文献

J-GLOBAL ID：202002218112895486   整理番号：20A2522946

結晶化と変異誘発によるセロビオース2-エピメラーゼの触媒方向に影響する潜在的因子への洞察【JST・京大機械翻訳】

Insight into the potential factors influencing the catalytic direction in cellobiose 2-epimerase by crystallization and mutagenesis

著者 (8件)： Feng Yinghui (State Key Laboratory of Food Science and Technology, School of Food Science and Technology, Jiangnan University, Wuxi214122, People’s Republic of China) ,  Hua Xiao (State Key Laboratory of Food Science and Technology, School of Food Science and Technology, Jiangnan University, Wuxi214122, People’s Republic of China) ,  Shen Qiuyun (State Key Laboratory of Food Science and Technology, School of Food Science and Technology, Jiangnan University, Wuxi214122, People’s Republic of China) ,  Matthews Melissa (Department of Molecular and Cellular Biology, University of California Davis, Davis, CA95616, USA) ,  Zhang Yuzhu (Western Regional Research Center, Agricultural Research Service, United States Department of Agriculture, Albany, CA94710, USA) ,  Fisher Andrew J. (Department of Molecular and Cellular Biology, University of California Davis, Davis, CA95616, USA) ,  Lyu Xiaomei (State Key Laboratory of Food Science and Technology, School of Food Science and Technology, Jiangnan University, Wuxi214122, People’s Republic of China) ,  Yang Ruijin (State Key Laboratory of Food Science and Technology, School of Food Science and Technology, Jiangnan University, Wuxi214122, People’s Republic of China)
資料名： Acta Crystallographica. Section D. Biological Crystallography  (Acta Crystallographica. Section D. Biological Crystallography)
巻： 76  号： 11  ページ： 1104-1113  発行年： 2020年 
JST資料番号： W0466A  ISSN： 0907-4449  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： セロビオース2-エピメラーゼ(CE)は,ほとんどのCEが二糖類に対して主にエピマー化活性を示すので,エピメラーゼとして一般的に認識されている。近年,いくつかのCEが二機能性エピマー化および異性化活性を有することが見出されている。それらはラクトースをラクツロースに変換することができ,食品および製薬産業で広く使用されている高価値二糖類である。しかし,CEにおける触媒方向を決定する因子は,まだ明確ではない。本研究では,3つの新たに発見されたCEs,CsCE(Caldicellulosiruptorサッカリヌス由来の二機能性CE),StCE(Spirochaeta thermophila DSM 6578からの二機能性CE)およびBtCE(Bacillus <K 03>rmoamylovrans B4166由来の単官能性CE)の結晶構造を,それらの単官能性/二機能特性に対する構造的手がかりを探索するために,それぞれ1.54,2.05および1.80Å解像度で測定した。多様なCE,YihSおよびマンノースイソメラーゼの活性ポケットにおける水素結合ネットワークの比較分析は,CsCEにおけるHis188に対応するヒスチジンが異性化を触媒するためにユニークに必要であることを示唆した。多様なCEのアポおよびリガンド結合構造のアラインメントにより,二機能性CEは,より柔軟なループおよび活性部位周辺のより大きな入口を有する傾向があり,CsCEにおける柔軟なループ148~181は,リガンド結合時に明らかな立体配座変化を示すことを見出した。リガンド結合中の柔軟なループの再構築された分子相互作用が,異性化に有益な様式でリガンドを伸長するのを助けると推測した。CsCEにおける柔軟性ループの更なる部位特異的変異誘発分析は,柔軟なループの残基組成がエピマー化にあまり影響しないが,異性化に影響することを示した。特に,V177DおよびI178D変異体は野生型より異性化活性の50%および80%の増加を示した。本研究は,CEの触媒特性に関与する構造特性に関する新しい情報を提供し,将来の分子修飾を導くのに使用できる。Copyright 2020 Wiley Publishing Japan K.K. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *結晶化 ,  結晶構造 ,  分子間相互作用 ,  異性化 ,  配座転移 ,  活性部位 ,  *エピメラーゼ ,  *変異誘発 ,  二糖類 ,  エピマー化 ,  野生型 ,  部位特異的変異誘発 ,  ヘキソース ,  アルドース ,  ガラクトシド ,  ピラノシド ,  アミノ酸 ,  窒素複素環化合物 ,  第一アミン
準シソーラス用語： リガンド結合 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (7件)： セロビオース2-エピメラーゼ ,  結晶学 ,  フレキシブルループ ,  触媒方向 ,  変異誘発 ,  エピマー化 ,  異性化

分類 (2件)： 酵素一般  (EB09010D) ,  酵素生理  (EG03052C)

物質索引 (2件)： ラクトース ,  ヒスチジン

タイトルに関連する用語 (6件)： 結晶化 ,  変異誘発 ,  セロビオース2-エピメラーゼ ,  触媒 ,  因子 ,  洞察