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J-GLOBAL ID：201802236545464090   整理番号：18A1345007

ジャガイモトランスクリプトームに及ぼす有機農法の影響【JST・京大機械翻訳】

Influence of Organic Farming on the Potato Transcriptome

著者 (5件)： Pacifico Daniela (Council for Agricultural Research and Economics Analysis-Research Centre for Cereal and Industrial Crops (CREA-CI), Via di Corticella, 133, 40128 Bologna, Italy) ,  Onofri Chiara (Council for Agricultural Research and Economics Analysis-Research Centre for Cereal and Industrial Crops (CREA-CI), Via di Corticella, 133, 40128 Bologna, Italy) ,  Parisi Bruno (Council for Agricultural Research and Economics Analysis-Research Centre for Cereal and Industrial Crops (CREA-CI), Via di Corticella, 133, 40128 Bologna, Italy) ,  Ostano Paola (Cancer Genomics Laboratory, Fondazione Edo ed Elvo Tempia Valenta, Via Malta 3, 13900 Biella, Italy) ,  Mandolino Giuseppe (Council for Agricultural Research and Economics Analysis-Research Centre for Cereal and Industrial Crops (CREA-CI), Via di Corticella, 133, 40128 Bologna, Italy)
資料名： Sustainability (Web)  (Sustainability (Web))
巻： 9  号： 5  ページ： 779  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7281A  ISSN： 2071-1050  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 有機農業は,その潜在的な健康と環境利益に関する活発な議論をもたらす。比較研究は,標的化アプローチを通して,また限られた実験的研究の範囲内で,作物の有機農法への応答をしばしば調査する。この問題を明らかにするために,有機および慣行栽培下で2年間栽培されたジャガイモの品種のトランスクリプトームプロファイルを,南イタリアの同じ場所で1年間栽培された実験クローンのプロファイルと比較した。トランスクリプトームの生データをPotato Oligo Chip Initiative(POCI)マイクロアレイを通して得て,教師なし結合多変量統計解析と生物情報学(MapManソフトウェア)を用いて処理した。One-100-44遺伝子は両年において同じ発現を示し,113は両遺伝子型において同じ発現を示した。それらの機能的特性化により,有機塊茎(例えばフェニルプロパノイド,フラボノイド,グリコアルカラーゼ,アスパラギン,アスコルビン酸)の栄養的側面に関連する代謝における農業システムの強い関与を明らかにした。さらに,更なる研究は,42,034の特徴のうち8つが年と遺伝子型にかかわらず発現の同じ傾向を示し,それらをトレーサビリティのマーカーとして可能な候補とすることを示した。本論文は,有機管理における遺伝子型の選択と,塊茎代謝に及ぼす有機栽培の影響を研究するときの季節的条件効果の評価の関連性に関する問題を提起する。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 農業 ,  *ジャガイモ ,  統計解析 ,  遺伝子 ,  遺伝子型 ,  代謝 ,  栽培 ,  塊茎 ,  品種 ,  フラボノイド ,  ソフトウェア ,  *有機農法 ,  キャラクタリゼーション ,  *トランスクリプトーム ,  ラクトン ,  水溶性ビタミン ,  第二アルコール ,  ポリオール

著者キーワード (5件)： トレーサビリティ ,  POCI ,  従来の農業システム ,  Solanum tuberosum ,  マイクロアレイ

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

物質索引 (1件)： アスコルビン酸

引用文献 (32件)：

• FAO Statistical Pocketbook 2015. Available online: http://www.fao.org/3/a-i4691e.pdf (accessed on 4 April 2017). Organic Food Sales Growth in the United States from 2000 to 2015. Available online: https://www.statista.com/statistics/196962/organic-food-sales-growth-in-the-us-since-2000/ (accessed on 4 April 2017). Organic in Europe. Prospects and Developments 2016. IFOAM EU Group. Available online: https://shop.fibl.org/fileadmin/documents/shop/1708-organic-europe-2016.pdf (accessed on 8 May 2017).
• Pacifico, D.; Paris, R. Effect of Organic Potato Farming on Human and Environmental Health and Benefits from New Plant Breeding Techniques. Is It Only a Matter of Public Acceptance? Sustainability 2016, 8, 1054.
• Lu, C.; Hawkesford, M.J.; Barraclough, P.B.; Poulton, P.R.; Wilson, I.D.; Barker, G.L.; Edwards, K.J. Markedly different gene expression in wheat grown with organic or inorganic fertilizer. Proc. Biol. Sci. 2005, 272, 1901-1908.
• Maggio, A.; Carillo, P.; Bulmetti, G.S.; Fuggi, A.; Barbieri, G.; De Pascale, S. Potato yield and metabolic profiling under conventional and organic farming. Eur. J. Agron. 2008, 28, 343-350.
• Hoefkens, C.; Verbeke, W.; Aertsens, J.; Mondelaers, K.; Camp, J.V. The nutritional and toxicological value of organic vegetables. Br. Food J. 2009, 111, 1062-1077.

タイトルに関連する用語 (3件)： ジャガイモ ,  トランスクリプトーム ,  有機農法