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J-GLOBAL ID：201902215334877840   整理番号：19A0785068

ヒト癌における治療標的を分析する統合的オミックス分析【JST・京大機械翻訳】

Integrative omics analyses broaden treatment targets in human cancer

著者 (38件)： Sengupta Sohini (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Sengupta Sohini (McDonnell Genome Institute, Washington University, St. Louis, USA) ,  Sun Sam Q. (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Sun Sam Q. (McDonnell Genome Institute, Washington University, St. Louis, USA) ,  Huang Kuan-lin (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Huang Kuan-lin (McDonnell Genome Institute, Washington University, St. Louis, USA) ,  Oh Clara (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Oh Clara (McDonnell Genome Institute, Washington University, St. Louis, USA) ,  Bailey Matthew H. (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Bailey Matthew H. (McDonnell Genome Institute, Washington University, St. Louis, USA) ,  Varghese Rajees (Division of Nephrology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Wyczalkowski Matthew A. (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Wyczalkowski Matthew A. (McDonnell Genome Institute, Washington University, St. Louis, USA) ,  Ning Jie (Division of Nephrology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Tripathi Piyush (Division of Nephrology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  McMichael Joshua F. (McDonnell Genome Institute, Washington University, St. Louis, USA) ,  Johnson Kimberly J. (Brown School, Washington University, St. Louis, USA) ,  Kandoth Cyriac (Marie-Josee and Henry R. Kravis Center for Molecular Oncology, Memorial Sloan Kettering Cancer Center, New York, USA) ,  Welch John (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Ma Cynthia (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Ma Cynthia (Department of Genetics, Washington University, St. Louis, USA) ,  Wendl Michael C. (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Wendl Michael C. (McDonnell Genome Institute, Washington University, St. Louis, USA) ,  Wendl Michael C. (Department of Mathematics, Washington University, St. Louis, USA) ,  Wendl Michael C. (Department of Genetics, Washington University, St. Louis, USA) ,  Payne Samuel H. (Biological Sciences Division, Pacific Northwest National Laboratory, Richland, USA) ,  Fenyo David (Department of Biochemistry and Molecular Pharmacology, New York University Langone School of Medicine, New York, USA) ,  Fenyo David (Institute for Systems Genetics, New York University Langone School of Medicine, New York, USA) ,  Townsend Reid R. (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Townsend Reid R. (Siteman Cancer Center, Washington University, St. Louis, USA) ,  Dipersio John F. (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Dipersio John F. (Siteman Cancer Center, Washington University, St. Louis, USA) ,  Chen Feng (Division of Nephrology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Chen Feng (Department of Genetics, Washington University, St. Louis, USA) ,  Ding Li (Division of Oncology, Department of Medicine, Washington University, St. Louis, USA) ,  Ding Li (McDonnell Genome Institute, Washington University, St. Louis, USA) ,  Ding Li (Department of Genetics, Washington University, St. Louis, USA) ,  Ding Li (Siteman Cancer Center, Washington University, St. Louis, USA)
資料名： Genome Medicine (Web)  (Genome Medicine (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 60  発行年： 2018年 
JST資料番号： U7320A  ISSN： 1756-994X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 癌の大規模,次世代配列決定(NGS)研究は,正確な腫瘍学を可能にするために有望であるが,臨床的に検証されたバイオマーカーとNGSを統合することに挑戦が残っている。このような課題を克服するために,著者らは,ゲノム,トランスクリプトーム,およびプロテオミックバイオマーカーに対するドラッグ性を結びつけるために,正確さ(DEPO)に対するEvidenceのデータベースを利用した。6570腫瘍の汎癌コホートを用いて,DEPOによって同定された薬物関連突然変異,mRNA発現異常値および蛋白質/リン蛋白質発現異常から成る潜在的に可能性のあるバイオマーカーを有する腫瘍を同定した。6570腫瘍の汎癌コホート内で,3%が特異的癌型におけるFDA承認薬物-突然変異相互作用に基づいて治療可能であることを見出した。しかしながら,癌型にわたるmRNA/リン蛋白質/蛋白質発現異常値および薬物の再精製は,腫瘍の16%までの潜在的な薬物療法可能性を示唆する。潜在的薬物関連腫瘍の割合は,前臨床的証拠を考慮すれば,48%まで増加することができる。さらに,著者らの解析は,腫瘍の32%において潜在的に可能性のある多重オミクス変化を示し,個々に,腫瘍の1.6および0.8%において,mTOR/PI3K/ESR1共阻害およびBRAF/AKT共阻害を支持する証拠を有する個別化併用療法の役割を示した。蛋白質構造に基づく計算ツールにより同定されたBRAFにおける推定可能な突然変異のサブセットを実験的に検証した。最後に,大規模薬物スクリーニングデータセットの分析により,癌タイプにわたる薬物の再精製を支持するさらなる証拠と,薬物療法を推定するための発現異常値の使用を明らかにした。著者らの結果は,統合分析プラットフォームが,薬物療法性のバイオマーカーとしてのマルチオミクス変化を模倣でき,患者への精密な腫瘍学をもたらすための継続的な努力を助けることを示唆する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ゲノム ,  異常値 ,  腫瘍 ,  薬物療法 ,  データベース ,  *ヒト ,  mRNA ,  相互作用 ,  母集団 ,  突然変異 ,  バイオマーカー ,  トランスクリプトーム ,  部分集合
準シソーラス用語： *オミックス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 癌ゲノミクス ,  マルチオミックス ,  プロテオゲノミクス ,  精密医療 ,  癌と薬物療法

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  腫ようの免疫療法  (GE03035B)

引用文献 (92件)：

• N Engl J Med; Trastuzumab-mechanism of action and use in clinical practice; CA Hudis; 357; 2007; 39-51; 10.1056/NEJMra043186; citation_id=CR1
• Nature; Clinical efficacy of a RAF inhibitor needs broad target blockade in BRAF-mutant melanoma; G Bollag; 467; 2010; 596-599; 10.1038/nature09454; citation_id=CR2
• Cancer Treat Rev; The landscape of precision cancer medicine clinical trials in the United States; N Roper, KD Stensland, R Hendricks, MD Galsky; 41; 5; 2015; 385-390; 10.1016/j.ctrv.2015.02.009; citation_id=CR3
• Nat Rev Drug Discov; Considerations for the successful co-development of targeted cancer therapies and companion diagnostics; J Fridlyand; 12; 2013; 743-755; 10.1038/nrd4101; citation_id=CR4
• Nature; Mutational landscape and significance across 12 major cancer types; C Kandoth; 502; 2013; 333-339; 10.1038/nature12634; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (6件)： ヒト ,  癌 ,  治療標的 ,  分析 ,  統合 ,  オミックス