文献

J-GLOBAL ID：201902257820621221   整理番号：19A1451952

リンゴの堆肥化堆肥微生物群集からのメタゲノムマイニングペクチン分解性微生物と酵素【JST・京大機械翻訳】

Metagenomic mining pectinolytic microbes and enzymes from an apple pomace-adapted compost microbial community

著者 (8件)： Zhou Man (College of Food Science and Engineering, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Guo Peng (College of Information Engineering, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Wang Tao (College of Food Science and Engineering, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Gao Lina (College of Food Science and Engineering, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Yin Huijun (College of Food Science and Engineering, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Cai Cheng (College of Information Engineering, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Gu Jie (College of Natural Resources and Environment, Northwest A&F University, Yangling, China) ,  Lue Xin (College of Food Science and Engineering, Northwest A&F University, Yangling, China)
資料名： Biotechnology for Biofuels (Web)  (Biotechnology for Biofuels (Web))
巻： 10  号： 1  ページ： 198  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7022A  ISSN： 1754-6834  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 【背景】リグノセルロース材料におけるペクチンの分解は,生物燃料生産のための重要なステップの1つである。ペクチンの生物学的加水分解,すなわちペクチン分解性微生物と酵素による分解は,環境に優しい手順,リグニン除去のためのエネルギー需要の低さ,および圧密プロセスに統合される可能性のような明らかな利点のために魅力的なパラダイムである。本研究では,濃縮培養技術と組み合わせたメタゲノム配列ガイド戦略を用いて,ペクチン分解微生物と酵素の標的発見を容易にした。リンゴ搾りかす適応堆肥(APAC)生息場所を構築し,ペクチン分解微生物の濃縮を促進した。【結果】16S rDNAハイスループット配列決定の分析は,微生物群集が,いくつかの細菌集団による堆肥化の間,劇的に変化したことを明らかにした。メタゲノムのデータは,リンゴのザクロ適応堆肥微生物群集(APACMC)がProteobacteriaとBacteroidetesによって支配されていることを示した。機能分析および炭水化物活性酵素プロファイルは,APACMCが標的機能に対して成功裏に濃縮されていることを確認した。ペクチン分解酵素をコードする1756の推定遺伝子のうち,129は新規(CAZyデータベース侵入に対して30%以下)と予測され,NCBI環境データベースにおける蛋白質と75%以上の相同性を示し,以前のメタゲノムプロジェクトでは観察されなかったことを示した。系統発生分析は,APACMCが広範囲のペクチン分解細菌を持ち,それらの多くが以前に認識されていないことを示した。【結論】著者らの研究において発見された非常に多様なペクチン分解性微生物および酵素は,リグノセルロース系生物燃料生産のための促進分解者および酵素のヒ素を拡大するであろう。著者らの研究は,多数の産業における標的化採鉱微生物および酵素に対する強力なアプローチを提供する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 生物燃料 ,  培養 ,  リグニン ,  遺伝子 ,  タンパク質 ,  *ペクチン ,  リグノセルロース ,  データベース ,  *酵素 ,  *堆肥 ,  加水分解 ,  *微生物
準シソーラス用語： プロテオバクテリア ,  *メタゲノム ,  *微生物コンソーシアム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： リグノセルロース系バイオ燃料 ,  ペクチン ,  メタゲノム ,  ペクチン分解性微生物と酵素 ,  堆肥生息場所

分類 (1件)： 生物燃料及び廃棄物燃料  (LB02020Y)

引用文献 (53件)：

• Microbiol Mol Biol Rev; Structural biology of pectin degradation by Enterobacteriaceae; DW Abbott, AB Boraston; 72; 2; 2008; 301-316; 10.1128/MMBR.00038-07; CR1;
• PLoS ONE; Targeted discovery of glycoside hydrolases from a switchgrass-adapted compost community; M Allgaier, A Reddy, JI Park, N Ivanova, P D’Haeseleer, S Lowry, R Sapra, TC Hazen, BA Simmons, JS VanderGheynst, P Hugenholtz; 5; 1; 2010; e8812; 10.1371/journal.pone.0008812; CR2;
• Biotechnol Biofuels; Downregulation of GAUT12 in Populus deltoides by RNA silencing results in reduced recalcitrance, increased growth and reduced xylan and pectin in a woody biofuel feedstock; AK Biswal, Z Hao, S Pattathil, X Yang, K Winkeler, C Collins, SS Mohanty, EA Richardson, I Gelineo-Albersheim, K Hunt, D Ryno, RW Sykes, GB Turner, A Ziebell, E Gjersing, W Lukowitz, MF Davis, SR Decker, MG Hahn, D Mohnen; 8; 2015; 41; 10.1186/s13068-015-0218-y; CR3;
• Biotechnol Biofuels; Aspen pectate lyase Ptxt PL1-27 mobilizes matrix polysaccharides from woody tissues and improves saccharification yield; AK Biswal, K Soeno, ML Gandla, P Immerzeel, S Pattathil, J Lucenius, R Serimaa, MG Hahn, T Moritz, LJ Jönsson; 7; 1; 2014; 1; 10.1186/1754-6834-7-11; CR4;
• Appl Microbiol Biotechnol; Pectin-modifying enzymes and pectin-derived materials: applications and impacts; E Bonnin, C Garnier, MC Ralet; 98; 2; 2014; 519-532; 10.1007/s00253-013-5388-6; CR5;

タイトルに関連する用語 (7件)： リンゴ ,  堆肥化 ,  堆肥 ,  微生物群集 ,  分解性 ,  微生物 ,  酵素