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J-GLOBAL ID：202002210366948349   整理番号：20A1939273

重み付き遺伝子共発現ネットワーク解析を用いた神経膠芽腫の発生に関与する免疫関連遺伝子の同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of Immune-Related Genes Contributing to the Development of Glioblastoma Using Weighted Gene Co-expression Network Analysis

著者 (30件)： Kong Yang (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Kong Yang (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Kong Yang (Department of Biomedicine, University of Bergen, Bergen, Norway) ,  Feng Zi-Chao (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Feng Zi-Chao (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Zhang Yu-Lin (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Zhang Yu-Lin (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Liu Xiao-Fei (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Liu Xiao-Fei (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Ma Yuan (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Ma Yuan (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Zhao Zhi-Min (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Zhao Zhi-Min (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Huang Bin (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Huang Bin (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Chen An-Jing (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Chen An-Jing (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Zhang Di (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Zhang Di (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Thorsen Frits (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Thorsen Frits (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Thorsen Frits (Department of Biomedicine, University of Bergen, Bergen, Norway) ,  Wang Jian (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Wang Jian (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Wang Jian (Department of Biomedicine, University of Bergen, Bergen, Norway) ,  Yang Ning (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Yang Ning (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China) ,  Yang Ning (Department of Epidemiology and Health Statistics, School of Public Health, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Xin-Gang (Department of Neurosurgery, Qilu Hospital and Institute of Brain and Brain-Inspired Science, Cheeloo College of Medicine, Shandong University, Jinan, China) ,  Li Xin-Gang (Shandong Key Laboratory of Brain Function Remodeling, Shandong University, Jinan, China)
資料名： Frontiers in Immunology (Web)  (Frontiers in Immunology (Web))
巻： 11  ページ： 1281  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7074A  ISSN： 1664-3224  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： スイス (CHE)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 背景:ヒト膠芽腫(GBM)の腫瘍微小環境(TME)は,かなりの免疫細胞浸潤を示し,このような細胞型はGBMの発症に広く関与することが示されている。ここでは,加重相関ネットワーク分析(WGCNA)を,GBMの進行に寄与する可能性のある免疫関連分子を同定するために,公的に利用可能なデータセット上で実施し,従って,潜在的治療標的として活用した。【方法】WGCNAを用いて,中国のGlioma Genome Atlas神経膠腫データセットにおける高相関遺伝子クラスターを同定した。有意なモジュールにおける免疫関連遺伝子は,その後,癌ゲノムAtlas(TCGA)とRembrandtデータベースで検証され,GBM発生への影響は,in vitroでの移動と血管模倣アッセイ,およびマウスにおける同所性異種移植モデル(GL261ルシフェラーゼ-GFP細胞)で調べられた。結果:WGCNAは14の有意なモジュールをもたらし,そのうちの1つ(黒)は免疫応答および細胞外マトリックス形成に関与する遺伝子を含んでいた。これらの遺伝子のGO免疫関連遺伝子セットとの交差は47の免疫関連遺伝子をもたらし,そのうち5つはGBMにおけるより悪い予後と発現の増加および関連を示した。これらの遺伝子の一つ,TREM1は,壊死周辺の偽柵状細胞の領域で高度に発現し,血管新生/低酸素で誘導された他の蛋白質と関連していた。THP1細胞由来のマクロファージにおいて,TREM1発現レベルは低酸素条件下で増加し,マクロファージM2分極のマーカーと関連していた。誘導マクロファージにおけるTREM1 siRNAノックダウンは,in vitroでGBM細胞における移動と血管模倣を促進する能力を低下させ,TREM1をブロックするLP-17ペプチドによるマウスの処理はGL261同所異種移植片の成長を阻害した。最後に,誘導マクロファージにおけるCSF1に対するサイトカイン受容体の阻害は,GBM細胞における腫瘍移動および血管模倣を促進する可能性も妨げた。結論:著者らの結果は,TREM1が神経膠腫患者に対する新しい免疫療法標的として使用できることを示した。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 血管 ,  ペプチド ,  *遺伝子 ,  壊死 ,  タンパク質 ,  ヒト ,  免疫反応 ,  ルシフェラーゼ ,  異種移植 ,  マクロファージ ,  予後 ,  in vitro実験 ,  THP-1細胞 ,  *膠芽腫 ,  siRNA

著者キーワード (6件)： 神経膠芽腫 ,  マクロファージ ,  腫瘍微小環境 ,  M2分極 ,  生物情報学 ,  TCGA

分類 (3件)： 神経系の腫よう  (GN04000V) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N)

引用文献 (53件)：

• Ostrom QT, Cioffi G, Gittleman H, Patil N, Waite K, Kruchko C, et al. CBTRUS statistical report: primary brain and other central nervous system tumors diagnosed in the United States in 2012-2016. Neuro Oncol. (2019) 21:1-v100. doi: 10.1093/neuonc/noz150
• Wesseling P, Capper D. WHO 2016 Classification of gliomas. Neuropathol Appl Neurobiol. (2018) 44:139-50. doi: 10.1111/nan.12432
• Louis DN, Ohgaki H, Wiestler OD, Cavenee WK, Burger PC, Jouvet A, et al. The 2007 WHO classification of tumours of the central nervous system. Acta Neuropathol. (2007) 114:97-109. doi: 10.1007/s00401-007-0243-4
• Conniot J, Scomparin A, Peres C, Yeini E, Pozzi S, Matos AI, et al. Immunization with mannosylated nanovaccines and inhibition of the immune-suppressing microenvironment sensitizes melanoma to immune checkpoint modulators. Nat Nanotechnol. (2019) 14:891-901. doi: 10.1038/s41565-019-0512-0
• Nakagawa K, Garon EB, Seto T, Nishio M, Ponce Aix S, Paz-Ares L, et al. Ramucirumab plus erlotinib in patients with untreated, EGFR-mutated, advanced non-small-cell lung cancer (RELAY): a randomised, double-blind, placebo-controlled, phase 3 trial. Lancet Oncol. (2019) 20:1655-69. doi: 10.1016/S1470-2045(19)30634-5

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝子 ,  共発現 ,  ネットワーク解析 ,  神経膠芽腫 ,  免疫 ,  同定