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J-GLOBAL ID：202002275047210929   整理番号：20A0974515

DNAメチル化パターンに基づく癌間の不均一性に関する分析【JST・京大機械翻訳】

An analysis about heterogeneity among cancers based on the DNA methylation patterns

著者 (6件)： Liu Yang (School of Life Science and Technology, Computational Biology Research Center, Harbin Institute of Technology, Harbin, China) ,  Gu Yue (College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Su Mu (School of Life Science and Technology, Computational Biology Research Center, Harbin Institute of Technology, Harbin, China) ,  Liu Hui (College of Bioinformatics Science and Technology, Harbin Medical University, Harbin, China) ,  Zhang Shumei (College of Information and Computer Engineering, Northeast Forestry University, Harbin, China) ,  Zhang Yan (School of Life Science and Technology, Computational Biology Research Center, Harbin Institute of Technology, Harbin, China)
資料名： BMC Cancer (Web)  (BMC Cancer (Web))
巻： 19  号： 1  ページ： 1-15  発行年： 2019年 
JST資料番号： U7305A  ISSN： 1471-2407  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 最も重要な後成的修飾の一つとしてのDNAメチル化は,遺伝子発現の調節に関与し,癌の発生に重要な役割を果たし,癌の間に後成的不均一性が存在することが一般的に信じられている。したがって,本研究は,異なる癌に対する信頼できる予後マーカーをスクリーニングすることを試み,癌の不均一性のさらなる説明を提供し,後成的観点から癌の臨床形質転換研究のためのより多くの標的を提供する。本論文は,詳細に癌の後成的不均一性について議論する。まず第一に,7つの癌型のDNAメチル化データを,TCGAデータベースのIllumina Infinium HumanMylation450Kプラットフォームから得た。次に,プロモーター領域において異なるメチル化分析を行った。第二に,KEGG経路におけるDNAメチル化相関ネットワークと遺伝子相互作用ネットワークを構築することにより,重要な遺伝子マーカーを得て,2つのネットワークから得られた317のマーカー遺伝子を,予後モデルの候補マーカーとして統合した。最後に,単変量および多変量Cox回帰モデルを用いて各癌に対する特異的独立予後マーカーを選択し,生存解析を行うことによりこれらの遺伝子のリスク因子を検討した。最初に,癌型特異的遺伝子マーカーを,示差メチル化分析により得,それらは濃縮分析により異なる生物学的機能に関与することを見出した。さらに,各タイプの癌に対する特異的および一般的な診断マーカーを選別し,Kaplan-Meier生存分析により,2つのリスク群間の生存に有意差があることを示した。この研究は,異なる癌に対する信頼できる予後マーカーをスクリーニングし,DNAメチル化レベルでの癌の不均一性および癌の臨床的変換研究のためのより多くの標的を提供する。Copyright 2020 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  ネットワーク ,  *メチル化 ,  遺伝子 ,  生物活性 ,  プロモーター領域 ,  回帰モデル ,  不均一性 ,  遺伝子発現 ,  危険因子
準シソーラス用語： 遺伝子マーカ ,  *DNAメチル化 ,  マーカー遺伝子 ,  予後予測マーカー ,  遺伝子相互作用 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： DNAメチル化 ,  癌 ,  エピジェネティックな異質性 ,  生存分析

分類 (5件)： 腫ようの診断  (GE03020J) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  細胞生理一般  (EF02010S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  発癌機序・因子  (GE02020C)

引用文献 (42件)：

• Nature; Mutational heterogeneity in cancer and the search for new cancer-associated genes; MS Lawrence; 499; 7457; 2013; 214-218; 10.1038/nature12213; citation_id=CR1
• Nature; Signatures of mutational processes in human cancer; LB Alexandrov; 500; 7463; 2013; 415-421; 10.1038/nature12477; citation_id=CR2
• Genome Med; Pan-cancer patterns of DNA methylation; T Witte, C Plass, C Gerhauser; 6; 8; 2014; 66; 10.1186/s13073-014-0066-6; citation_id=CR3
• Nat Commun; Inferring tumour purity and stromal and immune cell admixture from expression data; K Yoshihara; 4; 2013; 2612; 10.1038/ncomms3612; citation_id=CR4
• Nat Struct Mol Biol; Analysis of microRNA-target interactions across diverse cancer types; A Jacobsen; 20; 11; 2013; 1325-1332; 10.1038/nsmb.2678; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (4件)： DNAメチル化 ,  癌 ,  不均一性 ,  分析