研究者
J-GLOBAL ID:201801006061159734   更新日: 2024年12月16日

水口 賢司

ミズグチ ケンジ | Mizuguchi Kenji
所属機関・部署:
職名: 教授
ホームページURL (1件): https://mizuguchilab.org
研究分野 (2件): システムゲノム科学 ,  生命、健康、医療情報学
研究キーワード (11件): 計算生物学 ,  創薬科学 ,  タンパク質構造 ,  タンパク質相互作用 ,  ネットワーク生物学 ,  疾患生物学 ,  データ統合 ,  データベース ,  機械学習 ,  オミックス ,  医薬品設計
競争的資金等の研究課題 (22件):
  • 2022 - 2025 静的局所環境の学習によるタンパク質動的構造情報の抽出
  • 2020 - 2023 人工エクソソームに封入したRNAアプタマーによる神経変性疾患治療法の開発
  • 2017 - 2020 データウェアハウスとシグナル伝達シミュレーションによる創薬標的予測能力の向上
  • 2017 - 2019 乳がんにおける休眠抑制因子群再活性化を利用した創薬研究
  • 2016 - 2019 乳がん細胞における新規エストロゲン受容体活性制御分子BIG3の病態機能の解明
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論文 (190件):
  • Bayu Ardiansah, Ahmad Farhan, Novita Sari Nurhasanah, Mochammad Arfin Fardiansyah Nasution, Noordini M. Salleh, Kenji Mizuguchi, Antonius Herry Cahyana, Lina Mardiana. Dual antioxidant and cytotoxic activities of novel 1,2,3-triazole-decorated unsymmetrical monocarbonyl curcumin analogs. Case Studies in Chemical and Environmental Engineering. 2025. 11. 101031-101031
  • Rikako Inoue, Koji Hosomi, Jonguk Park, Haruka Sakaue, Hitomi Yumioka, Hiroko Kamitani, Yoshiharu Kinugasa, Kaori Harano, A. Yasmin Syauki, Miki Doi, et al. Clinical Phenotypes Associated with the Gut Microbiome in Older Japanese People with Care Needs in a Nursing Home. Nutrients. 2024. 16. 22. 3839-3839
  • Satoko Maruyama, Tsubasa Matsuoka, Koji Hosomi, Jonguk Park, Haruka Murakami, Motohiko Miyachi, Hitoshi Kawashima, Kenji Mizuguchi, Toshiki Kobayashi, Tadao Ooka, et al. High barley intake in non-obese individuals is associated with high natto consumption and abundance of butyrate-producing bacteria in the gut: a cross-sectional study. Frontiers in Nutrition. 2024. 11
  • Suzumi Kageyama, Rikako Inoue, Koji Hosomi, Jonguk Park, Hitomi Yumioka, Miki Doi, Miyuu Miyake, Yuka Nagashio, Yoshiko Shibuya, Nobue Oka, et al. Association Between Gut Microbiome Composition and Physical Characteristics in Patients with Severe Motor and Intellectual Disabilities: Perspectives from Microbial Diversity. Nutrients. 2024. 16. 20. 3546-3546
  • Rodolfo S Allendes Osorio, Yuji Kosugi, Johan T Nyström-Persson, Kenji Mizuguchi, Yayoi Natsume-Kitatani. A modern multi-omics data exploration experience with Panomicon. Bioinformatics Advances. 2024
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MISC (59件):
  • Lokesh P. Tripathi, Rodolfo S. Allendes Osorio, Yoichi Murakami, Yi-An Chen, Kenji Mizuguchi. Network-Based Analysis for Biological Knowledge Discovery. Reference Module in Life Sciences. 2024
  • Hiroshi Komura, Reiko Watanabe, Kenji Mizuguchi. The Trends and Future Prospective of In Silico Models from the Viewpoint of ADME Evaluation in Drug Discovery. Pharmaceutics. 2023. 15. 11. 2619-2619
