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J-GLOBAL ID：201902265675471240   整理番号：19A1650264

米国で分離されたP2virusの新種,RalstoniaファージRSOM1USAの分子的および生物学的特性化【JST・京大機械翻訳】

Molecular and Biological Characterization of Ralstonia Phage RsoM1USA, a New Species of P2virus, Isolated in the United States

著者 (5件)： Addy Hardian Susilo (Floral and Nursery Plants Research Unit, United States National Arboretum, United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service, Beltsville, MD, United States) ,  Addy Hardian Susilo (Department of Plant Protection, Faculty of Agriculture, University of Jember, Jember, Indonesia) ,  Ahmad Abdelmonim Ali (Floral and Nursery Plants Research Unit, United States National Arboretum, United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service, Beltsville, MD, United States) ,  Ahmad Abdelmonim Ali (Department of Plant Pathology, Faculty of Agriculture, Minia University, El-minia, Egypt) ,  Huang Qi (Floral and Nursery Plants Research Unit, United States National Arboretum, United States Department of Agriculture-Agricultural Research Service, Beltsville, MD, United States)
資料名： Frontiers in Microbiology (Web)  (Frontiers in Microbiology (Web))
巻： 10  ページ： 267  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7080A  ISSN： 1664-302X  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 米国の土壌からの最初のRalstonia感染バクテリオファージをフロリダのトマト圃場から分離した。Electron顕微鏡法により,ファージRsoM1USAは,直径約66nm,長さ約152nmの収縮尾部,長い「ネック」の二十面体頭部を有するファミリーMyoviridaeの属P2virusのメンバーであることを明らかにした。ファージRsoM1USAは,3つのRalstonia種の各々において世界的に収集された30の試験R.solanacearum種複合株の12を感染させた:R.solanacearum,R.pseudosolanacearum,およびR.syzygii。ファージは,細胞あたり約56粒子のバーストサイズで,感染サイクル180分後に感染サイクルを完了した。ファージRsoM1USAは,58のオープンリーディングフレーム(ORF)を含む39,309ヌクレオチドのゲノムを有し,RalstoniaウイルスRSA1のRalstoniaファージRSA1に密接に関連している。ファージRsoM1USAのゲノム構成もファージRSA1のそれと類似しているが,それらのインテグラーゼは配列相同性を共有しない。さらに,ファージRsoM1USAのその感受性R.solanacearum株K60への統合は,ファージRSA1で報告されているアルギニンtRNA(CCG)ではなく,スレオニンtRNA(TGT)の3′45塩基部分により仲介され,2つのファージが異なる機構を用いることを確認した。精製したビリオンのプロテオーム解析は主要な構造蛋白質のアノテーションを支持した。ファージRsoM1USAによる感受性R.solanacearum株RUN302の感染は,非感染RUN302株と比較して,トマト植物における病原性ではなく,in vitroでの感染細菌の増殖を有意に低下させた。ファージRSA1との違いにより,ファージRsoM1USAは,RalstoniaウイルスRsoM1USAの提案された種名を持つ新種のタイプメンバーと考えられるべきである。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： アノテーション ,  in vitro実験 ,  *バクテリオファージ ,  *Ralstonia ,  感受性 ,  インテグラーゼ ,  顕微鏡観察 ,  *新種 ,  tRNA ,  ビリオン ,  *キャラクタリゼーション ,  トマト ,  ヌクレオチド ,  ゲノム
準シソーラス用語： オープンリーディングフレーム , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： Ralstonia solanacearum ,  Ralstoniaファージ ,  免震 ,  特性化 ,  P2virus ,  Myoviridae

分類 (2件)： ウイルスの生化学  (EG04030F) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (56件)：

• Addy H. S., Askora A., Kawasaki T., Fujie M., Yamada T. (2012a). Loss of virulence of the phytopathogen Ralstonia solanacearum through infection by φRSM filamentous phages. Phytopathology 102 469-477. doi: 10.1094/PHYTO-11-11-0319-R
• Addy H. S., Askora A., Kawasaki T., Fujie M., Yamada T. (2012b). The filamentous phage φRSS1 enhances virulence of phytopathogenic Ralstonia solanacearum on tomato. Phytopathology 102 244-251. doi: 10.1094/PHYTO-10-11-0277
• Addy H. S., Farid M. M., Ahmad A. A., Huang Q. (2018). Host range and molecular characterization of a lytic Pradovirus-like Ralstonia phage RsoP1IDN isolated from Indonesia. Arch. Virol. 163 3409-3414. doi: 10.1007/s00705-018-4033-1
• Adriaenssens E. M., Brister J. R. (2017). How to name and classify your phage: an informal guide. Viruses 9:E70. doi: 10.3390/v9040070
• Ahmad A. A., Askora A., Kawasaki T., Fujie M., Yamada T. (2014). The filamentous phage XacF1 causes loss of virulence in Xanthomonas axonopodis pv. citri, the causative agent of citrus canker disease. Front. Microbiol. 5:321. doi: 10.3389/fmicb.2014.00321

タイトルに関連する用語 (6件)： 米国 ,  新種 ,  Ralstonia ,  ファージ ,  分子 ,  生物学的特性