特許
J-GLOBAL ID:201803012383857841
ジカウイルス検出用プライマーセット、アッセイキットおよび増幅方法
発明者:
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出願人/特許権者:
,
代理人 (1件):
特許業務法人スズエ国際特許事務所
公報種別:公開公報
出願番号(国際出願番号):特願2017-018844
公開番号(公開出願番号):特開2018-121607
出願日: 2017年02月03日
公開日(公表日): 2018年08月09日
要約:
【課題】ジカウイルス(ZIKV)を迅速かつ高精度に検出する手段の提供。【解決手段】ZIKVを特異的に検出するためのLAMP増幅用核酸プライマーセット、アッセイキット、および検出のための増幅方法。プライマーセットは、アジア型検出用プライマー群、即ち、アジア型のZIKVを検出するためのプライマー群、およびアフリカ型検出用プライマー群、即ち、アフリカ型のZIKVを検出するためのプライマー群の少なくともどちらか一方を含む、プライマーセット。【選択図】図1A
請求項(抜粋):
ジカウイルスを特異的に増幅するためのLAMP増幅用核酸プライマーセットであって、
アジア型検出用プライマー群およびアフリカ型検出用プライマー群の少なくとも一方を含み、
前記アジア型検出用プライマー群により増幅されるべき鋳型配列は、それぞれ、3’側から5’側に向けてF3c配列、F2c配列、F1c配列、B1配列、B2配列およびB3配列をこの順番で含み、
前記アジア型検出用プライマー群は、F3プライマー、B3プライマー、FIPプライマーおよびBIPプライマーを含み、F3プライマーはF3配列を含み、B3プライマーはB3配列を含み、FIPプライマーは、5’側から3’側に向けてF1c配列とF2配列とをこの順番で含み、BIPプライマーは、5’側から3’側に向けてB1c配列とB2配列とをこの順番で含み、
ここで、F1配列とF1c配列、F2配列とF2c配列、F3配列とF3c配列、B1配列とB1c配列、B2配列とB2c配列、B3配列とB3c配列は互いに相補的であり、
前記F3配列は、配列番号1、配列番号5、配列番号9若しくは配列番号19に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、
前記F2配列は、配列番号58、配列番号65若しくは配列番号51に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、
前記F1配列は、配列番号36、配列番号60若しくは配列番号68に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、
前記B1c配列は、配列番号54、配列番号62若しくは配列番号70に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、
前記B2c配列は、配列番号55、配列番号56、配列番号64若しくは配列番号72に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、および
前記B3c配列は、配列番号2、配列番号6、配列番号10若しくは配列番号20に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、
前記アフリカ型検出用プライマー群により増幅されるべき鋳型配列は、それぞれ、3’側から5’側に向けてF3c-2配列、F2c-2配列、F1c-2配列、B1-2配列、B2-2配列およびB3-2配列をこの順番で含み、
前記アフリカ型検出用プライマー群は、F3-2プライマー、B3-2プライマー、FIP-2プライマーおよびBIP-2プライマーを含み、F3-2プライマーはF3-2配列を含み、B3-2プライマーはB3-2配列を含み、FIP-2プライマーは、5’側から3’側に向けてF1c-2配列とF2-2配列とをこの順番で含み、BIP-2プライマーは、5’側から3’側に向けてB1c-2配列とB2-2配列とをこの順番で含み、
ここで、F1-2配列とF1c-2配列、F2-2配列とF2c-2配列、F3-2配列とF3c-2配列、B1-2配列とB1c-2配列、B2-2配列とB2c-2配列、B3-2配列とB3c-2配列は互いに相補的であり、
前記F3-2配列は、配列番号1、配列番号24若しくは配列番号37に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、
前記F2-2配列は、配列番号57、配列番号65若しくは配列番号48に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、
前記F1-2配列は、配列番号35、配列番号59若しくは配列番号67に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、
前記B1c-2配列は、配列番号54、配列番号61若しくは配列番号69に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、
前記B2c-2配列は、配列番号56、配列番号63若しくは配列番号71に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含み、および
前記B3c-2配列は、配列番号10、配列番号20若しくは配列番号38に含まれる連続する少なくとも13塩基またはその相補配列を含む
ことを特徴とするプライマーセット。
IPC (2件):
FI (2件):
Fターム (8件):
4B063QA01
, 4B063QA19
, 4B063QQ10
, 4B063QQ28
, 4B063QQ42
, 4B063QS24
, 4B063QS36
, 4B063QX02
引用文献:
出願人引用 (4件)
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Biosensors and Bioelectronics, 2016, Vol.86, pp.420-425
-
Journal of Virological Methods, 2016, Vol.238, pp.86-93
-
Analytical chemistry, 2016, Vol.88, pp.12272-12278
-
Analytical Chemistry, 2016, Vol.88, pp.7289-7294
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審査官引用 (5件)
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Analytical chemistry, 2016, Vol.88, pp.12272-12278
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Analytical Chemistry, 2016, Vol.88, pp.7289-7294
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Biosensors and Bioelectronics, 2016, Vol.86, pp.420-425
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Journal of Virological Methods, 2016, Vol.238, pp.86-93
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Journal of Virological Methods, 2016, Vol.238, pp.86-93
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