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J-GLOBAL ID：202002285192382227   整理番号：20A0493670

遺伝子の定量的操作による着色ペトリネットによるパターン形成解析【JST・京大機械翻訳】

Pattern formation analysis by colored Petri nets with quantitative manipulation of a gene

著者 (8件)： Liu Fei (School of Software Engineering, South China University of Technology,Guangzhou,P.R. China,510006) ,  Yamamoto Ena (Yamaguchi University,Department of Biology,Yamaguchi,Japan,753-8512) ,  Shirahama Katsunobu (Graduate School of S&T for Innovation, Yamaguchi University,Yamaguchi,Japan,753-8512) ,  Saitoh Tsubasa (Graduate School of Medicine, Yamaguchi University,Yamaguchi,Japan,753-8512) ,  Aoyama Shuhei (Graduate School of Medicine, Yamaguchi University,Yamaguchi,Japan,753-8512) ,  Harada Yumiko (Graduate School of S&T for Innovation, Yamaguchi University,Yamaguchi,Japan,753-8512) ,  Murakami Ryutaro (Graduate School of S&T for Innovation, Yamaguchi University,Yamaguchi,Japan,753-8512) ,  Matsuno Hiroshi (Graduate School of S&T for Innovation, Yamaguchi University,Yamaguchi,Japan,753-8512)
資料名： IEEE Conference Proceedings  (IEEE Conference Proceedings)
巻： 2019  号： BIBM  ページ： 138-144  発行年： 2019年 
JST資料番号： W2441A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： アメリカ合衆国 (USA)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： 著者らは,遺伝子のレベルを定量的に制御できる新しく考案された生物学的実験と有色ハイブリッドPetriネット(CoIHPNs)を組み合わせることにより,多細胞生物学的事象を解析するためのモデリングとシミュレーションの新しいアプローチを提案した。著者らは,ショウジョウバエの大腸における境界細胞のパターン形成を分析した。そこでは,境界細胞の1細胞領域がDelta-Notchシグナル伝達を通して分化する。デルタのレベルを調節する生物学的実験は,デルタのレベルに対応する境界細胞の6つの異なるパターンをもたらす。すべてのこれらのパターンは,デルタのレベルに関連するパラメータを変えることによってのみ,ColHPNモデリングに基づくシミュレーションによってうまく再現された。シミュレーション中の各細胞におけるNotchの活性型の濃度をモニターすることにより,パターン形成のこれらの明確なモードが活性Notchの変動範囲と相関することを明らかにした。ここで述べた遺伝子活性のシミュレーションと定量的操作の組み合わせは,Notchシグナリングにより調節されるパターン形成過程を分析し理解するための信頼できる強力なアプローチである。Copyright 2020 The Institute of Electrical and Electronics Engineers, Inc. All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： *パターン形成 ,  Notch受容体 ,  ショウジョウバエ ,  シミュレーション ,  *遺伝子 ,  大腸 ,  *Petriネット ,  着色
準シソーラス用語： Notchシグナリング ,  Delta蛋白質 ,  多細胞生物 ,  有彩色 , 【Automatic Indexing@JST】

分類 (2件)： 遺伝子発現  (EC02040Q) ,  分子・遺伝情報処理  (JE15040B)

タイトルに関連する用語 (6件)： 遺伝子 ,  定量 ,  着色 ,  ペトリネット ,  パターン形成 ,  解析