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J-GLOBAL ID：201702237954137081   整理番号：17A0342093

正確な5′末端を持つヒト長鎖ノンコーディングRNAのアトラス

An atlas of human long non-coding RNAs with accurate 5′ ends

著者 (54件)： HON Chung-Chau (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  RAMILOWSKI Jordan A. (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  HARSHBARGER Jayson (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  SEVERIN Jessica (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  LIZIO Marina (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  KAWAJI Hideya (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  KASUKAWA Takeya (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  ITOH Masayoshi (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  BURROUGHS A. Maxwell (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  NOMA Shohei (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  YIP Chi-Wai (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  ABUGESSAISA Imad (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  MENDEZ Mickaeel (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  HASEGAWA Akira (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  TANG Dave (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  LASSMANN Timo (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  HEUTINK Peter (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  SUZUKI Harukazu (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  DAUB Carsten O. (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  DE HOON Michiel J. L. (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  ARNER Erik (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  CARNINCI Piero (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  FORREST Alistair R. R. (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  BERTIN Nicolas (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  HAYASHIZAKI Yoshihide (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  BERTIN Nicolas (National Univ. Singapore, Singapore, SGP) ,  RACKHAM Owen J. L. (Univ. Bristol, Bristol, GBR) ,  GOUGH Julian (Univ. Bristol, Bristol, GBR) ,  RACKHAM Owen J. L. (Duke-NUS Medical School, Singapore) ,  DENISENKO Elena (Massey Univ. Auckland, Albany, NZL) ,  SCHMEIER Sebastian (Massey Univ. Auckland, Albany, NZL) ,  POULSEN Thomas M. (National Inst. of Advanced Industrial Sci. and Technol. (AIST), Ibaraki, JPN) ,  KAWAJI Hideya (RIKEN, Saitama, JPN) ,  ITOH Masayoshi (RIKEN, Saitama, JPN) ,  HAYASHIZAKI Yoshihide (RIKEN, Saitama, JPN) ,  BURROUGHS A. Maxwell (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  DJEBALI Sarah (Barcelona Inst. of Sci. and Technol., Barcelona, ESP) ,  DJEBALI Sarah (Universitat Pompeu Fabra (UPF), Barcelona, ESP) ,  ALAM Tanvir (King Abdullah Univ. Sci. and Technol. (KAUST), Thuwal, SAU) ,  MEDVEDEVA Yulia A. (Res. Center of Biotechnology, RAS, Moscow, RUS) ,  MEDVEDEVA Yulia A. (Vavilov Inst. of General Genetic, RAS, Moscow, RUS) ,  TESTA Alison C. (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  FORREST Alistair R. R. (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  LIPOVICH Leonard (Wayne State Univ., Michigan, USA) ,  TANG Dave (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  LASSMANN Timo (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  HEUTINK Peter (German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE), Tuebingen, DEU) ,  BABINA Magda (Charite Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  WELLS Christine A. (Univ. Queensland, Brisbane, AUS) ,  WELLS Christine A. (Univ. Melbourne, AUS) ,  KOJIMA Soichi (RIKEN, Saitama, JPN) ,  NAKAMURA Yukio (RIKEN, Ibaraki, JPN) ,  NAKAMURA Yukio (Univ. Tsukuba, Ibaraki, JPN) ,  DAUB Carsten O. (Karolinska Institutet, Huddinge, SWE)
資料名： Nature (London)  (Nature (London))
巻： 543  号： 7644  ページ： 199-204  発行年： 2017年03月09日 
JST資料番号： D0193B  ISSN： 0028-0836  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 長鎖ノンコーディングRNA(lncRNA)には多種多様なものが含まれており,機能が明らかになっていないものが多い。今回我々は,FANTOM5プロジェクトで取得したCAGE(cap analysis of gene expression)データと,多数の転写産物より得られたデータを統合し,包括的なヒトlncRNAアトラスを作製した。これには,信頼度の高い5′末端を持つ2万7919種のヒトlncRNA遺伝子構造と,ヒトの主要な細胞種や組織に由来する1829試料における発現プロファイルが記載されている。ゲノムおよびエピジェネティクスの観点より分類すると,タンパク質コード遺伝子の間に位置するlncRNAのほとんどは,プロモーターではなくエンハンサーから生じることが明らかになった。遺伝的関連データや発現データとの統合的解析により,形質と関連する一塩基多型領域に位置するlncRNAは,その形質に関係する細胞種に特異的に発現することが示され,この結果は,これらlncRNAが疾患に関与することを示唆している。さらに,メッセンジャーRNAの発現量的形質座位(eQTL)に関連する一塩基多型領域に位置するlncRNAは,対応するメッセンジャーRNAと共発現することが明らかになり,これらのlncRNAが転写調節に役割を担う可能性を示唆している。進化的保存性に関するデータと組み合わせることで,ヒトゲノム内には1万9175種の機能的と考えられるlncRNAが存在することが明らかになった。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： ヒト ,  *RNA【核酸】 ,  遺伝子ライブラリー ,  地図 ,  分子構造 ,  *遺伝子発現 ,  エンハンサー領域 ,  *一塩基多型 ,  量的形質遺伝子座 ,  分子進化 ,  遺伝子構造 ,  転写産物 ,  転写調節 ,  遺伝子発現調整 ,  CAGE法 ,  発現量的形質遺伝子座 ,  *非翻訳長鎖RNA ,  遺伝子プロファイル ,  *分子遺伝現象 ,  遺伝
準シソーラス用語： 遺伝的調節 ,  CAGEライブラリー ,  eQTL ,  アトラス ,  *lncRNA ,  発現プロファイル

分類 (3件)： 核酸一般  (EB04010U) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  進化論一般  (EC03010Q)

タイトルに関連する用語 (3件)： ヒト ,  長鎖ノンコーディングRNA ,  アトラス