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J-GLOBAL ID：201702267263543800   整理番号：17A1109340

ヒトおよびマウスのmiRNAおよびそのプロモーターの総合的発現アトラス

An integrated expression atlas of miRNAs and their promoters in human and mouse

著者 (89件)： DE RIE Derek (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  ABUGESSAISA Imad (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  ARNER Erik (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  BERTIN Nicolas (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  BURROUGHS A Maxwell (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  DAUB Carsten O (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  DEVIATIIAROV Ruslan (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  FORT Alexandre (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  HARSHBARGER Jayson (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  HASEGAWA Akira (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  HASHIMOTO Kosuke (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  HON Chung Chau (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  ISHIZU Yuri (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  KASUKAWA Takeya (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  LASSMANN Timo (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  LIZIO Marina (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  NOMA Shohei (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  SEVERIN Jessica (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  SHIN Jay W (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  TARUI Hiroshi (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  YASUZAWA Kayoko (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  KAWAJI Hideya (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  CARNINCI Piero (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  FORREST Alistair R R (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  DE HOON Michiel J L (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  DE RIE Derek (VU Univ. Amsterdam, Amsterdam, NLD) ,  ALAM Tanvir (King Abdullah Univ. Sci. and Technol. (KAUST), Thuwal, SAU) ,  ASHOOR Haitham (King Abdullah Univ. Sci. and Technol. (KAUST), Thuwal, SAU) ,  HAYASHIZAKI Yoshihide (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  ARNER Peter (Karolinska Univ. Hospital, Huddinge, SWE) ,  ASTROEM Gaby (Karolinska Univ. Hospital, Huddinge, SWE) ,  MEJHERT Niklas (Karolinska Univ. Hospital, Huddinge, SWE) ,  BABINA Magda (Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  GUHL Sven (Universitaetsmedizin Berlin, Berlin, DEU) ,  BERTIN Nicolas (National Univ. Singapore, Singapore) ,  BURROUGHS A Maxwell (National Inst. of Health, Maryland, USA) ,  CARLISLE Ailsa J (Univ. Edinburgh, Edinburgh, GBR) ,  SUMMERS Kim M (Univ. Edinburgh, Edinburgh, GBR) ,  DETMAR Michael (Swiss Federal Inst. of Technol. (ETH) Zuerich, Zuerich, CHE) ,  ROUDNICKY Filip (Swiss Federal Inst. of Technol. (ETH) Zuerich, Zuerich, CHE) ,  DEVIATIIAROV Ruslan (Kazan Federal Univ., Kazan, RUS) ,  GEBHARD Claudia (Univ. Hospital Regensburg, Regensburg, DEU) ,  REHLI Michael (Univ. Hospital Regensburg, Regensburg, DEU) ,  GEBHARD Claudia (Regensburg Centre for Interventional Immunology (RCI), Regensburg, DEU) ,  REHLI Michael (Regensburg Centre for Interventional Immunology (RCI), Regensburg, DEU) ,  GOLDOWITZ Daniel (Univ. British Columbia, British Columbia, CAN) ,  HA Thomas J (Univ. British Columbia, British Columbia, CAN) ,  LECELLIER Charles-Henri (Univ. British Columbia, British Columbia, CAN) ,  MATHELIER Anthony (Univ. British Columbia, British Columbia, CAN) ,  ZHANG Peter G (Univ. British Columbia, British Columbia, CAN) ,  