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J-GLOBAL ID：201902275123429310   整理番号：19A0494492

Xiphinema指数とLongidorus elongatusのトランスクリプトームは初期分岐Nematodesにおける水平遺伝子導入によるいくつかの植物寄生遺伝子の独立した獲得を示唆する【JST・京大機械翻訳】

The Transcriptomes of Xiphinema index and Longidorus elongatus Suggest Independent Acquisition of Some Plant Parasitism Genes by Horizontal Gene Transfer in Early-Branching Nematodes

著者 (18件)： Danchin Etienne G.J. (INRA, Universite Cote d’Azur, CNRS, ISA, 06903, Sophia Antipolis Cedex, France) ,  Perfus-Barbeoch Laetitia (INRA, Universite Cote d’Azur, CNRS, ISA, 06903, Sophia Antipolis Cedex, France) ,  Rancurel Corinne (INRA, Universite Cote d’Azur, CNRS, ISA, 06903, Sophia Antipolis Cedex, France) ,  Thorpe Peter (Cell and Molecular Sciences Group, Dundee Effector Consortium, James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee DD2 5DA, UK) ,  Rocha Martine Da (INRA, Universite Cote d’Azur, CNRS, ISA, 06903, Sophia Antipolis Cedex, France) ,  Bajew Simon (Cell and Molecular Sciences Group, Dundee Effector Consortium, James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee DD2 5DA, UK) ,  Neilson Roy (Ecological Sciences Group, IPM@Hutton, James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee DD2 5DA, UK) ,  Sokolova (Guzeeva) Elena (Cell and Molecular Sciences Group, Dundee Effector Consortium, James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee DD2 5DA, UK) ,  Sokolova (Guzeeva) Elena (Centre of Parasitology of the A.N. Severtsov Institute of Ecology and Evolution, Russian Academy of Sciences, Leninskii Prospect 33, Moscow 119071, Russia) ,  Silva Corinne Da (Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Institut de Genomique (IG), Genoscope, 92057, Evry, France) ,  Guy Julie (Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Institut de Genomique (IG), Genoscope, 92057, Evry, France) ,  Labadie Karine (Commissariat a l’Energie Atomique (CEA), Institut de Genomique (IG), Genoscope, 92057, Evry, France) ,  Esmenjaud Daniel (INRA, Universite Cote d’Azur, CNRS, ISA, 06903, Sophia Antipolis Cedex, France) ,  Helder Johannes (Laboratory of Nematology, Department of Plant Sciences, Wageningen University, Droevendaalsesteeg 1, 6708 PB Wageningen, The Netherlands) ,  Jones John T. (Cell and Molecular Sciences Group, Dundee Effector Consortium, James Hutton Institute, Invergowrie, Dundee DD2 5DA, UK) ,  Jones John T. (School of Biology, University of St Andrews, North Haugh, St Andrews KY16 9TZ, UK) ,  Akker Sebastian Eves-van den (Biological Chemistry, John Innes Centre, Norwich Research Park, Norwich NR4 7UH, UK) ,  Akker Sebastian Eves-van den (School of Life Sciences, University of Dundee, Dundee, DD1 5EH, UK)
資料名： Genes (Web)  (Genes (Web))
巻： 8  号： 10  ページ： 287  発行年： 2017年 
JST資料番号： U7194A  ISSN： 2073-4425  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Nematodesは,少なくとも4つの独立した機会に植物を寄生する能力を進化させ,植物寄生虫は門の1,2,10および12に存在する。Clades10と12の場合,細菌と菌類からの植物細胞壁分解酵素の水平遺伝子移動は植物寄生の進化に関与している。著者らは,2つの経済的に重要な線虫種,Xiphinema指数およびLongidorus伸長に対する参照トランスクリプトームを生み出すためにリボ核酸配列決定(RNAseq)を用いて,Nematoda門の初期分岐クレード2内の2つの属を代表した。著者らは,推定上の水平遺伝子移動イベントを同定するために,トランスクリプトームの広い分析を用いた。これは,このクレードの植物寄生線虫からの最初の徹底的トランスクリプトーム解析を表す。それぞれの種について,著者らは参照トランスクリプトームに約30百万のIllina readsを組み立てた。著者らは,X.indexおよびL.elongatusからそれぞれ62および104の転写産物を同定し,それらは水平遺伝子移動により推定された。Pfamドメインの門幅分析による水平遺伝子移動予測の交差参照により,Clade2特異的事象を同定した。これらのうち,X.indexからのGH12セルラーゼを系統発生的および生化学的に分析し,細菌起源および正準酵素機能を明らかにした。水平遺伝子移動は,線虫類間の植物寄生の進化に寄与する現象であることが以前に示されている。著者らの知見は,この種と広範な動物門における植物寄生性ライフスタイルの進化におけるこの現象の重要性と拡張性を強調する。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 線虫類 ,  予測 ,  寄生虫 ,  RNA【核酸】 ,  *遺伝子 ,  細菌 ,  系統発生 ,  ライフスタイル ,  *トランスクリプトーム ,  セルラーゼ ,  生化学
準シソーラス用語： クレード ,  Nematodes ,  Longidorus ,  Xiphinema , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： グリコシドヒドロラーゼ ,  水平遺伝子導入 ,  線虫 ,  植物寄生

分類 (2件)： 異種生物間相互作用  (EE01050A) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (64件)：

• Van Megen, H.; van den Elsen, S.; Holterman, M.; Karssen, G.; Mooyman, P.; Bongers, T.; Holovachov, O.; Bakker, J.; Helder, J. A phylogenetic tree of nematodes based on about 1200 full-length small subunit ribosomal DNA sequences. Nematology 2009, 11, 927-950.
• Holterman, M.; Karegar, A.; Mooijman, P.; van Megen, H.; van den Elsen, S.; Vervoort, M.T.W.; Quist, C.W.; Karssen, G.; Decraemer, W.; Opperman, C.H.; et al. Disparate gain and loss of parasitic abilities among nematode lineages. PLoS ONE 2017, 12, e0185445.
• Abad, P.; Gouzy, J.; Aury, J.-M.; Castagnone-Sereno, P.; Danchin, E.G.J.; Deleury, E.; Perfus-Barbeoch, L.; Anthouard, V.; Artiguenave, F.; Blok, V.C.; et al. Genome sequence of the metazoan plant-parasitic nematode Meloidogyne incognita. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 909-915.
• Opperman, C.H.; Bird, D.M.; Williamson, V.M.; Rokhsar, D.S.; Burke, M.; Cohn, J.; Cromer, J.; Diener, S.; Gajan, J.; Graham, S.; et al. Sequence and genetic map of Meloidogyne hapla: A compact nematode genome for plant parasitism. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2008, 105, 14802-14807.
• Cotton, J.A.; Lilley, C.J.; Jones, L.M.; Kikuchi, T.; Reid, A.J.; Thorpe, P.; Tsai, I.J.; Beasley, H.; Blok, V.; Cock, P.J.A.; et al. The genome and life-stage specific transcriptomes of Globodera pallida elucidate key aspects of plant parasitism by a cyst nematode. Genome Biol. 2014, 15, R43.

タイトルに関連する用語 (9件)： 指数 ,  トランスクリプトーム ,  初期 ,  分岐 ,  水平遺伝子導入 ,  植物 ,  寄生 ,  遺伝子 ,  獲得