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J-GLOBAL ID：201902244649977838   整理番号：19A1291733

単核および多核遷移金属系に対するQM/MMアプローチの系統的モデリングのための密度およびスピン密度の線形応答関数【JST・京大機械翻訳】

Linear Response Functions of Densities and Spin Densities for Systematic Modeling of the QM/MM Approach for Mono- and Poly-Nuclear Transition Metal Systems

著者 (9件)： Kitakawa Colin K. (Graduate School of Science, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan) ,  Maruyama Tomohiro (Graduate School of Science, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan) ,  Oonari Jinta (Graduate School of Science, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan) ,  Mitsuta Yuki (Graduate School of Science, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan) ,  Kawakami Takashi (Graduate School of Science, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan) ,  Okumura Mitsutaka (Graduate School of Science, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan) ,  Yamaguchi Kizashi (Institute for Nanodesign, Osaka University, Osaka 560-8531, Japan) ,  Yamanaka Shusuke (Graduate School of Science, Osaka University, Osaka 565-0871, Japan) ,  Yamanaka Shusuke (Quantum information, Quantum Biology division, Institute for Open and Transdisciplinary Research Initiatives, Osaka University, Osaka 560-8531, Japan)
資料名： Molecules (Web)  (Molecules (Web))
巻： 24  号： 4  ページ： 821  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7014A  ISSN： 1420-3049  CODEN： MOLEFW  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 密度とスピン密度の線形応答関数に基づいて,2つの典型的な遷移金属錯体系,P450の反応中心,および光系IIの酸素発生中心に基づいて,この解析を適用した。これらの両方は,開殻遷移金属イオンを含んでいる。電子密度のLRFとスピン密度の関係,及び系のユニットと相互作用のタイプを論じた。計算結果を,酵素の反応中心を計算するために用いられる量子力学(QM)クラスタと量子力学/分子力学(QM/MM)モデリングに関連して議論した。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *応答関数 ,  相互作用 ,  *スピン密度 ,  電子密度 ,  遷移金属錯体 ,  酸素発生 ,  *モデリング ,  分子内力学 ,  量子論 ,  クラスタ ,  *線形性 ,  酵素
準シソーラス用語： 遷移金属イオン , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 線形応答関数 ,  QM/MM ,  遷移金属錯体 ,  酵素

分類 (1件)： 分子の電子構造  (BH05010Q)

引用文献 (63件)：

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• Warshel, A.; Levitt, M. Theoretical studies of enzymic reactions: Dielectric, electrostatic and steric stabilization of the carbonium ion in the reaction of lysozyme. J. Mol. Biol. 1976, 103, 227-249.
• Vreven, T.; Morokuma, K.; Farkas, O.; Schlegel, H.B.; Frisch, M.J. Geometry optimization with QM/MM, ONIOM, and other combined methods. I. Microiterations and constraints. J. Comp. Chem. 2003, 24, 760-769.
• Senn, H.M.; Thiel, W. QM/MM Methods for Biomolecular Systems. Angew. Chem. Int. Ed. 2009, 48, 1198-1229.
• Ahmadi, S.; Herrera, L.B.; Chehelamirani, M.; Hostas, J.; Jalife, S.; Salahub, D.R. Multiscale modeling of enzymes: QM-cluster, QM/MM, and QM/MM/MD: A tutorial review. Int. J. Quantum Chem. 2018, 118, e25558.

タイトルに関連する用語 (8件)： 核 ,  遷移金属 ,  系統 ,  モデリング ,  密度 ,  スピン密度 ,  線形 ,  応答関数