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J-GLOBAL ID：202002281084634690   整理番号：20A0824213

統合バイオ情報解析による肝臓癌の候補リスク遺伝子としてのFosの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of FOS as a Candidate Risk Gene for Liver Cancer by Integrated Bioinformatic Analysis

著者 (12件)： Hu Jin-Wu (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China) ,  Hu Jin-Wu (Department of General Surgery, Shanghai Tenth People’s Hospital Affiliated with Tongji University, 301 Yanchang Road,Shanghai 200072, China) ,  Ding Guang-Yu (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China) ,  Fu Pei-Yao (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China) ,  Tang Wei-Guo (Department of General Surgery, Institute of Fudan-Minhang Academic Health System,Minhang Hospital, Fudan University,Shanghai 201199, China) ,  Sun Qi-Man (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China) ,  Zhu Xiao-Dong (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China) ,  Shen Ying-Hao (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China) ,  Zhou Jian (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China) ,  Fan Jia (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China) ,  Sun Hui-Chuan (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China) ,  Huang Cheng (Department of Liver Surgery and Transplantation, Zhongshan Hospital,Fudan University, Key Laboratory of Carcinogenesis and Cancer Invasion (Fudan University),Ministry of Education, Shanghai 200032,China)
資料名： BioMed Research International (Web)  (BioMed Research International (Web))
巻： 2020  ページ： Null  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7008A  ISSN： 2314-6133  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 肝癌は予後不良と関連する致死性疾患である。新規治療法を明らかにする可能性がある肝臓癌に関連する機能的に重要な遺伝子を同定するために,癌ゲノム地図(TCGA)データベースにおける正常試料と比較して,肝臓腫瘍に対するmiRNAとmRNA発現レベルをプロファイル化するための統合解析を行った。著者らは,対照と比較して腫瘍サンプルにおいて405の差別的に発現した遺伝子と233の差別的に発現したmiRNAを同定した。加えて,経路分析を行い,マイトジェン活性化蛋白質キナーゼ(MAPK)とG蛋白質共役受容体(GPCR)経路が,肝臓癌で調節されたトップ有意経路の2つであることを見出した。さらに,これらのシグナル伝達ネットワークを調べることによって,FOS(Fosプロトオンコジーン,AP-1転写因子サブユニット),LAMC2(ラミニンサブユニットγ2),およびCALML3(カルモジュリン様3)が肝臓癌に関与する高い程度の最も有意な遺伝子ノードであることを発見した。FOS,LAMC2,CALML3およびそれらの相互作用miRNAの発現および疾患予測精度を,HCCコホートを用いてさらに実行した。最後に,別のHCCコホートにおけるFOSの予後的意義を検討した。より高いFOS発現を有する患者は,より低い発現を有する患者と比較して,再発(TTR)および全体的生存(OS)に対して有意により短い時間を示した。まとめると,著者らの研究はFOSがこの致死性疾患における新しい治療手段を明らかにする可能性がある肝臓癌の潜在的予後マーカーであることを示す。Copyright 2020 Jin-Wu Hu et al. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： 相互作用 ,  データベース ,  *遺伝子 ,  腫瘍 ,  サブユニット ,  予後 ,  母集団 ,  *肝臓腫瘍 ,  プロトオンコジーン ,  転写因子 ,  MAPキナーゼ ,  AP-1因子
準シソーラス用語： マイクロRNA ,  予後不良 ,  mRNA発現 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (4件)： 分子遺伝学一般  (EC02010J) ,  消化器の腫よう  (GH04000D) ,  腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (28件)：

• J. D. Yang, P. Hainaut, G. J. Gores, A. Amadou, A. Plymoth, L. R. Roberts, "A global view of hepatocellular carcinoma: trends, risk, prevention and management," Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology, vol. 16, no. 10, pp. 589-604, 2019.
• L. Kulik, H. B. El-Serag, "Epidemiology and management of hepatocellular carcinoma," Gastroenterology, vol. 156, no. 2, pp. 477-491, 2019.
• T. Couri, A. Pillai, "Goals and targets for personalized therapy for HCC," Hepatology International, vol. 13, no. 2, pp. 125-137, 2019.
• A. Ally, M. Balasundaram, R. Carlsen et al., "Comprehensive and integrative genomic characterization of hepatocellular carcinoma," Cell, vol. 169, no. 7, pp. 1327-1341, 2017.
• J. Calderaro, G. Couchy, S. Imbeaud et al., "Histological subtypes of hepatocellular carcinoma are related to gene mutations and molecular tumour classification," Journal of Hepatology, vol. 67, no. 4, pp. 727-738, 2017.

タイトルに関連する用語 (6件)： 統合 ,  情報解析 ,  肝臓癌 ,  リスク遺伝子 ,  FoS ,  同定