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J-GLOBAL ID：201802275306321260   整理番号：18A0965693

Watercress(Nasturtium officinale R.Br.)におけるde novoトランスクリプトーム解析とグルコシノレートプロファイリング【JST・京大機械翻訳】

De novo transcriptome analysis and glucosinolate profiling in watercress ( Nasturtium officinale R. Br.)

著者 (7件)： Jeon Jin (Department of Crop Science, Chungnam National University, Daejeon, Korea) ,  Bong Sun Ju (Department of Crop Science, Chungnam National University, Daejeon, Korea) ,  Park Jong Seok (Department of Horticulture, Chungnam National University, Daejeon, Korea) ,  Park Young-Kyu (LAS Inc., Gimpo City, Korea) ,  Arasu Mariadhas Valan (Department of Botany and Microbiology, Addiriyah Chair for Environmental Studies, College of Science, King Saud University, Riyadh, Saudi Arabia) ,  Al-Dhabi Naif Abdullah (Department of Botany and Microbiology, Addiriyah Chair for Environmental Studies, College of Science, King Saud University, Riyadh, Saudi Arabia) ,  Park Sang Un (Department of Crop Science, Chungnam National University, Daejeon, Korea)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 18  号： 1  ページ： 401  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:水ストレス(Nasturtium officinale R.Br.)は,グルコシノレートのような二次代謝産物の豊富な供給源である水生草本種である。これらのグルコシノレートの中で,水ストレスは高い量のグルコナスタリジン(2-フェネチルグルコシノレート)とその加水分解生成物,2-フェネチルイソチオシアネートを含み,それは腫瘍成長を抑制する役割を果たす。しかしながら,漢方薬の源としてのN.officinaleの使用は,不十分なゲノムおよび生理学的情報のために現在制限されている。【結果】N.officinaleにおけるグルコシノレート生合成に関する正確な情報を得るために,著者らはN.officinaleの異なる器官のトランスクリプトームとメタボロームの包括的分析を行った。N.officinale苗のトランスクリプトーム分析は,69,570,892の生の読み取りをもたらした。これらの読み取りは69,635の転写物に組み立てられ,そのうちの64,876は公開データベースにおける転写物に注釈された。N.officinaleの機能的アノテーションに基づいて,グルコシノレート生合成経路に関連する酵素をコードする33の候補遺伝子を同定し,N.officinaleの葉,茎,根,花,種子におけるこれらの遺伝子の発現を分析した。脂肪族グルコシノレート生合成の主要調節因子であるNoMYB28とNoMYB29の発現は茎で最も高かったが,NoDof1.1,NoMYB34,NoMYB51およびNoMYB122のようなインドールグルコシノレート生合成の重要な調節因子は根で強く発現した。ほとんどのグルコシノレート生合成遺伝子は花で高度に発現した。HPLC分析は,N.officinaleの異なる器官における8つのグルコシノレートを検出することを可能にした。これらのグルコシノレートの中では,個々の器官においてグルコナスタチインのレベルは他のグルコシノレートよりもかなり高く,総グルコシノレートの量は花で最も高かった。結論:本研究は,この植物のグルコシノレート生合成経路を含むN.officinaleの機能的ゲノミクスの理解を強化した。最終的に,著者らのデータは,その抗発癌性を利用するための水ストレスバイオエンジニアリングとより良い戦略に関するさらなる研究に役立つであろう。Copyright 2018 The Author(s). All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生合成 ,  二次代謝産物 ,  データベース ,  水分ストレス ,  高速液体クロマトグラフィー ,  ゲノム ,  生理学 ,  酵素 ,  *グルコシノレート ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： ゲノミクス ,  調節因子 ,  生合成経路 ,  メタボローム ,  *トランスクリプトーム解析 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： Nasturtium officinale ,  Watercress ,  トランスクリプトーム ,  グルコシノレート

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (55件)：

• Innov Food Sci Emerg Technol; Effect of heat and thermosonication treatments on watercress (Nasturtium officinale) vitamin C degradation kinetics; RM Cruz, MC Vieira, CL Silva; 9; 2008; 483-8; 10.1016/j.ifset.2007.10.005; CR1;
• J Food Eng; Effect of heat and thermosonication treatments on peroxidase inactivation kinetics in watercress (Nasturtium officinale); RM Cruz, MC Vieira, CLM Silva; 72; 2006; 8-15; 10.1016/j.jfoodeng.2004.11.007; CR2;
• Micro Nano Lett; Watercress-based gold nanoparticles: biosynthesis, mechanism of formation and study of their biocompatibility in vitro; M Pourhassan-Moghaddam, N Zarghami, A Mohsenifar, M Rahmati-Yamchi, D Gholizadeh, A Akbarzadeh; 9; 2014; 345-50; 10.1049/mnl.2014.0063; CR3;
• J Food Eng; Biochemical and colour changes of watercress (Nasturtium officinale R. Br.) during freezing and frozen storage; E Gonçalves, R Cruz, M Abreu, T Brandão, CL Silva; 93; 2009; 32-9; 10.1016/j.jfoodeng.2008.12.027; CR4;
• J Sci Food Agric; The analysis of glucosinolates in Brassica species using gas chromatography. Direct determination of the thiocyanate ion precursors, glucobrassicin and neoglucobrassicin; RK Heaney, GR Fenwick; 31; 1980; 593-9; 10.1002/jsfa.2740310612; CR5;

タイトルに関連する用語 (3件)： Nasturtium ,  Br ,  トランスクリプトーム解析