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J-GLOBAL ID：201802225674548179   整理番号：18A0965572

ブロモドメイン蛋白質4は前立腺および乳癌における疾患特異的感受性遺伝子座を含む組織特異的スーパーエンハンサーを識別する【JST・京大機械翻訳】

Bromodomain protein 4 discriminates tissue-specific super-enhancers containing disease-specific susceptibility loci in prostate and breast cancer

著者 (15件)： Zuber Verena (Prostate Cancer Research Group, Centre for Molecular Medicine Norway (NCMM), Nordic EMBL Partnership, Faculty of Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Zuber Verena (NORMENT, KG Jebsen Centre for Psychosis Research, Institute of Clinical Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Zuber Verena (Division of Mental Health and Addiction, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Zuber Verena (European Molecular Biology Laboratory, European Bioinformatics Institute, Wellcome Trust Genome Campus, Cambridge, UK) ,  Bettella Francesco (NORMENT, KG Jebsen Centre for Psychosis Research, Institute of Clinical Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Bettella Francesco (Division of Mental Health and Addiction, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Witoelar Aree (NORMENT, KG Jebsen Centre for Psychosis Research, Institute of Clinical Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Witoelar Aree (Division of Mental Health and Addiction, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Andreassen Ole A. (NORMENT, KG Jebsen Centre for Psychosis Research, Institute of Clinical Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Andreassen Ole A. (Division of Mental Health and Addiction, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Mills Ian G. (Prostate Cancer Research Group, Centre for Molecular Medicine Norway (NCMM), Nordic EMBL Partnership, Faculty of Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Mills Ian G. (Department of Molecular Oncology, Institute for Cancer Research, Oslo University Hospital, Oslo, Norway) ,  Mills Ian G. (PCUK Movember Centre of Excellence, CCRCB, Queen’s University, Belfast, UK) ,  Urbanucci Alfonso (Prostate Cancer Research Group, Centre for Molecular Medicine Norway (NCMM), Nordic EMBL Partnership, Faculty of Medicine, University of Oslo, Oslo, Norway) ,  Urbanucci Alfonso (Department of Molecular Oncology, Institute for Cancer Research, Oslo University Hospital, Oslo, Norway)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 270  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】遺伝的情報は,癌発生における機能的重要性の臨床的に関連するゲノム変異体一塩基多型(SNP)を同定するために使用することができる。スーパーエンハンサーは細胞特異的DNA要素であり,組織または細胞の同一性を決定し,腫瘍進行を駆動するために作用する。以前のアプローチは,調節DNAエレメントにおけるSNPに関連するリスクを説明するために試みられているが,蛋白質4(BRD4)およびスーパーエンハンサーを含むブロモドメインのような後成的読者は,SNPを注釈するために使用されていない。前立腺癌(PC)において,クロマチンに対するアンドロゲン受容体(AR)結合部位は,SNPの機能的アノテーションを知らせるために使用されてきた。【結果】著者らは,PCリスクSNPの最適組織特異的濃縮を達成するために,他の疾患および形質に適用可能なエンハンサーマッピングのための基準を確立した。層別化Q-QプロットとFisher試験を用いて,エンハンサーの特異的カテゴリーへのSNPマッピングの異なる濃縮を評価した。著者らは,BRD4が組織特異的エンハンサーの重要な判別であることを見出し,PC特異的リスク遺伝子座を捕捉するためにAR結合情報より強力であり,乳癌(BC)において類似の効果を用いることができ,統合失調症などの他の疾患に適用できることを示した。結論:これは,エンハンサー内のSNPに対するゲノムワイド関連研究における後成的読者の濃縮を評価する最初の研究であり,PCおよびBC遺伝的リスク遺伝子座の濃縮および優先順位付けのための強力なツールを提供する。著者らの研究は,ヒト表現型変異の分子機構を再定義するために使用できる他の病気と形質に適用できる原理を証明する。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： クロマチン ,  *遺伝 ,  発癌 ,  *タンパク質 ,  ゲノム ,  前立腺腫瘍 ,  *前立腺 ,  ヒト ,  一塩基多型 ,  DNA【核酸】 ,  結合部位 ,  アンドロゲン受容体 ,  *乳房腫瘍
準シソーラス用語： *ブロモドメイン ,  腫瘍進行 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (10件)： BRD4 ,  ゲノムワイド関連研究 ,  SNPs ,  機能注釈 ,  クロマチン ,  リスク遺伝子座 ,  前立腺癌リスク ,  乳癌リスク ,  分裂病 ,  スーパーエンハンサー

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  生物学的機能  (EB03040U)

引用文献 (40件)：

• Nucleic acids research; The NHGRI GWAS Catalog, a curated resource of SNP-trait associations; D Welter, J MacArthur, J Morales, T Burdett, P Hall, H Junkins, A Klemm, P Flicek, T Manolio, L Hindorff; 42; Database issue; 2014; D1001-1006; 10.1093/nar/gkt1229; CR1;
• Cell; Pooled ChIP-Seq Links Variation in Transcription Factor Binding to Complex Disease Risk; AK Tehranchi, M Myrthil, T Martin, BL Hie, D Golan, HB Fraser; 165; 3; 2016; 730-741; 10.1016/j.cell.2016.03.041; CR2;
• Science (New York, NY); Systematic localization of common disease-associated variation in regulatory DNA; MT Maurano, R Humbert, E Rynes, RE Thurman, E Haugen, H Wang, AP Reynolds, R Sandstrom, H Qu, J Brody; 337; 6099; 2012; 1190-1195; 10.1126/science.1222794; CR3;
• Coetzee SG, Shen HC, Hazelett DJ, Lawrenson K, Kuchenbaecker K, Tyrer J, Rhie SK, Levanon K, Karst A, Drapkin R et al.: Cell Type Specific Enrichment Of Risk Associated Regulatory Elements At Ovarian Cancer Susceptibility Loci. Human molecular genetics. 2015;24(13):3595-607.
• Bioessays; Functional interpretation of non-coding sequence variation: concepts and challenges; DS Paul, N Soranzo, S Beck; 36; 2; 2014; 191-199; 10.1002/bies.201300126; CR5;

タイトルに関連する用語 (9件)： ブロモドメイン蛋白質4 ,  前立腺 ,  乳癌 ,  疾患 ,  感受性 ,  遺伝子座 ,  組織 ,  スーパーエンハンサー ,  識別