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J-GLOBAL ID：201802280939011392   整理番号：18A1892107

環境DNAメタバーコーディングによる運河・港湾に生息する魚類の種多様性検出に関する研究

FISH DIVERSITY DETECTION AT PORT AND URBAN CANAL AREA USING ENVIRONMENTAL DNA METABARCODING

著者 (7件)： 上村了美 (大阪市立大学大学院工学研究科) ,  上月康則 (徳島大学 環境防災研究センター) ,  大谷壮介 (大阪府立大学工業高等専門学校総合工学システム学科) ,  平川倫 (徳島大学大学院 先端技術科学教育部) ,  岩見和樹 (徳島大学大学院 先端技術科学教育部) ,  竹山佳奈 (五洋建設(株) 環境事業部) ,  山中亮一 (徳島大学 環境防災研究センター)
資料名： 土木学会論文集 B3(海洋開発)(Web)  (Journal of Japan Society of Civil Engineers, Ser. B3 (Ocean Engineering) (Web))
巻： 74  号： 2  ページ： I_474-I_479(J-STAGE)  発行年： 2018年 
JST資料番号： U0288A  ISSN： 2185-4688  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： 尼崎運河とその近隣の港湾において,環境DNA手法のひとつMiFish法を用いて魚類相の種多様性を検出し,富栄養化の進んだ沿岸域での本手法の有効性ならびに課題を明らかにした.種多様性を検出するためには,少なくとも1000 mlのろ過が必要であることが示唆された.運河では計16種が検出され,前年の採捕調査(13種)よりも多く,採捕調査では籠の制約によって評価できなかったと考えられるボラとクロダイ属が環境DNAによって検出された.検出された種数や魚類相を過去のデータと比較し,MiFish法は運河・港湾域での生物多様性モニタリングに有効であると考えられた.課題としては,適切なろ過量を選択する必要があること,結果について実際に生息している魚種であるかを精査する必要があることなどがあげられる.(著者抄録)

シソーラス用語： *生物多様性 ,  *運河 ,  *港湾 ,  魚類 ,  符号化 ,  *環境DNA ,  *魚類相
準シソーラス用語： *バーコーディング ,  種多様性

著者キーワード (4件)： eDNA ,  Amagasaki canal ,  MiFish ,  fish diversity

分類 (2件)： 水産土木  (FH01030O) ,  魚類  (FH02020K)

引用文献 (6件)：

• 1) 竹山佳奈, 山中亮一, 河野博, 岩本裕之, 宮本一之, 平川倫, 上月康則 : 都市部運河域を利用する魚類を対象とした生物共生護岸に関する実験的検討,土木学会論文集B3(海洋開発),第73巻,2号,pp. 845-850,2017.
• 2) 高原輝彦, 山中裕樹, 源利文, 土居秀幸, 内井喜美子. 環境DNA分析の手法開発の現状 ~淡水域の研究事例を中心にして~,日本生態学会誌,第66巻,3号,pp583-599,2016.
• 3) 山中裕樹, 源利文, 高原輝彦, 内井喜美子, 土居秀幸. 環境DNA分析の野外調査への展開. 日本生態学会誌,第66巻,3号,pp601-611, 2016.
• 4) Miya M, Sato Y, Fukunaga T, Sado T, Poulsen JY, Sato K, Minamoto T, Yamamoto S, Yamanaka H, Araki H, Kondoh M, Iwasaki W. : MiFish, a set of universal PCR primers for metabarcoding environmental DNA from fishes: detection of more than 230 subtropical marine species, R. Soc. opensci. 2, 150088, 2017.
• 5) Yamamoto S, Masuda R, Sato Y, Sado T, Araki H, Kondoh M, Minamoto T, Miya M. : Environmental DNA metabarcoding reveals local fish communities in a species-rich coasta lsea. Scientific Reports. 7, 40368.2017.

タイトルに関連する用語 (8件)： 環境DNA ,  メタバーコーディング ,  運河 ,  港湾 ,  生息 ,  魚類 ,  種多様性 ,  研究