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J-GLOBAL ID：201702230115297047   整理番号：17A1749575

センキュウにおける抗血栓活性成分の計算機バーチャルスクリーニング研究【JST・京大機械翻訳】

Study on the Computer Virtual Screening of Antithrombotic Active Ingredients in Chuanxiong Rhizoma

著者 (3件)： Liu Fuhe (浙江医薬高等専科学校薬学院,浙江寧波,315100) ,  Chen Shaojun (浙江医薬高等専科学校薬学院,浙江寧波,315100) ,  Ni Wenjuan (浙江医薬高等専科学校薬学院,浙江寧波,315100)
資料名： Zhongguo Yaofang  (Zhongguo Yaofang)
巻： 28  号： 16  ページ： 2182-2196  発行年： 2017年 
JST資料番号： C3688A  ISSN： 1001-0408  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 中国 (CHN)  言語： 中国語 (ZH)

抄録/ポイント： 目的;コンピュータ支援薬物設計を用いて、センキュウの抗血栓活性成分を探索した。方法;「血栓症」をキーワードとし、治療標的タンパク質データベースから、センキュウ抗血栓標的タンパク質を検索し、スクリーニングした。次に,蛋白質データベースから標的蛋白質を検索し,その三次元構造をダウンロードし,蛋白質前処理ツールを用いて,活性領域の中心座標を決定した。PyRxとDiscovery Studio Visualizerソフトウェアを用いて、台湾漢方薬データベースからダウンロードされた247個のセンキュウ小分子と標的タンパク質を分子ドッキングし、結合を通じて活性成分をスクリーニングし、結合作用力を分析した。結果;4つの活性成分,すなわち,新しいクロロゲン酸,1-H-ベンゾイミダゾール-2-アミン,3,8-ジヒドロキシラクトン,テトラメチルトリテルペンをスクリーニングし,トロンビン,抗トロンビンIII,凝固因子Xa,血栓調節蛋白質と高い結合活性を示した。結合エネルギーは,それぞれ,-6.1,-4.5,-7.7,-8.6kJ/molであった。分析結果により、ファンデルワールス力、静電相互作用力はドッキングにおいて重要な役割を果たしていることが分かった。結論;新しいクロロゲン酸,1-H-ベンゾイミダゾール-2-アミン,3,8-ジヒドロキシラクトン,センキュウトリテルペンは,漢方薬の抗血栓活性成分である可能性がある。Data from Wanfang. Translated by JST【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  結合エネルギー ,  漢方製剤 ,  タンパク質 ,  van der Waals力 ,  トロンビン ,  活性部位 ,  *血栓症 ,  ソフトウェア ,  治療法 ,  オレフィン化合物 ,  多価フェノール ,  不飽和カルボン酸 ,  脂環式アルコール ,  カルボン酸エステル ,  ヒドロキシ酸 ,  ポリオール
準シソーラス用語： 分子ドッキング ,  三次元構造 ,  標的蛋白質 ,  *有効成分 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： Thrombogenesis ,  Chuanxiong rhizoma ,  Computer aided drug design ,  Virtual screening ,  Target protein ,  Molecular docking ,  Active ingredients

分類 (4件)： 蛋白質・ペプチド一般  (EB03010N) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  生化学的分析法  (EA03030G) ,  標識化合物  (CB10050N)

物質索引 (1件)： クロロゲン酸

タイトルに関連する用語 (6件)： センキュウ ,  血栓 ,  活性成分 ,  計算機 ,  バーチャルスクリーニング ,  研究