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J-GLOBAL ID：202002251140994468   整理番号：20A2208127

p21活性化キナーゼ1(PAK1)に対する潜在的薬草阻害剤の探索と同定に対する計算アプローチ【JST・京大機械翻訳】

A computational approach to explore and identify potential herbal inhibitors for the p21-activated kinase 1 (PAK1)

著者 (7件)： Shahinozzaman Md (PAK Research Center, University of the Ryukyus, Okinawa, Japan) ,  Shahinozzaman Md (Department of Bioscience and Biotechnology, University of the Ryukyus, Okinawa, Japan) ,  Ishii Takahiro (Department of Bioscience and Biotechnology, University of the Ryukyus, Okinawa, Japan) ,  Ahmed Sinthyia (Division of Computer Aided Drug Design, The Red-Green Research Center, Dhaka, Bangladesh) ,  Halim Mohammad A. (Department of Physical Sciences, University of Arkansas-Fort Smith, Fort Smith, AR, USA) ,  Tawata Shinkichi (PAK Research Center, University of the Ryukyus, Okinawa, Japan) ,  Tawata Shinkichi (Department of Bioscience and Biotechnology, University of the Ryukyus, Okinawa, Japan)
資料名： Journal of Biomolecular Structure and Dynamics  (Journal of Biomolecular Structure and Dynamics)
巻： 38  号： 12  ページ： 3514-3526  発行年： 2020年 
JST資料番号： W5935A  ISSN： 0739-1102  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 発癌性キナーゼPAK1(p21活性化キナーゼ1)は,癌,神経線維腫症,Alzheimer病,糖尿病(2型)および高血圧を含む多くの疾患の発症に関与する。したがって,それは顕著な治療標的であり,その選択的阻害剤は巨大な市場可能性を持つ。最近,薬草PAK1阻害剤は,主にそれらの非毒性効果のため,合成上の大きな興味を得ている。今日まで,多くの薬草化合物はPAK1を阻害することが示唆されているが,選択性,バイオアベイラビリティ,ADMET(吸収,分布,代謝,排泄,毒性)特性に関する情報とPAK1との分子間相互作用は調べられていない。したがって,本研究は,良好なADMET特性,薬物性特徴およびPAK1との結合親和性を示す最良の薬草PAK1-ブロッカーを探索し,同定するための計算アプローチで設計した。ここで報告したハーブ阻害剤は,5(RO5)のLipinski則で最初に濾過した。次に,これらの阻害剤とPAK1触媒部位の間の分子ドッキングを,結合親和性と相互作用を決定するために,AutoDock VinaとGOLDセットを用いて行った。最後に,ククルビタシンI(C-I),幼虫A(NA)およびスタウロスポリン(SPN)を含む3つのトップランク阻害剤に関する200ns分子動力学(MD)シミュレーションを実施した。結合自由エネルギーと相互作用は,NAがPAK1触媒裂溝と強く結合できることを明らかにした。PASS予測とADMETプロファイリングは,NAがC-IとSPNより選択的で安全な阻害剤になると支持した。これらの結果は以前の実験的証拠と一致し,従って沖縄プロポリスからのNAはPAK1依存性疾患を治療するための有望な阻害剤であった。Ramaswamy H.Sarmaによって共用した。Please refer to the publisher for the copyright holders. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： シミュレーション ,  分子間相互作用 ,  糖尿病 ,  *薬用植物 ,  幼虫 ,  活性部位 ,  排泄 ,  バイオアベイラビリティ ,  分子動力学 ,  Alzheimer病 ,  ハーブ ,  結合親和性 ,  *キナーゼ
準シソーラス用語： AutoDock ,  治療標的 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (6件)： p21活性化キナーゼ1 ,  PAK1阻害剤 ,  生薬 ,  Nymphaeol A ,  分子ドッキング ,  分子動力学

分類 (2件)： 酵素製剤・酵素阻害剤の基礎研究  (GW21010W) ,  抗腫よう薬の基礎研究  (GW16010A)

タイトルに関連する用語 (7件)： p21活性化キナーゼ1 ,  PAK1 ,  薬草 ,  阻害剤 ,  探索 ,  同定 ,  計算