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J-GLOBAL ID：201602233121467896   整理番号：16A0453768

脊椎動物ゲノム・トランスクリプトームアセンブリ完全度を評価する

著者 (1件)： 原雄一郎 (理研 ライフサイエンス技術基盤研究セ)
資料名： バイオサイエンスとインダストリー  (B & I)
巻： 74  号： 3  ページ： 228-230  発行年： 2016年05月10日 
JST資料番号： G0089A  ISSN： 0914-8981  CODEN： BIDSE6  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 解説  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 脊椎動物および硬骨魚は,祖先におけるゲノム重複,鳥類の祖先に...

シソーラス用語： *トランスクリプトーム ,...
準シソーラス用語： ソメワケササクレヤモリ ,...

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分類 (2件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  進化論一般  (EC03010Q)

引用文献 (4件)：

• Parra, G. et al.: Assessing the gene space in draft genomes, Nucleic Acids Res., 37, 289 297 (2009)
• Hara, Y. et al.: Optimizing and benchmarking de novo transcriptome sequencing: from library preparation to assembly evaluation, BMC Genomics, 16, 977 (2015)
• Simão, F. et al.: BUSCO: assessing genome assembly and annotation completeness with single-copy orthologs, Bioinformatics, 31, 3210 3212 (2015)
• 原 雄一郎:どのアセンブリを使うか?:分子系統学的観点に基づくアセンブリの評価,日本進化学会ニュース,17(1), 23~29(2016)

タイトルに関連する用語 (2件)： 脊椎動物 ,  評価