文献

J-GLOBAL ID：202102227345972708   整理番号：21A0287512

結腸癌における独立因子としての選択的スプライシングサインの同定【JST・京大機械翻訳】

Identification of an alternative splicing signature as an independent factor in colon cancer

著者 (5件)： Chen Haitao (Department of Orthopedic Surgery, Zhongnan Hospital of Wuhan University, Wuhan, China) ,  Luo Jun (Department of Pathology, Zhongnan Hospital of Wuhan University, Wuhan, China) ,  Luo Jun (Wuhan University Center for Pathology and Molecular Diagnostics, Wuhan, China) ,  Guo Jianchun (Department of Pathology, Zhongnan Hospital of Wuhan University, Wuhan, China) ,  Guo Jianchun (Wuhan University Center for Pathology and Molecular Diagnostics, Wuhan, China)
資料名： BMC Cancer (Web)  (BMC Cancer (Web))
巻： 20  号： 1  ページ： 1-11  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7305A  ISSN： 1471-2407  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： Colon癌は予後不良を伴う一般的な悪性腫瘍である。異常なオルタナティブスプライシング(AS)イベントは,腫瘍の発生および転移に部分的であった。結腸癌における生存関連ASシグネチャを開発することを目的とした。ASイベントのPercent Spliced In値は,Cancer Genome Atlas(TCGA)SpliciceSeqデータベースで利用可能であった。単変量Cox分析を行い,予後関連ASイベントを検出した。生存関連AS事象を考慮した予測モデルを作成し,訓練試験グループ設計でさらに検証した。Kaplan-Meier分析を適用して患者生存を評価した。受信者動作特性(ROC)の曲線下面積(AUC)を,このモデルの予測値を評価するために実行した。一方,署名の臨床的意義とスプライシング因子(SFs)とのその調節関係も評価した。全体で,2132の生存関連AS事象を,結腸癌サンプルから同定した。5年AUC値が0.911である11-ASシグネチャを開発した。一方,5年のAUC値は,試験および全コホートでそれぞれ0.782および0.855であった。多変量Cox回帰は,署名のTカテゴリーとリスクスコアが結腸癌生存の独立危険因子であることを示した。また,11のSFと48のAS事象に基づくSF-ASネットワークを構築した。結腸癌の11-ASシグネチャを同定した。このシグネチャは独立予後因子として治療できた。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： データベース ,  ネットワーク ,  腫瘍 ,  予後 ,  母集団 ,  *結腸腫瘍 ,  *選択的スプライシング ,  血中濃度-時間曲線下面積 ,  危険因子 ,  スプライシング因子 ,  予測モデル
準シソーラス用語： 悪性腫瘍 ,  予後不良 ,  臨床評価 ,  多変量 , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (4件)： 選択的スプライシング ,  署名 ,  予後 ,  Colon癌

分類 (5件)： 腫ようの化学・生化学・病理学  (GE02030N) ,  診断用薬の臨床への応用  (GW20020A) ,  泌尿生殖器の腫よう  (GM04000S) ,  遺伝子発現  (EC02040Q) ,  腫ようの診断  (GE03020J)

引用文献 (42件)：

• Mol Cancer; Secretory RAB GTPase 3C modulates IL6-STAT3 pathway to promote colon cancer metastasis and is associated with poor prognosis; YC Chang, CY Su, MH Chen, WS Chen, CL Chen, M Hsiao; 16; 2017; 135; 10.1186/s12943-017-0687-7; citation_id=CR1
• Mol Oncol; ER stress-related ATF6 upregulates CIP2A and contributes to poor prognosis of colon cancer; CY Liu, CC Hsu, TT Huang, CH Lee, JL Chen, SH Yang; 12; 2018; 1706-1717; 10.1002/1878-0261.12365; citation_id=CR2
• Cancer Immunol Immunother; Immune cell infiltration as a biomarker for the diagnosis and prognosis of stage I-III colon cancer; R Zhou, J Zhang, D Zeng, H Sun, X Rong, M Shi; 68; 2019; 433-442; 10.1007/s00262-018-2289-7; citation_id=CR3
• J Gastroenterol Hepatol; LncRNA-ATB mediated E-cadherin repression promotes the progression of colon cancer and predicts poor prognosis; B Yue, S Qiu, S Zhao, C Liu, D Zhang, F Yu; 31; 2016; 595-603; 10.1111/jgh.13206; citation_id=CR4
• Cancer; Annual report to the nation on the status of cancer, 1975-2006, featuring colorectal cancer trends and impact of interventions (risk factors, screening, and treatment) to reduce future rates; BK Edwards, E Ward, BA Kohler, C Eheman, AG Zauber, RN Anderson; 116; 2010; 544-573; 10.1002/cncr.24760; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (5件)： 結腸癌 ,  因子 ,  選択的スプライシング ,  サイン ,  同定