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J-GLOBAL ID：202102226497744615   整理番号：21A0323716

大規模タンパク質データベースに基づくBERTを用いたペプチド結合予測

Prediction of peptide binding using BERT based on a large scale protein database

著者 (8件)： 玉木竜二 (フューチャー) ,  農見俊明 (フューチャー) ,  佐藤尭彰 (フューチャー) ,  井上誠一 (フューチャー) ,  貞光九月 (フューチャー) ,  坂口誠 (ファンペップ) ,  天満昭子 (ファンペップ) ,  中神啓徳 (大阪大 大学院)
資料名： 情報処理学会研究報告(Web)  (IPSJ Technical Report (Web))
巻： 2020  号： BIO-64  ページ： Vol.2020-BIO-64,No.1,1-8, (WEB ONLY)  発行年： 2020年11月30日 
JST資料番号： U0451A  資料種別： 会議録 (C)
記事区分： 原著論文  発行国： 日本 (JPN)  言語： 日本語 (JA)

抄録/ポイント： ワクチン開発において,B細胞エピトープ予測と,MHCIIに対...

シソーラス用語： *データベース ,...
準シソーラス用語： *タンパク質データベース ,...

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分類 (2件)： 分子・遺伝情報処理  (JE15040B) ,  分子構造  (EB03020Y)

引用文献 (35件)：

• Bhattacharya, M., Sharma, A. R., Patra, P., Ghosh, P., Sharma, G., Patra, B. C., Lee, S. S. and Chakraborty, C.: Development of epitope-based peptide vaccine against novel coronavirus 2019 (SARSCOV-2): Immunoinformatics approach, Journal of medical virology, Vol. 92, No. 6, pp. 618-631, (2020).
• Li, W., Joshi, M. D., Singhania, S., Ramsey, K. H. and Murthy, A. K.: Peptide Vaccine: Progress and Challenges, Vaccines, Vol. 2, No. 3, pp. 515-536, (2014).
• Droppa-Almeida, D., Franceschi, E. and Padilha, F. F.: Immune-Informatic Analysis and Design of Peptide Vaccine From Multi-epitopes Against Corynebacterium pseudotuberculosis, Bioinformatics and Biology Insights, Vol. 12, 1177932218755337, (2018).
• Pierce, B. G., Wiehe, K., Hwang, H., Kim, B. H., Vreven, T. and Weng, Z.: ZDOCK server: interactive docking prediction of protein-protein complexes and symmetric multimers, Bioinformatics, Vol. 30, No. 12, pp. 1771-1773, (2014).
• Pierce, B. G., Hourai, Y. and Weng, Z.: Accelerating protein docking in ZDOCK using an advanced 3D convolution library, PLoS One, Vol. 6, No. 9, e24657, (2011).

タイトルに関連する用語 (5件)： 大規模 ,  タンパク質データベース ,  BERT ,  ペプチド結合 ,  予測