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J-GLOBAL ID：201802283293391318   整理番号：18A1346157

全トランスクリプトーム解析は有毒渦鞭毛虫類,alexandium catenella(ACHK-T)における毒素生合成の分子機構への洞察を提供する【JST・京大機械翻訳】

Whole Transcriptomic Analysis Provides Insights into Molecular Mechanisms for Toxin Biosynthesis in a Toxic Dinoflagellate Alexandrium catenella (ACHK-T)

著者 (4件)： Zhang Yong (State Key Laboratory of Marine Environmental Science/College of the Environment and Ecology, Xiamen University, Xiamen 361102, China) ,  Zhang Shu-Fei (State Key Laboratory of Marine Environmental Science/College of the Environment and Ecology, Xiamen University, Xiamen 361102, China) ,  Lin Lin (State Key Laboratory of Marine Environmental Science/College of the Environment and Ecology, Xiamen University, Xiamen 361102, China) ,  Wang Da-Zhi (State Key Laboratory of Marine Environmental Science/College of the Environment and Ecology, Xiamen University, Xiamen 361102, China)
資料名： Toxins (Web)  (Toxins (Web))
巻： 9  号： 7  ページ： 213  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7286A  ISSN： 2072-6651  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 神経毒性アルカロイドのグループである麻痺性貝毒(PST)は,水生生態系およびヒトの健康に対する最も強力なバイオ毒素である。海洋渦鞭毛藻類と淡水藍藻類は,PSTの2つの生産者である。PSTsの生合成機構はシアノバクテリアで良く解明されている。しかしながら,それは渦鞭毛藻類においてあいまいなままである。ここでは,RNA-seqを用いて細胞周期内の異なる毒素生合成段階における毒素産生渦鞭毛藻類Alexandrium catenella(ACHK-T)のトランスクリプトームプロファイルを比較した。細胞内毒素含量は中期G1期で徐々に増加し,後期G1期で急速に増加し,他の相では比較的安定していた。4つの毒素生合成段階からの試料を配列決定のために選択し,最終的に110,370の単一遺伝子を得て,そのうちの66,141を既知のデータベースにおいて成功裏に注釈した。差次的に発現した遺伝子の分析は,2866の遺伝子が有意に変化し,297が4つの段階を通して共発現することを明らかにした。これらの遺伝子は主に蛋白質代謝,炭水化物代謝および酸化還元過程に関与していた。毒素遺伝子の合計138の同族体が同定されたが,それらは異なる段階の間で有意に変化し,毒素生合成が翻訳的または翻訳後に調節される可能性があることを示した。著者らの結果は,渦鞭毛藻類毒素生合成の基礎となる重要な分子過程を特性化するための重要なトランスクリプトーム資源として役立つであろう。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  *生合成 ,  RNA【核酸】 ,  遺伝子 ,  *毒素 ,  ヒト ,  *鞭毛 ,  藍藻類 ,  酸化還元反応 ,  糖質代謝 ,  細胞周期 ,  *渦鞭毛虫類 ,  キャラクタリゼーション ,  *トランスクリプトーム
準シソーラス用語： *分子機構 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： 渦鞭毛 ,  alexandium catenella ,  麻痺性貝毒 ,  毒素生合成 ,  細胞周期 ,  RNA-seq

分類 (1件)： 動物起原の毒性  (GZ03020U)

引用文献 (66件)：

• Salcedo, T.; Upadhyay, R.J.; Nagasaki, K.; Bhattacharya, D. Dozens of toxin-related genes are expressed in a non-toxic strain of the dinoflagellate Heterocapsa circularisquama. Mol. Biol. Evol. 2012, 29, 1503-1506.
• Kao, C.Y. Tetrodotoxin, saxitoxin and their significance in the study of excitation phenomena. Pharmacol. Rev. 1966, 18, 997-1049.
• Wiese, M.; D’Agostino, P.M.; Mihali, T.K.; Moffitt, M.C.; Neilan, B.A. Neurotoxic alkaloids: Saxitoxin and its analogs. Mar. Drugs 2010, 8, 2185-2211.
• Hallegraeff, G.M. A review of harmful algal blooms and their apparent global increase. Phycologia 1993, 32, 79-99.
• Kellmann, R.; Mihali, T.K.; Jeon, Y.J.; Pickford, R.; Pomati, F.; Neilan, B.A. Biosynthetic intermediate analysis and functional homology reveal a saxitoxin gene cluster in cyanobacteria. Appl. Environ. Microbiol. 2008, 74, 4044-4053.

タイトルに関連する用語 (6件)： トランスクリプトーム解析 ,  渦鞭毛虫類 ,  毒素 ,  生合成 ,  分子 ,  洞察