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J-GLOBAL ID：201702257494313632   整理番号：17A0483927

画期的な農畜産物作出のためのゲノム情報データベースの整備 第1章 データベースの改良,運用 2 総合DBシステム開発(2)ブラウザの開発

著者 (5件)： 宮尾安藝雄 (農業生物資源研) ,  沼寿隆 (農業生物資源研) ,  前田英郎 (農業・食品産業技術総合研究機構) ,  春原嘉弘 (農業・食品産業技術総合研究機構) ,  後藤明俊 (農業・食品産業技術総合研究機構)
資料名： 農林水産省農林水産技術会議事務局研究成果  (農林水産技術会議事務局研究成果)
号： 570  ページ： 9-11  発行年： 2017年03月31日 
JST資料番号： S0070A  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： イネ品種・特性データベースに512系統の系譜情報を新たに追加し,375品種について詳細情報の編集を行った。イネ品種・特性データベースに登録されている品種のゲノムを閲覧できるブラウザを構築した。(著者抄録)

シソーラス用語： 農作物 ,  *畜産物 ,  遺伝情報 ,  *データベース ,  開発 ,  *ブラウザ ,  *農産物 ,  ゲノム情報 ,  システム開発

分類 (2件)： システム設計・解析  (IA02030D) ,  ドキュメンテーション  (FA01020I)

引用文献 (5件)：

• イネ品種・特性データベース.http://ineweb.narcc.affrc.go.jp/(参照日:2016.3.31).
• Li H. and Durbin R. (2009) Fast and accurate short read alignment with Burrows-Wheeler transform. Bioinformatics 25 (14): 1754-1760.
• Kawahara Y. et al. (2013) Improvement of the Oryza sativa Nipponbare reference genome using next generation sequence and optical map data. Rice 6 (1): 4.
• Li H., Handsaker B., Wysoker A., Fennell T., Ruan J., Homer N., Marth G., Abecasis G. and Durbin R. (2009) The Sequence Alignment/Map format and SAMtools. Bioinformatics 25 (16): 2078-2079.
• Kumagai M., Kim J., Itoh R. and Itoh T. (2013) TASUKE: a web-based visualization program for large-scale resequencing data. Bioinformatics 29 (14): 1806-1808.

タイトルに関連する用語 (10件)： 畜産物 ,  ゲノム ,  情報データベース ,  整備 ,  データベース ,  運用 ,  総合 ,  Db ,  開発 ,  ブラウザ