HERLYN Meenhard (Wistar Inst., Pennsylvania, USA) ,  SWOBODA Rolf K (Wistar Inst., Pennsylvania, USA) ,  HEUTINK Peter (German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE), Tuebingen, DEU) ,  RIZZU Patrizia (German Center for Neurodegenerative Diseases (DZNE), Tuebingen, DEU) ,  HITCHENS Kelly J (Univ. Queensland, Queensland, AUS) ,  HUANG Edward (Univ. Melbourne, Victoria, AUS) ,  WELLS Christine A (Univ. Melbourne, Victoria, AUS) ,  HUANG Edward (Walter and Eliza Hall Inst. of Medical Res., Victoria, AUS) ,  WELLS Christine A (Walter and Eliza Hall Inst. of Medical Res., Victoria, AUS) ,  KAI Chieko (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  SATO Hiroki (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  YONEDA Misako (Univ. Tokyo, Tokyo, JPN) ,  KLINKEN Peter (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  WINTERINGHAM Louise (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  FORREST Alistair R R (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  LASSMANN Timo (Univ. Western Australia, Western Australia, AUS) ,  LECELLIER Charles-Henri (Inst. of Molecular Genetics of Montpellier, Montpellier, FRA) ,  LEE Weonju (Kyungpook National Univ. School of Medicine, Daegu, KOR) ,  MAKEEV Vsevolod (Vavilov Inst. of General Genetics, Russian Acad. of Sci., Moscow, RUS) ,  MEDVEDEVA Yulia A (Vavilov Inst. of General Genetics, Russian Acad. of Sci., Moscow, RUS) ,  MAKEEV Vsevolod (Engelhardt Inst. of Molecular Biology, Russian Acad. of Sci., Moscow, RUS) ,  MAKEEV Vsevolod (Moscow Inst. of Physics and Technol., Dolgoprudny, RUS) ,  MEDVEDEVA Yulia A (Inst. of Predictive and Personalized Medicine of Cancer, Badalona, ESP) ,  MEDVEDEVA Yulia A (Res. Center of Biotechnology, Moscow, RUS) ,  MUNGALL Christopher J (Lawrence Berkeley National Lab., California, USA) ,  OHSHIMA Mitsuhiro (Ohu Univ. School of Pharmaceutical Sci., Koriyama, JPN) ,  OKADA-HATAKEYAMA Mariko (Osaka Univ., Osaka, JPN) ,  OKADA-HATAKEYAMA Mariko (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  YUMOTO Noriko (RIKEN, Yokohama, JPN) ,  PERSSON Helena (Lund Univ., Lund, SWE) ,  SAETROM Pal (Norwegian Univ. Sci. and Technol., Trondheim, NOR) ,  TOYODA Hiroo (Tokyo Univ. Pharmacy and Life Sci., Tokyo, JPN) ,  VITTING-SEERUP Kristoffer (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  SANDELIN Albin (Univ. Copenhagen, Copenhagen, DNK) ,  YAMAGUCHI Yoko (Nihon Univ. School of Dentistry, Tokyo, JPN) ,  ZABIEROWSKI Susan (Sloan Kettering Inst., New York, USA) ,  SUMMERS Kim M (Univ. Queensland, Queensland, AUS) ,  KAWAJI Hideya (RIKEN, Wako, JPN) ,  HAYASHIZAKI Yoshihide (RIKEN, Wako, JPN)
資料名： Nature Biotechnology  (Nature Biotechnology)
巻： 35  号： 9  ページ： 872-878  発行年： 2017年09月 
JST資料番号： H0870A  ISSN： 1087-0156  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： マイクロRNA(miRNA)は短鎖非コードRNAであり,主として細胞制御を担う。我々は,FANTOM5(Functional Annotation of Mammalian Genome5)プロジェクトの一環として,ヒトRNAサンプル396点およびマウスRNAサンプル47点に由来するCAGE(Cap Analysis Gene Expression)法のデータと同じ492セットの短鎖RNA(sRNA)ライブラリーで高性能塩基配列解読を行い,miRNAおよびそのプロモーターの総合的発現アトラスを作製した。1357個のヒトmiRNAおよび804個のマウスmiRNAに関してプロモーターが見つかり,種間で強い配列保存が認められた。さらに,初期miRNAのレベルと成熟miRNAのレベルは相関していて,合計1829セットのヒトCAGEライブラリーおよび1029セットのマウスCAGEライブラリーで,成熟miRNAレベルの代替値として初期miRNA測定値が利用可能であることが分かった。以上により,初代哺乳類細胞のmiRNA発現およびプロモーターに関する広範囲のアトラスが作製され,miRNA発現パターンおよび転写制御領域の詳細な解析の基盤が確立された。Copyright Nature Japan KK 2017

シソーラス用語： *アンチセンスRNA ,  *プロモーター領域 ,  *遺伝子発現 ,  ヒト ,  マウス ,  遺伝子ライブラリー ,  RNA【核酸】 ,  種差 ,  初代培養 ,  CAGE法 ,  ゲノム解読 ,  転写調節 ,  遺伝子発現調整 ,  *マイクロRNA ,  低分子RNA ,  *分子遺伝現象 ,  ネズミ亜目 ,  遺伝
準シソーラス用語： 遺伝的調節 ,  *miRNA ,  sRNA

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒト ,  マウス ,  miRNA ,  プロモーター ,  発現 ,  アトラス