ収集 ,  ヒューマンエラー ,  計算機システム ,  作物育種 ,  クロロフィル含量 ,  SPAD値 ,  組換近交系 ,  プラットフォーム【計算機】

分類 (2件)： 稲作  (FC03020C) ,  植物学一般  (EH01010R)

引用文献 (15件)：

• Abe, A., S. Kosugi, K. Yoshida, S. Natsume, H. Takagi, H. Kanzaki, H. Matsumura, K. Yoshida, C. Mitsuoka, M. Tamiru et al. (2012) Genome sequencing reveals agronomically important loci in rice using MutMap. Nat. Biotechnol. 30: 174-178.
• Akhunov, E., C. Nicolet and J. Dvorak (2009) Single nucleotide polymorphism genotyping in polyploid wheat with the Illumina GoldenGate assay. Theor. Appl. Genet. 119: 507-517.
• Buckler, E.S., J.B. Holland, P.J. Bradbury, C.B. Acharya, P.J. Brown, C. Browne, E. Ersoz, S. Flint-Garcia, A. Garcia, J.C. Glaubitz et al. (2009) The genetic architecture of maize flowering time. Science 325: 714-718.
• Bylesjö, M., V. Segura, R.Y. Soolanayakanahally, A.M. Rae, J. Trygg, P. Gustafsson, S. Jansson and N.R. Street (2008) LAMINA: a tool for rapid quantification of leaf size and shape parameters. BMC Plant Biol. 8: 82.
• Cavanagh, C., M. Morell, L. Mackay and W. Powell (2008) From mutations to MAGIC: resources for gene discovery, validation and delivery in crop plants. Curr. Opin. Plant Biol. 11: 215-221.

タイトルに関連する用語 (6件)： 大規模 ,  応用 ,  圃場 ,  表現 ,  型検査 ,  プラットホーム