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J-GLOBAL ID：201802288446059820   整理番号：18A1152706

西ケニア熱帯熱マラリア原虫集団におけるSURF4.1遺伝子上で検出された選択,フレームシフト変異およびコピー数変異【JST・京大機械翻訳】

Selections, frameshift mutations, and copy number variation detected on the surf 4.1 gene in the western Kenyan Plasmodium falciparum population

著者 (19件)： Gitaka Jesse N. (Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Gitaka Jesse N. (Department of Protozoology, Institute of Tropical Medicine (NEKKEN), Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Gitaka Jesse N. (Department of Clinical Medicine, Mount Kenya University, Thika, Kenya) ,  Takeda Mika (Department of Protozoology, Institute of Tropical Medicine (NEKKEN), Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Kimura Masatsugu (Radioisotope Centre, Graduate School of Medicine, Osaka City University, Osaka, Japan) ,  Idris Zulkarnain Md (Island Malaria Group, Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology (MTC), Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Idris Zulkarnain Md (Department of Parasitology and Medical Entomology, Faculty of Medicine, Universiti Kebangsaan Malaysia Medical Centre, Kuala Lumpur, Malaysia) ,  Chan Chim W. (Island Malaria Group, Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology (MTC), Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Kongere James (Nairobi Research Station, Nagasaki University Institute of Tropical Medicine-Kenya Medical Research Institute (NUITM-KEMRI) Project, Institute of Tropical Medicine (NEKKEN), Nagasaki University, Nairobi, Kenya) ,  Yahata Kazuhide (Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Yahata Kazuhide (Department of Protozoology, Institute of Tropical Medicine (NEKKEN), Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Muregi Francis W. (Department of Clinical Medicine, Mount Kenya University, Thika, Kenya) ,  Ichinose Yoshio (Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Ichinose Yoshio (Nairobi Research Station, Nagasaki University Institute of Tropical Medicine-Kenya Medical Research Institute (NUITM-KEMRI) Project, Institute of Tropical Medicine (NEKKEN), Nagasaki University, Nairobi, Kenya) ,  Kaneko Akira (Island Malaria Group, Department of Microbiology, Tumor and Cell Biology (MTC), Karolinska Institutet, Stockholm, Sweden) ,  Kaneko Akira (Department of Parasitology and Research Center for Infectious Disease Sciences, Graduate School of Medicine, Osaka City University, Osaka, Japan) ,  Kaneko Akira (Institute of Tropical Medicine (NEKKEN), Nagasaki University, Nagasaki, Nagasaki, Japan) ,  Kaneko Osamu (Graduate School of Biomedical Sciences, Nagasaki University, Nagasaki, Japan) ,  Kaneko Osamu (Department of Protozoology, Institute of Tropical Medicine (NEKKEN), Nagasaki University, Nagasaki, Japan)
資料名： Malaria Journal (Web)  (Malaria Journal (Web))
巻： 16  号： 1  ページ： 98  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7332A  ISSN： 1475-2875  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】Plasmodium falciparum SURFIN_4.1はメロゾイトで発現された推定リガンドであり,感染赤血球で発現されている。その遺伝子は東部ケニア個体群における指向性選択下にあるが,タイ人集団における平衡選択下にあることが示唆された。この差異を理解するために,西部Kenyan P. falciparum分離株のsurf_4.1配列を分析した。西ケニアとタイの寄生虫について,フレームシフト突然変異とコピー数変化(CNV)も調べた。【結果】タイ人集団において類似している西部ケニア集団における3つの集団に基づく試験によって,可変領域2(Var2)のC末端をコードするsurf_4.1領域において,中立予測からの正の有意な逸脱が検出された。これは,東部ケニア集団に対する以前の分析ではカバーされなかった。同義部位当たりの同義置換上の非同義部位当たりの非同義置換の有意な過剰もVar2領域で検出された。中性予測からの負に有意な逸脱は,東部ケニア集団における以前の観測と一致するVar1C末端をコードする領域で検出された。細胞内Trpリッチ(WR)ドメインのない産物をもたらすフレームシフト変異を持つ寄生虫は,ケニア西部で22/23,タイで22/36であった。surf_4.1遺伝子の1コピー以上がケニア西部(4/24)で検出されたが,タイではCNVは見られなかった(0/36)。【結語】著者らは,Kenyanおよびタイの個体群の両方におけるSURFIN_4.1Var2C末端の高い多型性が,選択を多様化し,選択をバランスさせることによって維持されたことを推論した。これらの現象は,免疫学的圧力により最も駆動される可能性が一方,SURFIN_4.1 Var1 C末端は,東ケニア集団に対する以前の報告と一致する方向性選択の下にあると示唆される。ほとんどの西部ケニア分離株は,メロゾイト上のSURFIN_4.1の発現を制限するフレームシフト突然変異を有するが,タイの分離株の60%だけがこのフレームシフトを有しており,Kenyanとタイの個体群の間のVar1C末端に対するTajimaのD値の2つの四肢で見られるように,この蛋白質に対する選択圧のレベルとタイプに影響する。Kenyan分離株で観察されたCNVは,このフレームシフト突然変異の結果であり,メロゾイト表面上での利益を増加させる可能性がある。Copyright 2018 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 寄生虫 ,  *コピー数 ,  個体群 ,  赤血球 ,  *マラリア ,  予測 ,  タンパク質 ,  *Plasmodium falciparum ,  *ケニア共和国 ,  感染 ,  *遺伝子 ,  多様化 ,  メロゾイト ,  *遺伝的変異 ,  *プラスモジウム属 ,  *微生物 ,  *原生動物 ,  *胞子虫類
準シソーラス用語： *変異 ,  *マラリア原虫 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： コピー数変動 ,  フレームシフト ,  マラリア ,  Plasmodium falciparum ,  選択 ,  SURFIN4.1

分類 (4件)： 進化論一般  (EC03010Q) ,  分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  感染症・寄生虫症一般  (GD01010H)

引用文献 (30件)：

• World Malaria Report; World Health Organization; 2015; CR1;
• J Exp Med; SURFIN is a polymorphic antigen expressed on Plasmodium falciparum merozoites and infected erythrocytes; G Winter, S Kawai, M Haeggström, O Kaneko, A Euler, S Kawazu; 201; 2005; 1853-1863; 10.1084/jem.20041392; CR2;
• Malar J.; SURFIN4.1, a schizont-merozoite associated protein in the SURFIN family of Plasmodium falciparum; FA Mphande, U Ribacke, O Kaneko, F Kironde, G Winter, M Wahlgren; 7; 2008; 116; 10.1186/1475-2875-7-116; CR3;
• Parasitol Int; The N-terminal segment of Plasmodium falciparum SURFIN4.1 is required for its trafficking to the red blood cell cytosol through the endoplasmic reticulum; X Zhu, K Yahata, JS Alexandre, T Tsuboi, O Kaneko; 62; 2013; 215-229; 10.1016/j.parint.2012.12.006; CR4;
• Trop Med Health.; The cytoplasmic region of Plasmodium falciparum SURFIN4.2 is required for transport from Maurer’s clefts to the red blood cell surface; W Kagaya, S Miyazaki, K Yahata, N Ohta, O Kaneko; 43; 2015; 265-272; 10.2149/tmh.2015-38; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： ケニア ,  熱帯熱マラリア原虫 ,  集団 ,  遺伝子 ,  フレームシフト変異 ,  コピー数 ,  変異