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J-GLOBAL ID：202102262686572592   整理番号：21A0017779

非生物的ストレスに関与するクルミ熱ストレス転写因子のゲノムワイド同定と転写産物プロファイル【JST・京大機械翻訳】

Genome-wide identification and transcript profiles of walnut heat stress transcription factor involved in abiotic stress

著者 (6件)： Liu Xuejiao (Laboratory of Walnut Research Center, College of Forestry, Northwest A & F University, Yangling, China) ,  Meng Panpan (Laboratory of Walnut Research Center, College of Forestry, Northwest A & F University, Yangling, China) ,  Yang Guiyan (Laboratory of Walnut Research Center, College of Forestry, Northwest A & F University, Yangling, China) ,  Zhang Mengyan (Laboratory of Walnut Research Center, College of Forestry, Northwest A & F University, Yangling, China) ,  Peng Shaobing (Laboratory of Walnut Research Center, College of Forestry, Northwest A & F University, Yangling, China) ,  Zhai Mei Zhi (Laboratory of Walnut Research Center, College of Forestry, Northwest A & F University, Yangling, China)
資料名： BMC Genomics (Web)  (BMC Genomics (Web))
巻： 21  号： 1  ページ： 1-13  発行年： 2020年 
JST資料番号： U7048A  ISSN： 1471-2164  資料種別： 逐次刊行物 (A)
記事区分： 原著論文  発行国： イギリス (GBR)  言語： 英語 (EN)

抄録/ポイント： クルミ(Juglans regia)は世界中で栽培されている重要な樹木であり,それらのライフサイクルの間,一連の非生物的および生物的ストレスに曝露されている。熱ストレス転写因子(HSF)は,ストレス応答遺伝子の発現を調節することにより,種々のストレスに対する植物応答において重要な役割を果たす。HSF遺伝子はHSFA,HSFB,HSFCの3クラスに分類される。HSFA遺伝子は転写活性化機能を有し,高温誘導遺伝子発現の主要な調節因子である。HSFB遺伝子は,干ばつとNaClに対する植物耐性を負に調節する。そして,HSFC遺伝子は種々のストレスに対する植物応答に関与する可能性がある。草本植物におけるHSFファミリーについての報告があるが,クルミにおけるHSFsに関する報告はない。本研究では,クルミの完全なゲノム配列決定に基づいて,バイオインフォマティクス法を使用し,29のHSF遺伝子を同定した。これらのHSFは18のHSFA,9つのHSFBおよび2つのHSFC遺伝子をカバーした。Arabidopsis thalianaのそれらと共にこれらのHSF蛋白質の系統発生解析は,2種のHSFsが互いに密接に関連し,異なる進化過程を持つことを示した。HSF遺伝子ファミリーの保存モチーフの分布と配列分析は,クルミHSFsのメンバーが高度に保存されていることを示した。定量的リアルタイムPCR(qRT-PCR)分析は,大部分のクルミHSFsが,高温(HT),高塩分および干ばつストレスの下で,「QQingxiang’および「Xiangling’のクルミ品種で発現し,いくつかのJrHSF発現パターンが2つの品種の間で異なることを明らかにした。クルミ由来の複雑なHSF遺伝子ファミリーをゲノムワイド同定,進化探索,配列特性化および発現分析により確認した。本研究は,植物ストレス応答におけるHSF遺伝子の機能および分子機構に関する将来の研究に有用な情報を提供する。Copyright 2021 The Author(s) All rights reserved. Translated from English into Japanese by JST.【JST・京大機械翻訳】

シソーラス用語： ライフサイクル ,  遺伝子 ,  *クルミ ,  タンパク質 ,  干ばつ ,  系統発生 ,  品種 ,  遺伝子発現 ,  *転写因子 ,  *暑熱ストレス ,  Arabidopsis thaliana
準シソーラス用語： バイオインフォマティクス ,  ストレス応答 ,  *転写産物 ,  *非生物的ストレス , 【Automatic Indexing@JST】

著者キーワード (5件)： 熱ストレス転写因子(HSF) ,  多重アラインメント ,  系統発生解析 ,  モチーフ分布 ,  表現プロファイル

分類 (1件)： 遺伝子発現  (EC02040Q)

引用文献 (54件)：

• Plant J; The walnut (Juglans regia) genome sequence reveals diversity in genes coding for the biosynthesis of non-structural polyphenols; PJ Martínez-García, MW Crepeau, D Puiu, D Gonzalez-Ibeas, J Whalen, KA Stevens, R Paul, TS Butterfield, MT Britton, RL Reagan, S Chakraborty, SL Walawage, HA Vasquez-Gross, C Cardeno, RA Famula, K Pratt, S Kuruganti, MK Aradhya, CA Leslie, AM Dandekar, SL Salzberg, JL Wegrzyn, CH Langley, DB Neale; 87; 5; 2016; 507-532; citation_id=CR1
• J Changjiang Vegetables; Research progress on molecular mechanism of plant heat tolerance; GH Ju, LJ Cui, S Zhang, ZY Qian, JX Pan, GY Kai; 24; 2012; 5-11; citation_id=CR2
• Mol Plant Breed; Effects of exogenous nitrogen on physiological characteristics of walnut seedlings under drought stress; H Xie, P Chong, Y Li, J Zhan, P Zhou; 17; 18; 2019; 6152-6160; citation_id=CR3
• Plant Cell Physiol; Genome-wide analyses of early translational responses to elevated temperature and high salinity in Arabidopsis thaliana; H Matsuura, Y Ishibashi, A Shinmyo, S Kanaya, K Kato; 51; 3; 2010; 448-462; citation_id=CR4
• BMC Genomics; Genome-wide identification and abiotic stress-responsive pattern of heat shock transcription factor family in Triticum aestivum L; S Duan, B Liu, Y Zhang, G Li, X Guo; 20; 1; 2019; 220-257; citation_id=CR5

タイトルに関連する用語 (8件)： 非生物的ストレス ,  クルミ ,  熱ストレス ,  転写因子 ,  ゲノム ,  同定 ,  転写産物 ,  プロファイル