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J-GLOBAL ID：201902288249131578   整理番号：19A1294100

ナノ細孔におけるDNAの閉塞と放出および逆運動【JST・京大機械翻訳】

Clog and Release, and Reverse Motions of DNA in a Nanopore

著者 (6件)： Kubota Tomoya (Department of Mathematics and Physics, Aoyama-Gakuin University, Sagamihara Campus L617, 5-10-1 Fuchinobe, Chuo, Sagamihara, Kanagawa 252-5258, Japan) ,  Lloyd Kento (Department of Mathematics and Physics, Aoyama-Gakuin University, Sagamihara Campus L617, 5-10-1 Fuchinobe, Chuo, Sagamihara, Kanagawa 252-5258, Japan) ,  Sakashita Naoto (Department of Mathematics and Physics, Aoyama-Gakuin University, Sagamihara Campus L617, 5-10-1 Fuchinobe, Chuo, Sagamihara, Kanagawa 252-5258, Japan) ,  Minato Seiya (Department of Mathematics and Physics, Aoyama-Gakuin University, Sagamihara Campus L617, 5-10-1 Fuchinobe, Chuo, Sagamihara, Kanagawa 252-5258, Japan) ,  Ishida Kentaro (Department of Mathematics and Physics, Aoyama-Gakuin University, Sagamihara Campus L617, 5-10-1 Fuchinobe, Chuo, Sagamihara, Kanagawa 252-5258, Japan) ,  Mitsui Toshiyuki (Department of Mathematics and Physics, Aoyama-Gakuin University, Sagamihara Campus L617, 5-10-1 Fuchinobe, Chuo, Sagamihara, Kanagawa 252-5258, Japan)
資料名： Polymers (Web)  (Polymers (Web))
巻： 11  号： 1  ページ： 84  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7262A  ISSN： 2073-4360  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 直径100又は200nmのナノ細孔近傍の種々の長さの円形及び線形DNA分子の運動を実験的に観察し,蛍光顕微鏡により調べた。転位として知られているナノ細孔を通るDNA分子の移動は,主に細孔内および内部の電場により駆動される。著者らは,DNA分子,特に円形DNAと線形T4 DNA(165.65kbp)によるナノ細孔の顕著な閉塞を見出した。ここでは,DNAの長さと形状に依存するDNA閉塞事象の確率を決定した。さらに,2つの異なるDNA運動が観察された:直線的T4 DNAによる凝固と放出,および円形DNAによる細孔入口における逆方向運動。その後,両分子は細孔から離れて移動した。有限要素法に基づく数値シミュレーションを行った。結果は,直径100~200nmの細孔を持つDNA分子が,反対の流体力学的流動流により強く影響されることを示した。これは,嵩高いDNA配置により更に強化された。Copyright 2019 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 線形性 ,  *細孔 ,  *DNA【核酸】 ,  有限要素法 ,  電場 ,  蛍光顕微鏡 ,  流体力学
準シソーラス用語： 数値シミュレーション ,  *ナノ細孔 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 転座 ,  ナノ細孔 ,  DNA ,  電気浸透

分類 (3件)： 生物薬剤学(基礎)  (GY01021U) ,  各種接着剤  (YK03000X) ,  高分子固体のその他の性質  (CG02025L)

引用文献 (47件)：

• Dekker, C. Solid-state nanopores. Nat. Nanotechnol. 2007, 2, 209-215.
• Branton, D.; Deamer, D.W.; Marziali, A.; Bayley, H.; Benner, S.A.; Butler, T.; Di Ventra, M.; Garaj, S.; Hibbs, A.; Huang, X.; et al. The potential and challenges of nanopore sequencing. Nat. Biotechnol. 2008, 26, 1146-1153.
• Deamer, D.; Akeson, M.; Branton, D. Three decades of nanopore sequencing. Nat. Biotechnol. 2016, 34, 518-524.
• Wanunu, M. Nanopores: A journey towards DNA sequencing. Phys. Life Rev. 2012, 9, 125-158.
• Keyser, U.F. Controlling molecular transport through nanopores. J. R. Soc. Interface R. Soc. 2011, 8, 1369-1378.

タイトルに関連する用語 (5件)： ナノ細孔 ,  DNA ,  閉塞 ,  放出 ,  運動