文献

J-GLOBAL ID：201802281204719740   整理番号：18A1011255

PCR法及び制限消化法の組合せを用いたDinophysis属とPhalacroma属に属する海洋渦鞭毛虫類からの被食者DNA検出のための効果的方法

An effective method for detecting prey DNA from marine dinoflagellates belonging to the genera Dinophysis and Phalacroma using a combination of PCR and restriction digestion techniques

著者 (6件)： Nishitani Goh (Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University) ,  Kosaka Yuki (Aomori Prefectural Industrial Technology Research Center Fisheries Research Institute) ,  Nagai Satoshi (National Research Institute of Fisheries Science) ,  Takano Yoshihito (Graduate School of Kuroshio Science, Kochi University) ,  Kim Young-Ok (Korea Institute of Ocean Science and Technology) ,  Ishikawa Akira (Graduate School of Bioresources, Mie University)
資料名： Plankton and Benthos Research  (Plankton and Benthos Research)
巻： 13  号： 2  ページ： 90-94(J-STAGE)  発行年： 2018年 
JST資料番号： L3253B  ISSN： 1880-8247  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 短報  発行国： 日本 (JPN)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Dinophysis and Phalacromaに属する海洋渦鞭毛虫類はプランクトン性繊毛虫類に対する混合栄養性または従属栄養性の活発な摂食としての報告がある。しかしながらPhalacroma mitraにより捕食される繊毛虫類の同定について利用できる情報には限界がある。これら2種に属する渦鞭毛虫類の被食者DNA検出に効果的な方法を導入した。食胞を有するP.mitraの細胞3種を天然海水から分離し,食胞内の被食者DNAを分析した。ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)に基づく増幅後,Dinophysis及びPhalacromaに特異的な制限酵素を用いて被食者DNAを濃縮した。遺伝子クローニングは未消化PCR産物が渦鞭毛虫類,クリプト植物門及び放散虫類だけでなく,繊毛虫類(Euplotes sp.,Mesodinium rubrum,Spirostrombidium sp.など)のDNAを含むことを明らかにした。これらの結果はP.mitraの被食者多様性が追跡できることを意味する。さらに本方法はプランクトン生態系における食物網への新たな洞察を明らかにする有益なデータを提供できるものである。(翻訳著者抄録)

シソーラス用語： 渦鞭毛虫類 ,  PCR法 ,  消化系生理 ,  *生物相互作用 ,  *プランクトン ,  遺伝子クローニング ,  食胞 ,  藻類 ,  放散虫 ,  繊毛虫類
準シソーラス用語： Dinophysis ,  Phalacroma ,  被食者 ,  Phalacroma mitra ,  クリプト植物門

著者キーワード (10件)： Dinophysis症 ,  骨軟骨腫 ,  被食 ,  多様性 ,  制限酵素 ,  Dinophysis症 ,  骨軟骨腫 ,  被食 ,  多様性 ,  制限酵素

分類 (2件)： プランクトン  (FH02050R) ,  異種生物間相互作用  (EE01050A)

引用文献 (12件)：

• Blankenship LE, Yayanos A (2005) Universal primers and PCR of gut contents to study marine invertebrate diets. Mol Ecol 14: 891-899.
• Handy SM, Bachvaroff TR, Timme RE, Coats DW, Kim S, Delwiche CF (2009) Phylogeny of four dinophysiacean genera (Dinophyceae, Dinophysiales) based on rDNA sequences from single cells and environmental samples. J Phycol 45: 1163-1174.
• Hansen PJ (1991) Dinophysis-a planktonic dinoflagellate genus which can act both as a prey and a predator of a ciliate. Mar Ecol Prog Ser 69: 201-204.
• Jensen MH, Daugbjerg N (2009) Molecular phylogeny of selected species of the order Dinophysiales (Dinophyceae)-testing the hypothesis of a dinophysioid radiation. J Phycol 45: 1136-1152.
• Koike K, Sekiguchi H, Kobiyama A, Takishita K, Kawachi M, Koike K, Ogata T (2005) A novel type of kleptoplastidy in Dinophysis (Dinophyceae): Presence of haptophyte-type plastid in Dinophysis mitra. Protist 156: 225-237.

タイトルに関連する用語 (9件)： PCR法 ,  制限 ,  消化 ,  組合せ ,  Dinophysis ,  海洋 ,  渦鞭毛虫類 ,  被食者 ,  DNA