  • MARTIN, 渡邉怜子, 水口賢司. ナノ粒子をより安全に 設計するための新手法 --ナノ粒子の安全性に革命を: AI が拓く未来. 化学. 2023. 78. 11. 27-30
  • Yoichi Murakami, Kenji Mizuguchi. Recent developments of sequence-based prediction of protein-protein interactions. Biophysical reviews. 2022. 1-19
  • Masataka Kuroda, Reiko Watanabe, Tsuyoshi Esaki, Hitoshi Kawashima, Rikiya Ohashi, Tomohiro Sato, Teruki Honma, Hiroshi Komura, Kenji Mizuguchi. Utilizing public and private sector data to build better machine learning models for the prediction of pharmacokinetic parameters. Drug discovery today. 2022. 103339-103339
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特許 (3件):
書籍 (18件):
  • 健康と疾患を制御する精密栄養学 : 「何を、いつ、どう食べるか?」に、食品機能の解析と個人差を生む分子メカニズムの解明から迫る
    羊土社 2023 ISBN:9784758104111
  • ケモインフォマティクスにおけるデータ収集の最適化と解析手法
    技術情報協会 2023 ISBN:9784861049446
  • 革新的AI創薬 : 医療ビッグデータ、人工知能がもたらす創薬研究の未来像
    エヌ・ティー・エス 2022 ISBN:9784860437886
  • 創薬研究のための相互作用解析パーフェクト : 低中分子・抗体創薬におけるスクリーニング戦略と実例、in silico解析、一歩進んだ分析技術まで
    羊土社 2021 ISBN:9784758122566
  • Protein Interactions: Computational Methods, Analysis and Applications
    World Scientific 2020
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講演・口頭発表等 (133件):
  • 薬物動態の統合解析プラットフォームDruMAP
    (CBI学会2024年大会 2024)
  • 多面的モデリングの基礎としてのデータ統合ーAI創薬に向けて
    (CBI学会2024年大会 2024)
  • AI創薬とデータ統合
    (JASIS 2024 2024)
  • ナノ粒子の安全性予測
    (日本薬学会第144年会 2024)
  • AI創薬の基礎としてのデータ統合とキュレーション
    (第11回 OUバイオインフォマティクスセンターセミナー 2024)
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学歴 (3件):
  • 1992 - 1995 京都大学大学院 理学研究科 化学専攻博士課程
  • 1990 - 1992 京都大学大学院 理学研究科 化学専攻修士課程
  • 1986 - 1990 京都大学 理学部
学位 (1件):
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (9件):
  • 2019/10 - 現在 大阪大学 蛋白質研究所 教授
  • 2019/07 - 2024/03 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 AI健康・医薬研究センター センター長
  • 2013/05 - 2024/03 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 インシリコデザインプロジェクト プロジェクトリーダー(併任)
  • 2006/10 - 2021/08 国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所 バイオインフォマティクスプロジェクト プロジェクトリーダー
  • 2004/10 - 2006/09 ケンブリッジ大学 理論物理学及び応用数学科 講師
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委員歴 (16件):
  • 2021/04 - 現在 日本バイオインフォマティクス学会 幹事、第11回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2022)大会長
  • 2020/04 - 現在 日本学術振興会 R022 量子構造生物学委員会 学会委員
  • 2019/04 - 現在 日本メディカルAI学会 評議員
  • 2017 - 現在 ライフ インテリジェンス コンソーシアム(LINC) 副代表
  • 2014/04 - 現在 情報計算化学生物学会(CBI学会) 評議員
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受賞 (3件):
  • 2020/02 - 内閣府 第2回日本オープンイノベーション大賞 厚生労働大臣賞
  • 2000/06 - ウェルカムトラスト リサーチキャリアデベロップメントフェローシップ
  • 1996/10 - HFSP(ヒューマンフロンティア・サイエンス・プログラム) 長期フェローシップ
所属学会 (4件):
情報計算化学生物学会(CBI学会) ,  日本メディカルAI学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本生物物理学会
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