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J-GLOBAL ID：201902255739424538   整理番号：19A0022366

ゲノムマイニングに基づく新しいLassoペプチドスペシャリシンの単離と構造決定【JST・京大機械翻訳】

Isolation and structure determination of a new lasso peptide specialicin based on genome mining

著者 (6件)： Kaweewan Issara (Graduate School of Science and Technology, Shizuoka University, 3-5-1 Johoku, Hamamatsu, 432-8561 Shizuoka, Japan) ,  Hemmi Hikaru (Food Research Institute, NARO, 2-1-12 Kan-nondai, Tsukuba, Ibaraki 305-8642, Japan) ,  Komaki Hisayuki (Biological Resource Center, National Institute of Technology and Evaluation (NBRC), 2-5-8 Kazusakamatari, Kisarazu, Chiba 292-0818, Japan) ,  Harada Shigeyoshi (AIDS Research Center, National Institute of Infectious Diseases, 1-23-1 Toyama, Shinjuku-ku, Tokyo 162-8640, Japan) ,  Kodani Shinya (Graduate School of Science and Technology, Shizuoka University, 3-5-1 Johoku, Hamamatsu, 432-8561 Shizuoka, Japan) ,  Kodani Shinya (Academic Institute, Shizuoka University, 836 Ohya, Suruga-ku, Shizuoka 422-8529 Japan)
資料名： Bioorganic & Medicinal Chemistry  (Bioorganic & Medicinal Chemistry)
巻： 26  号： 23-24  ページ： 6050-6055  発行年： 2018年 
JST資料番号： W0556A  ISSN： 0968-0896  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： オランダ (NLD)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： ゲノムマイニングに基づいて,Streptomyces specialisの抽出物から新しいラッソペプチドスペシアリシンを単離した。ESI-MSおよびNMR分析により,特異的な構造を確立し,イソペプチド結合を含む21個のアミノ酸の長さおよび分子中に2個のジスルフィド結合を有するラッソペプチドを得た。Trp以外の構成アミノ酸の立体化学はLと決定され,C末端のTrpの立体化学はDと決定された。speciの三次元構造をNOE実験データに基づいて決定した。これは,スペシャリシンがシアマイシンIと類似の立体配座構造を有することを示した。スペシアリシンはMicrococcus luteusに対して抗菌活性を示し,HIV-1 NL4-3に対して中程度の抗HIV活性を示した。S.specialisのゲノム配列データから,特異的な生合成遺伝子クラスターを提案した。Copyright 2019 Elsevier B.V., Amsterdam. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： エレクトロスプレイイオン化質量分析 ,  *単離 ,  ジスルフィド結合 ,  立体配座 ,  NMR【磁気共鳴】 ,  アミノ酸 ,  *ペプチド ,  立体化学 ,  生合成 ,  Micrococcus luteus ,  抗細菌作用 ,  イソペプチド結合 ,  *ゲノムマイニング ,  ストレプトマイセス属 ,  抗HIV作用 ,  微生物 ,  放線菌目
準シソーラス用語： Streptomyces ,  抗HIV活性 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： ゲノムマイニング ,  Lassoペプチド ,  NMRスペクトル ,  抗HIV活性

分類 (2件)： 薬物の合成  (GV01030F) ,  酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W)

タイトルに関連する用語 (2件)： ゲノムマイニング ,  単離