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J-GLOBAL ID：202002233204186720   整理番号：20A0028335

miRNA発現データを用いたLewy小体による認知症に対する機械学習分類器の比較【JST・京大機械翻訳】

A comparison of machine learning classifiers for dementia with Lewy bodies using miRNA expression data

著者 (21件)： Shigemizu Daichi (Laboratory Chief, Division of Genomic Medicine, Medical Genome Center, National Center for Geriatrics and Gerontology, Obu, Japan) ,  Shigemizu Daichi (Department of Medical Science Mathematics, Medical Research Institute, Tokyo Medical and Dental University (TMDU), Tokyo, Japan) ,  Shigemizu Daichi (RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan) ,  Shigemizu Daichi (CREST, JST, Tokyo, Japan) ,  Akiyama Shintaro (Laboratory Chief, Division of Genomic Medicine, Medical Genome Center, National Center for Geriatrics and Gerontology, Obu, Japan) ,  Asanomi Yuya (Laboratory Chief, Division of Genomic Medicine, Medical Genome Center, National Center for Geriatrics and Gerontology, Obu, Japan) ,  Boroevich Keith A. (RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan) ,  Sharma Alok (RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan) ,  Sharma Alok (CREST, JST, Tokyo, Japan) ,  Sharma Alok (School of Engineering & Physics, University of the South Pacific, Suva, Fiji) ,  Sharma Alok (Institute for Integrated and Intelligent Systems, Griffith University, Brisbane, Australia) ,  Tsunoda Tatsuhiko (Department of Medical Science Mathematics, Medical Research Institute, Tokyo Medical and Dental University (TMDU), Tokyo, Japan) ,  Tsunoda Tatsuhiko (RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan) ,  Tsunoda Tatsuhiko (CREST, JST, Tokyo, Japan) ,  Sakurai Takashi (The Center for Comprehensive Care and Research on Memory Disorders, National Center for Geriatrics and Gerontology, Obu, Japan) ,  Sakurai Takashi (Department of Cognitive and Behavioral Science, Nagoya University Graduate School of Medicine, Nagoya, Japan) ,  Ozaki Kouichi (Laboratory Chief, Division of Genomic Medicine, Medical Genome Center, National Center for Geriatrics and Gerontology, Obu, Japan) ,  Ozaki Kouichi (RIKEN Center for Integrative Medical Sciences, Yokohama, Japan) ,  Ochiya Takahiro (Division of Molecular and Cellular Medicine, Fundamental Innovative Oncology Core Center, National Cancer Center Research Institute, Tokyo, Japan) ,  Ochiya Takahiro (Institute of Medical Science, Tokyo Medical University, Tokyo, Japan) ,  Niida Shumpei (Laboratory Chief, Division of Genomic Medicine, Medical Genome Center, National Center for Geriatrics and Gerontology, Obu, Japan)
資料名： BMC Medical Genomics (Web)  (BMC Medical Genomics (Web))
巻： 12  号： 1  ページ： 1-10  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7308A  ISSN： 1755-8794  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Lewy小体(DLB)を伴う認知症は,アルツハイマー病(AD)後のヒトにおける神経変性認知症の第2の最も一般的なサブタイプである。DLBの現在の臨床診断は,高い特異性と低い感度を有し,prodromal DLBの潜在的バイオマーカーの発見は依然として困難である。マイクロRNA(miRNA)は,最近,新しいバイオマーカーの源として多くの注目を集めている。本研究では,日本人478人の血清miRNA発現を用いて,潜在的miRNAバイオマーカーを研究し,いくつかの機械学習法に基づく最適リスク予測モデルを構築した。180のmiRNAと2つの臨床的特徴を用いた勾配ブースティング決定木によって構築された最終リスク予測モデルは,独立した試験セット上で0.829の精度を達成した。さらに,miRNAから候補標的遺伝子を予測した。miRNA標的遺伝子の遺伝子セット濃縮分析は,DLB病理と関連したDHAシグナル伝達経路に含まれる6つの機能的遺伝子を明らかにした。それらのうちの2つは,多数の単一ヌクレオチド多型マーカー(BCL2L1:P=0.012,PIK3R2:P=0.021)を用いた遺伝子ベースの関連研究によってさらに支持された。提案した予測モデルはDLB分類のための有効なツールを提供する。また,稀な変異体の遺伝子ベースの関連試験は,BCL2L1とPIK3R2がDLBと統計学的に有意に関連していることを明らかにした。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 病理 ,  *機械学習 ,  ディシジョンツリー ,  *Lewy小体 ,  バイオマーカー ,  一塩基多型 ,  ヒト ,  Alzheimer病 ,  遺伝子 ,  血清 ,  予測モデル ,  *認知症 ,  標的遺伝子 ,  *マイクロRNA ,  *細胞構造 ,  モデル
準シソーラス用語： ブースティング , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝的変異  (EC01030Y) ,  遺伝子の構造と化学  (EC02020U)

引用文献 (50件)：

• Lancet Neurol; The prognosis of dementia with Lewy bodies; C Mueller, C Ballard, A Corbett, D Aarsland; 16; 5; 2017; 390-398; 10.1016/S1474-4422(17)30074-1; citation_id=CR1
• Alzheimers Res Ther; Clinical prevalence of Lewy body dementia; JPM Kane, A Surendranathan, A Bentley, SAH Barker, JP Taylor, AJ Thomas, LM Allan, RJ McNally, PW James, IG McKeith; 10; 1; 2018; 19; 10.1186/s13195-018-0350-6; citation_id=CR2
• Lancet Neurol; Dementia with Lewy bodies; I McKeith, J Mintzer, D Aarsland, D Burn, H Chiu, J Cohen-Mansfield, D Dickson, B Dubois, JE Duda, H Feldman; 3; 1; 2004; 19-28; 10.1016/S1474-4422(03)00619-7; citation_id=CR3
• J Neurol; Low sensitivity in clinical diagnoses of dementia with Lewy bodies; PT Nelson, GA Jicha, RJ Kryscio, EL Abner, FA Schmitt, G Cooper, LO Xu, CD Smith, WR Markesbery; 257; 3; 2010; 359-366; 10.1007/s00415-009-5324-y; citation_id=CR4
• Matsunaga S, Kishi T, Yasue I, Iwata N. Cholinesterase Inhibitors for Lewy Body Disorders: A Meta-Analysis. Int J Neuropsychopharmacol. 2015;19(2).

タイトルに関連する用語 (6件)： miRNA ,  発現 ,  Lewy小体 ,  認知症 ,  機械学習 ,  分類器